MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium ulcerans Agy99 chromosome

Total Repeats: 37355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008611	A	6	6	1561	1566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008611	TC	3	6	1569	1574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008611	ACG	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008611	GT	4	8	1604	1611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008611	CA	3	6	1701	1706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008611	TTA	2	6	1785	1790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008611	GAT	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008611	GAA	2	6	1824	1829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008611	TCGCA	2	10	1858	1867	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008611	GTC	2	6	1886	1891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008611	CGG	2	6	2010	2015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008611	GGA	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008611	CTG	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008611	TACA	2	8	9929	9936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008611	TCC	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008611	TGC	2	6	11025	11030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008611	CTG	2	6	11040	11045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008611	AGC	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008611	CCGGAT	2	12	11099	11110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008611	ACG	2	6	11142	11147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008611	ATC	2	6	11225	11230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008611	GC	3	6	11304	11309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008611	CGT	2	6	13045	13050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008611	GGC	2	6	13055	13060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008611	GCC	2	6	13529	13534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008611	CCA	2	6	13604	13609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008611	CAA	2	6	15131	15136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008611	GCA	2	6	15173	15178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008611	GGC	2	6	15235	15240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008611	CCCAC	2	10	24858	24867	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_008611	CGG	2	6	24907	24912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008611	TGT	2	6	26574	26579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008611	CGG	2	6	26753	26758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008611	GT	3	6	26821	26826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008611	CGC	2	6	28187	28192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008611	CAGA	2	8	28206	28213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008611	CTA	2	6	28261	28266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008611	TCC	2	6	28278	28283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008611	GTT	2	6	28285	28290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008611	AGCG	2	8	28376	28383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008611	GCG	2	6	28458	28463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008611	TGGG	2	8	28472	28479	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008611	GTC	3	9	28484	28492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008611	TGCC	2	8	28529	28536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008611	GTT	2	6	28555	28560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008611	CGC	2	6	28564	28569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008611	GAAA	2	8	29402	29409	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008611	GT	3	6	29424	29429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008611	GCGGTC	2	12	29475	29486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008611	GC	3	6	30175	30180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008611	GCC	2	6	30216	30221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008611	CAG	2	6	30289	30294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008611	GGT	2	6	30305	30310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008611	CGA	2	6	30319	30324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008611	C	6	6	30372	30377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_008611	CGC	2	6	30381	30386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008611	AGC	2	6	31223	31228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008611	GCA	2	6	31236	31241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008611	TTG	2	6	31277	31282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008611	GAA	2	6	31414	31419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008611	GTC	2	6	31426	31431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008611	GGT	2	6	31471	31476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008611	GAC	2	6	31522	31527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008611	GTG	2	6	31541	31546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008611	GCA	2	6	31584	31589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008611	GTT	2	6	31732	31737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008611	CGG	2	6	31747	31752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008611	CGG	2	6	31778	31783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008611	TGC	2	6	31801	31806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008611	TCGCC	2	10	31880	31889	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_008611	CCG	2	6	31902	31907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008611	GCT	2	6	31997	32002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008611	GCACC	2	10	32084	32093	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_008611	CCA	2	6	32120	32125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008611	CG	4	8	32167	32174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008611	CGT	2	6	32944	32949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008611	GCC	2	6	32974	32979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008611	GCG	2	6	34980	34985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008611	GGGA	2	8	35014	35021	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008611	AT	3	6	35134	35139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008611	ATTC	2	8	35146	35153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008611	GTGA	2	8	35154	35161	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008611	TCCGGA	2	12	35603	35614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008611	CAAT	2	8	35635	35642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008611	GCG	2	6	36670	36675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008611	CCG	2	6	36693	36698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008611	GCT	2	6	36738	36743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008611	GCG	2	6	39307	39312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008611	CAG	2	6	39313	39318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008611	TCG	2	6	39366	39371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008611	GCC	2	6	39422	39427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008611	ACG	2	6	39445	39450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008611	TA	3	6	39969	39974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008611	AGGTG	2	10	42045	42054	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008611	CGG	2	6	43366	43371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008611	GAG	2	6	43389	43394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008611	TGC	3	9	44143	44151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008611	TCG	2	6	44192	44197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008611	CCGA	2	8	45362	45369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008611	CGG	2	6	45810	45815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008611	CAC	2	6	45833	45838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008611	CAT	2	6	45850	45855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008611	TGG	2	6	45878	45883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008611	CAC	2	6	46076	46081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008611	CGA	2	6	46093	46098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008611	GCG	2	6	46110	46115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008611	CAA	2	6	48301	48306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008611	TGA	2	6	48345	48350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008611	GTG	2	6	48364	48369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008611	ATG	2	6	48378	48383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008611	CAG	2	6	49980	49985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008611	C	7	7	50437	50443	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_008611	GCG	2	6	51626	51631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008611	GGC	3	9	51664	51672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008611	GCAAC	2	10	51719	51728	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_008611	CCGTGG	2	12	51739	51750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008611	GCC	2	6	51773	51778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008611	GC	3	6	56061	56066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008611	GCT	2	6	56078	56083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008611	ACC	2	6	56101	56106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008611	GAGC	2	8	56143	56150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008611	CG	3	6	56299	56304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008611	TGC	2	6	56320	56325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008611	C	8	8	56325	56332	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_008611	CTT	2	6	56410	56415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008611	TGCGG	2	10	56470	56479	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_008611	AGC	2	6	56610	56615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008611	CGGA	2	8	56632	56639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008611	CCG	2	6	56647	56652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008611	GGT	2	6	56654	56659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008611	GCA	2	6	56689	56694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008611	GCC	2	6	56702	56707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_008611	GCC	2	6	56730	56735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008611	TGG	2	6	56790	56795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008611	GAC	2	6	56800	56805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008611	G	10	10	56809	56818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008611	TCC	2	6	56819	56824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008611	GGC	3	9	56832	56840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008611	GCG	2	6	56928	56933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008611	ATTG	2	8	57045	57052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008611	GCA	2	6	57063	57068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008611	CAC	3	9	57088	57096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008611	ATT	2	6	57244	57249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008611	GTT	2	6	57250	57255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008611	GAT	2	6	57300	57305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008611	CAC	2	6	57306	57311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_008611	GGCC	2	8	57348	57355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008611	CAGC	2	8	57360	57367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008611	GAT	2	6	57417	57422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008611	AAC	2	6	57469	57474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008611	GAA	2	6	57507	57512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008611	CGGC	2	8	57548	57555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008611	GCG	2	6	57613	57618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008611	CGG	2	6	57645	57650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_008611	CGC	2	6	57831	57836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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161	NC_008611	CAC	2	6	58038	58043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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178	NC_008611	GCGG	2	8	58608	58615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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180	NC_008611	TCG	2	6	59396	59401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_008611	AAG	2	6	76323	76328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_008611	CTGG	2	8	76414	76421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
280	NC_008611	TCGG	2	8	76451	76458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
281	NC_008611	TTCA	2	8	76514	76521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
282	NC_008611	CTGG	2	8	76591	76598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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284	NC_008611	GC	3	6	76610	76615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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