MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosarcina barkeri str. fusaro plasmid 1

Total Repeats: 394

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007349	AG	3	6	28	33	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007349	A	6	6	53	58	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007349	TC	3	6	90	95	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007349	TGC	2	6	100	105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007349	TCTG	2	8	120	127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007349	T	7	7	409	415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007349	TA	3	6	456	461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007349	ATT	2	6	470	475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007349	TTTTTA	2	12	507	518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007349	TA	3	6	534	539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007349	ATT	3	9	633	641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007349	TAT	2	6	651	656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007349	TTC	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007349	AAT	2	6	677	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007349	ATT	2	6	700	705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007349	AAG	2	6	741	746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007349	T	6	6	1316	1321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007349	A	6	6	1322	1327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007349	TA	3	6	1459	1464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007349	T	7	7	1481	1487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007349	T	6	6	1511	1516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007349	ATTT	2	8	1518	1525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007349	T	6	6	1666	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007349	GAAT	2	8	1880	1887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007349	AAAT	2	8	1917	1924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007349	T	6	6	1938	1943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007349	T	6	6	1972	1977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007349	TTAA	2	8	2012	2019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007349	GGA	2	6	2986	2991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007349	AAG	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007349	ATTA	2	8	3050	3057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007349	ATGTA	2	10	3083	3092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007349	GA	3	6	3118	3123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007349	ATT	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007349	A	6	6	3225	3230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007349	TATAA	2	10	3250	3259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007349	A	6	6	3258	3263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007349	TTTAA	2	10	3312	3321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007349	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007349	TAA	2	6	3339	3344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007349	AAAG	2	8	3364	3371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007349	ATT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007349	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007349	TAT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007349	AT	3	6	3442	3447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007349	TAA	2	6	3455	3460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007349	AATA	2	8	3461	3468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007349	AAC	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007349	TATT	2	8	3516	3523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007349	TGT	2	6	3528	3533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007349	TTA	2	6	3593	3598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007349	AAT	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007349	GAT	2	6	3802	3807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007349	A	6	6	3822	3827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007349	ACTT	2	8	3906	3913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007349	AT	4	8	4020	4027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007349	CA	3	6	4056	4061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007349	TA	3	6	4084	4089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007349	TACA	2	8	4100	4107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007349	TCAA	2	8	4110	4117	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007349	AAGT	2	8	4158	4165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007349	AT	3	6	4184	4189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007349	CTT	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007349	A	6	6	4264	4269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007349	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007349	AAG	2	6	4337	4342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007349	TTC	3	9	6031	6039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007349	T	6	6	6054	6059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007349	ATT	3	9	6089	6097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007349	CTT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007349	T	6	6	6144	6149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007349	ATA	2	6	6158	6163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007349	AT	3	6	6175	6180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007349	ATCT	2	8	6215	6222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007349	AAT	2	6	6252	6257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007349	GGGC	2	8	6292	6299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007349	TCGAG	2	10	6313	6322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007349	TAA	2	6	6326	6331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007349	ACA	2	6	6386	6391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007349	TCAAAA	2	12	6454	6465	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_007349	GATT	2	8	6473	6480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007349	TCG	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007349	ACG	2	6	6613	6618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007349	TCA	2	6	6628	6633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007349	A	6	6	6633	6638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007349	TTC	2	6	6715	6720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007349	G	6	6	6733	6738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007349	AGC	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007349	CAAT	2	8	7885	7892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_007349	TAAAT	2	10	7899	7908	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007349	CAA	2	6	10303	10308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007349	CTTT	2	8	10320	10327	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007349	TTC	2	6	10334	10339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007349	TGA	2	6	10362	10367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007349	A	6	6	10444	10449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007349	TAA	2	6	10556	10561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007349	TAA	2	6	10572	10577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007349	TGCC	2	8	11819	11826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007349	CGG	2	6	11842	11847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007349	CTT	2	6	11912	11917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007349	AAT	2	6	11923	11928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007349	AAG	2	6	11944	11949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007349	CTA	2	6	12000	12005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007349	TCC	2	6	12245	12250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007349	GTA	2	6	13416	13421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007349	AT	3	6	13434	13439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007349	TTTG	2	8	13510	13517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007349	GAA	2	6	13552	13557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007349	TAT	2	6	13747	13752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007349	TA	3	6	13831	13836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007349	ATC	2	6	13913	13918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007349	CTT	2	6	13948	13953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007349	TA	3	6	14038	14043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007349	ATTTT	2	10	14062	14071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007349	AAT	2	6	14083	14088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007349	AATT	2	8	14123	14130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007349	AAT	2	6	14210	14215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007349	TCT	2	6	14236	14241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007349	AT	3	6	14272	14277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007349	A	6	6	14314	14319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007349	AAT	2	6	14337	14342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007349	AT	3	6	14350	14355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007349	AT	3	6	14426	14431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007349	A	6	6	14436	14441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007349	ATT	2	6	14490	14495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007349	CTA	2	6	15433	15438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007349	ATA	2	6	15447	15452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007349	AACAA	2	10	15471	15480	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007349	CTA	2	6	15559	15564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007349	TAA	2	6	15582	15587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007349	TC	3	6	15608	15613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007349	CTC	2	6	15618	15623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_007349	T	6	6	21152	21157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007349	CTG	2	6	21183	21188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007349	AAG	2	6	21241	21246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007349	AGTGAC	2	12	21263	21274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_007349	TAAT	2	8	21299	21306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007349	TGT	2	6	21310	21315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007349	TAA	2	6	21338	21343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007349	TA	4	8	21344	21351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007349	TA	3	6	21382	21387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007349	A	7	7	21397	21403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007349	TA	3	6	21404	21409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007349	TAT	2	6	21413	21418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007349	AATT	2	8	21463	21470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007349	CATA	2	8	21501	21508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007349	ATA	2	6	21521	21526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007349	TAGA	2	8	21527	21534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007349	CTT	2	6	21611	21616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_007349	TCC	2	6	21624	21629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_007349	ATT	2	6	22883	22888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007349	GAA	2	6	22931	22936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007349	CTT	2	6	23275	23280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_007349	ACC	2	6	23288	23293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.