MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 33561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_003552	CTCG	2	8	3306273	3306280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19002	NC_003552	ATT	2	6	3306284	3306289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19003	NC_003552	A	6	6	3306322	3306327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19004	NC_003552	GAC	2	6	3306383	3306388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_003552	GTAA	2	8	3306406	3306413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_003552	GA	4	8	3306477	3306484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_003552	GAA	2	6	3306578	3306583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_003552	TCG	2	6	3306599	3306604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19009	NC_003552	CATC	2	8	3306676	3306683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19010	NC_003552	AAT	2	6	3306795	3306800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_003552	ACT	2	6	3306835	3306840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_003552	ATT	2	6	3306857	3306862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_003552	TTAT	3	12	3306881	3306892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_003552	ATA	2	6	3306897	3306902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_003552	AAT	2	6	3306913	3306918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_003552	T	6	6	3306972	3306977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_003552	TA	3	6	3307041	3307046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19018	NC_003552	GAA	2	6	3307082	3307087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19019	NC_003552	A	6	6	3307130	3307135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_003552	TA	3	6	3307164	3307169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_003552	T	7	7	3307179	3307185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_003552	AGGA	2	8	3307218	3307225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19023	NC_003552	GCA	2	6	3307272	3307277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19024	NC_003552	CAA	2	6	3308559	3308564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19025	NC_003552	CCT	2	6	3308632	3308637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19026	NC_003552	A	6	6	3308645	3308650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19027	NC_003552	A	6	6	3310325	3310330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19028	NC_003552	A	6	6	3310344	3310349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_003552	ATTCT	2	10	3310410	3310419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19030	NC_003552	CTG	2	6	3310446	3310451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19031	NC_003552	TAAT	2	8	3310468	3310475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_003552	TGT	2	6	3310511	3310516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_003552	ATT	2	6	3310534	3310539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19034	NC_003552	ATAAA	2	10	3310622	3310631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_003552	TTA	2	6	3310692	3310697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_003552	GTA	2	6	3310737	3310742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_003552	GTT	2	6	3310769	3310774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_003552	AGC	2	6	3310783	3310788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19039	NC_003552	T	6	6	3310801	3310806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_003552	TAC	2	6	3310861	3310866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19041	NC_003552	AGG	2	6	3310881	3310886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19042	NC_003552	A	6	6	3310927	3310932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19043	NC_003552	GAT	2	6	3310958	3310963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_003552	ACA	2	6	3311192	3311197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19045	NC_003552	TCC	2	6	3311261	3311266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19046	NC_003552	AATA	2	8	3311321	3311328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19047	NC_003552	GCT	2	6	3311387	3311392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19048	NC_003552	CA	3	6	3311405	3311410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19049	NC_003552	CTTT	2	8	3311434	3311441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19050	NC_003552	ATCC	2	8	3313069	3313076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19051	NC_003552	GAA	2	6	3313077	3313082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19052	NC_003552	TA	3	6	3313102	3313107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19053	NC_003552	AAT	3	9	3313133	3313141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_003552	AGC	2	6	3313155	3313160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19055	NC_003552	GCA	2	6	3313235	3313240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19056	NC_003552	T	6	6	3313288	3313293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19057	NC_003552	ATA	2	6	3313332	3313337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_003552	A	6	6	3313362	3313367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19059	NC_003552	GGA	2	6	3313495	3313500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_003552	CTT	2	6	3313685	3313690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19061	NC_003552	ATT	2	6	3313700	3313705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_003552	ACT	2	6	3313719	3313724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19063	NC_003552	AATT	2	8	3313788	3313795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19064	NC_003552	ATA	2	6	3313829	3313834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19065	NC_003552	AAG	2	6	3313867	3313872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19066	NC_003552	T	6	6	3313889	3313894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19067	NC_003552	GA	3	6	3313900	3313905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_003552	GCAAG	2	10	3313941	3313950	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19069	NC_003552	GCAAG	2	10	3313967	3313976	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19070	NC_003552	AAG	2	6	3313988	3313993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19071	NC_003552	T	6	6	3313998	3314003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19072	NC_003552	CAAG	2	8	3316814	3316821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19073	NC_003552	ATC	2	6	3316862	3316867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19074	NC_003552	ATTT	2	8	3316974	3316981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19075	NC_003552	TGC	2	6	3317023	3317028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19076	NC_003552	CTG	2	6	3317160	3317165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19077	NC_003552	ATA	2	6	3317173	3317178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19078	NC_003552	A	6	6	3317213	3317218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19079	NC_003552	AG	4	8	3317255	3317262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19080	NC_003552	T	6	6	3317283	3317288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19081	NC_003552	AGTGGA	2	12	3317411	3317422	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19082	NC_003552	GA	3	6	3317421	3317426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19083	NC_003552	ATC	2	6	3317465	3317470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19084	NC_003552	TTATC	2	10	3317479	3317488	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19085	NC_003552	TCT	2	6	3317506	3317511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19086	NC_003552	GATTT	2	10	3317512	3317521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19087	NC_003552	TGT	2	6	3317525	3317530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19088	NC_003552	CCT	2	6	3317539	3317544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19089	NC_003552	CTA	2	6	3317572	3317577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19090	NC_003552	CTG	2	6	3317662	3317667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19091	NC_003552	GAT	2	6	3317845	3317850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19092	NC_003552	CAT	2	6	3317854	3317859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19093	NC_003552	CCA	2	6	3317958	3317963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19094	NC_003552	AAG	2	6	3318081	3318086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19095	NC_003552	TTG	2	6	3318096	3318101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19096	NC_003552	AT	3	6	3318103	3318108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19097	NC_003552	TGT	2	6	3318109	3318114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19098	NC_003552	GTTC	2	8	3318122	3318129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19099	NC_003552	TTA	2	6	3318195	3318200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19100	NC_003552	CTA	2	6	3318205	3318210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19101	NC_003552	ATT	2	6	3318212	3318217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19102	NC_003552	GAA	2	6	3318219	3318224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_003552	GTT	2	6	3318251	3318256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19104	NC_003552	TAT	2	6	3318265	3318270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19105	NC_003552	TCC	4	12	3318284	3318295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19106	NC_003552	CGA	2	6	3318359	3318364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19107	NC_003552	GATA	2	8	3319094	3319101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19108	NC_003552	ATTT	2	8	3319110	3319117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19109	NC_003552	TAA	2	6	3319204	3319209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_003552	TA	3	6	3319228	3319233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19111	NC_003552	ATT	2	6	3319300	3319305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_003552	T	6	6	3319338	3319343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19113	NC_003552	TAT	2	6	3319345	3319350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19114	NC_003552	GAA	2	6	3319375	3319380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19115	NC_003552	TCC	2	6	3319397	3319402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19116	NC_003552	CGGC	2	8	3319449	3319456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19117	NC_003552	GAG	2	6	3319512	3319517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19118	NC_003552	G	6	6	3319530	3319535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19119	NC_003552	AAAC	2	8	3319570	3319577	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19120	NC_003552	TCT	2	6	3319593	3319598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19121	NC_003552	CAG	2	6	3319727	3319732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19122	NC_003552	TCT	2	6	3320380	3320385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19123	NC_003552	G	6	6	3320403	3320408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19124	NC_003552	AGA	2	6	3320428	3320433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19125	NC_003552	AAATT	2	10	3320501	3320510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19126	NC_003552	A	6	6	3320551	3320556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19127	NC_003552	ATG	2	6	3320601	3320606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19128	NC_003552	TAA	2	6	3320650	3320655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19130	NC_003552	T	6	6	3320922	3320927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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