MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 11468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007796	CCT	2	6	1213705	1213710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_007796	GAA	2	6	1213719	1213724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_007796	AAT	2	6	1213763	1213768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_007796	CCT	2	6	1223302	1223307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_007796	A	6	6	1223342	1223347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_007796	TGA	2	6	1223366	1223371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_007796	AGG	2	6	1223376	1223381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_007796	AAC	2	6	1223382	1223387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_007796	GAG	2	6	1223418	1223423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_007796	ACA	2	6	1223441	1223446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_007796	GTTC	2	8	1223740	1223747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_007796	AG	3	6	1223759	1223764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_007796	GAA	2	6	1228541	1228546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_007796	GATT	2	8	1228555	1228562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_007796	GTATT	2	10	1228573	1228582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_007796	ATT	2	6	1228592	1228597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_007796	CA	3	6	1228610	1228615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_007796	ATTT	2	8	1228629	1228636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_007796	AT	3	6	1228639	1228644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_007796	TAT	3	9	1228642	1228650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_007796	CAA	3	9	1228713	1228721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_007796	ATAA	2	8	1228741	1228748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_007796	GA	3	6	1228876	1228881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_007796	TTTA	2	8	1228921	1228928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_007796	TAT	2	6	1229011	1229016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_007796	AT	3	6	1229048	1229053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4028	NC_007796	TCTA	2	8	1229089	1229096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_007796	T	6	6	1229111	1229116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_007796	CTT	2	6	1229121	1229126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_007796	CATT	2	8	1229190	1229197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_007796	CAC	2	6	1229278	1229283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_007796	A	8	8	1229317	1229324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_007796	CGG	2	6	1229736	1229741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_007796	TCA	2	6	1229754	1229759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4037	NC_007796	A	7	7	1230366	1230372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_007796	GGGA	2	8	1230373	1230380	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_007796	TA	4	8	1230938	1230945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_007796	ATTC	2	8	1230949	1230956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_007796	T	6	6	1230958	1230963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_007796	ACCC	2	8	1235115	1235122	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4043	NC_007796	GAA	2	6	1235142	1235147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_007796	GTAG	2	8	1235150	1235157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_007796	AAT	2	6	1235174	1235179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4048	NC_007796	TCT	2	6	1235250	1235255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_007796	TTC	3	9	1235285	1235293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_007796	GCAT	2	8	1235413	1235420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_007796	AT	3	6	1235464	1235469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_007796	TTG	2	6	1235519	1235524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_007796	GA	3	6	1235550	1235555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_007796	TCC	2	6	1235570	1235575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_007796	TCAT	2	8	1235621	1235628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_007796	TAT	2	6	1235681	1235686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_007796	TAT	2	6	1236944	1236949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_007796	TACA	2	8	1236967	1236974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_007796	TCC	2	6	1236980	1236985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_007796	TGA	2	6	1237005	1237010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_007796	CCGC	2	8	1237024	1237031	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4062	NC_007796	TTAA	2	8	1237921	1237928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_007796	ATAA	2	8	1237939	1237946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_007796	GCA	2	6	1238195	1238200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4066	NC_007796	AT	3	6	1238333	1238338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_007796	CCG	2	6	1238367	1238372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_007796	TAT	2	6	1238401	1238406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_007796	CAT	2	6	1238419	1238424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_007796	TAC	2	6	1238440	1238445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_007796	ATTT	2	8	1240237	1240244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_007796	TGT	2	6	1240299	1240304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_007796	GTG	2	6	1240307	1240312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_007796	GAT	3	9	1240350	1240358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4076	NC_007796	TGG	2	6	1240435	1240440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_007796	TTG	2	6	1240476	1240481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4081	NC_007796	TACA	2	8	1240556	1240563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4082	NC_007796	TGA	2	6	1240609	1240614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_007796	ATGG	2	8	1240634	1240641	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_007796	CAT	3	9	1240659	1240667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_007796	A	7	7	1240675	1240681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_007796	T	6	6	1240694	1240699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_007796	A	6	6	1240736	1240741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_007796	T	6	6	1240749	1240754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_007796	TCA	2	6	1244456	1244461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_007796	CTG	2	6	1245897	1245902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_007796	ACCCT	2	10	1246385	1246394	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4095	NC_007796	ATT	2	6	1246443	1246448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_007796	A	6	6	1248935	1248940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_007796	GACA	2	8	1251570	1251577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_007796	AGA	2	6	1254003	1254008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_007796	GTAC	2	8	1255596	1255603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_007796	TCTT	2	8	1255630	1255637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_007796	GT	3	6	1255687	1255692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4105	NC_007796	ATT	2	6	1255781	1255786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_007796	GA	3	6	1255856	1255861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_007796	T	7	7	1255887	1255893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_007796	T	6	6	1258154	1258159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4111	NC_007796	TGA	2	6	1258307	1258312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_007796	TTA	2	6	1258658	1258663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_007796	TC	3	6	1259738	1259743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_007796	TCT	2	6	1259784	1259789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4116	NC_007796	ATT	2	6	1265596	1265601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_007796	TG	3	6	1265631	1265636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_007796	TAT	2	6	1265669	1265674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_007796	AGG	2	6	1265763	1265768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_007796	T	7	7	1265830	1265836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_007796	CATA	2	8	1265871	1265878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_007796	TTAAT	2	10	1267629	1267638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4124	NC_007796	TCT	2	6	1267674	1267679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_007796	T	8	8	1267692	1267699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_007796	GCA	2	6	1267772	1267777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4128	NC_007796	A	6	6	1268395	1268400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_007796	AATG	2	8	1271734	1271741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_007796	TG	3	6	1271740	1271745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_007796	CTC	2	6	1273211	1273216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4132	NC_007796	TTA	2	6	1276982	1276987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_007796	TGAAC	2	10	1277027	1277036	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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