MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG1 chromosome

Total Repeats: 7383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005364	TTA	2	6	1465	1470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005364	TAA	2	6	1501	1506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005364	TAGAAA	3	18	1509	1526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005364	TAGTAA	2	12	1527	1538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005364	TA	3	6	1539	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005364	ATT	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005364	ATTTTT	2	12	2742	2753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005364	AAAT	2	8	2755	2762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005364	TA	3	6	4103	4108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005364	ATA	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005364	TAA	3	9	5257	5265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005364	TAA	2	6	5290	5295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005364	A	6	6	5299	5304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005364	GTATT	2	10	5308	5317	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005364	TTG	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005364	AT	3	6	5332	5337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005364	AT	3	6	5341	5346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005364	ATAA	2	8	5355	5362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005364	ATTAT	2	10	5550	5559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005364	TAT	2	6	5575	5580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005364	A	7	7	10040	10046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005364	T	6	6	10060	10065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005364	ATT	2	6	10066	10071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005364	TAA	2	6	16888	16893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005364	AT	3	6	16903	16908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005364	TTAAAT	2	12	16909	16920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005364	A	7	7	16921	16927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005364	T	8	8	16940	16947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005364	T	6	6	16976	16981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005364	T	7	7	17004	17010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005364	A	7	7	17050	17056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005364	TAT	2	6	18627	18632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005364	T	6	6	18646	18651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005364	AT	3	6	18652	18657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005364	TA	3	6	18661	18666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005364	AT	3	6	18683	18688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005364	GTAA	2	8	18690	18697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005364	T	7	7	18725	18731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005364	T	6	6	18791	18796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005364	TA	3	6	20459	20464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005364	GA	3	6	20478	20483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005364	TA	3	6	22092	22097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005364	A	7	7	22104	22110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005364	C	7	7	22117	22123	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_005364	GA	3	6	23599	23604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005364	T	7	7	23616	23622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005364	TTA	3	9	25436	25444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005364	ATT	2	6	28271	28276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005364	A	6	6	28282	28287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005364	GCT	2	6	28299	28304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_005364	TAT	2	6	28315	28320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005364	TATAT	2	10	28324	28333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005364	TAT	2	6	28337	28342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005364	TAT	2	6	28399	28404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005364	CTTC	2	8	28409	28416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005364	TAT	2	6	28417	28422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005364	AT	3	6	28427	28432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005364	A	6	6	28433	28438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005364	TTA	2	6	29298	29303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005364	CTT	2	6	29307	29312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_005364	ACCT	2	8	29830	29837	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_005364	ATTA	2	8	29839	29846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005364	TAT	2	6	29889	29894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005364	AT	3	6	29902	29907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005364	TAT	2	6	29931	29936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005364	AAC	2	6	29990	29995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_005364	A	6	6	30001	30006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005364	TTA	2	6	30088	30093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005364	TTA	2	6	30115	30120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005364	A	6	6	30128	30133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005364	T	6	6	30151	30156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005364	TAT	2	6	30163	30168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005364	ATT	2	6	31295	31300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005364	CCT	2	6	31301	31306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_005364	TA	3	6	31367	31372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005364	A	6	6	31372	31377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005364	ATA	2	6	31379	31384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005364	AAT	2	6	31429	31434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005364	A	6	6	31448	31453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005364	TAAT	2	8	31475	31482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005364	TAT	2	6	31483	31488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005364	ATT	2	6	31722	31727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005364	T	6	6	31755	31760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005364	AAT	2	6	31761	31766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005364	ATA	2	6	31785	31790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005364	TAA	2	6	31802	31807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005364	AGAA	2	8	31818	31825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005364	TAA	2	6	31833	31838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005364	TAAC	2	8	31840	31847	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_005364	AGG	2	6	31879	31884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005364	A	6	6	32495	32500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005364	GGT	2	6	32513	32518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005364	AAT	2	6	33582	33587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005364	CTAA	2	8	34488	34495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_005364	TA	3	6	34527	34532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005364	TTA	2	6	34540	34545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005364	TA	3	6	34562	34567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005364	AT	4	8	34599	34606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005364	TAT	2	6	34658	34663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005364	TAAA	2	8	34668	34675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005364	A	6	6	37861	37866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005364	TAT	3	9	37895	37903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005364	ATTAT	3	15	37899	37913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005364	TAA	2	6	37954	37959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005364	AAG	2	6	37972	37977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005364	T	6	6	43404	43409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005364	TAT	2	6	43413	43418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005364	A	7	7	43421	43427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005364	A	7	7	43448	43454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005364	TAG	2	6	43517	43522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005364	T	6	6	43528	43533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005364	TTTTA	2	10	43547	43556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005364	ATT	2	6	43575	43580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005364	AGA	2	6	43590	43595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005364	TAA	2	6	43617	43622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005364	AAATTT	2	12	43623	43634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005364	TA	3	6	43642	43647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005364	ATG	2	6	43682	43687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005364	TTA	2	6	43722	43727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005364	TTA	2	6	43755	43760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005364	TAAA	2	8	43789	43796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005364	T	6	6	45976	45981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005364	T	7	7	46012	46018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005364	TTA	2	6	46058	46063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005364	A	6	6	46073	46078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005364	T	6	6	46113	46118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005364	T	6	6	46146	46151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005364	TTA	2	6	46203	46208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005364	AAT	2	6	46222	46227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005364	AAG	2	6	46279	46284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005364	T	6	6	47603	47608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005364	ATTA	2	8	47615	47622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005364	TAT	2	6	47630	47635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005364	CTT	2	6	47636	47641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_005364	CAT	2	6	47645	47650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_005364	AAT	2	6	47664	47669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005364	T	6	6	47720	47725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005364	A	7	7	47728	47734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005364	TAT	2	6	47742	47747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005364	ATA	2	6	47769	47774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005364	ACATT	2	10	49454	49463	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_005364	A	6	6	49466	49471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005364	A	7	7	49542	49548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005364	T	6	6	49570	49575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005364	ATA	2	6	51556	51561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005364	ATAA	2	8	51584	51591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005364	TTA	2	6	51635	51640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005364	GAA	2	6	51665	51670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005364	T	7	7	51740	51746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005364	GTG	2	6	51750	51755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005364	AGAA	2	8	52146	52153	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_005364	A	6	6	91020	91025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_005364	TAA	2	6	91027	91032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_005364	T	7	7	91043	91049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_005364	ATT	2	6	98023	98028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_005364	TTTA	2	8	98042	98049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_005364	ATTT	2	8	98062	98069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_005364	AT	3	6	98166	98171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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