MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 33561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_003552	TG	3	6	3040356	3040361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17502	NC_003552	CCGGAA	2	12	3040709	3040720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17503	NC_003552	CTT	2	6	3040791	3040796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17504	NC_003552	GTTA	2	8	3040816	3040823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17505	NC_003552	ATT	3	9	3040944	3040952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17506	NC_003552	T	6	6	3041823	3041828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_003552	TTTTCT	2	12	3041863	3041874	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17508	NC_003552	TAT	2	6	3041891	3041896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17509	NC_003552	TTG	2	6	3041902	3041907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17510	NC_003552	ATT	2	6	3041959	3041964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17511	NC_003552	TCA	2	6	3042054	3042059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17512	NC_003552	ATT	2	6	3043195	3043200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17513	NC_003552	CAG	2	6	3043265	3043270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17514	NC_003552	GTA	2	6	3043316	3043321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17515	NC_003552	TCA	2	6	3043367	3043372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17516	NC_003552	A	6	6	3043447	3043452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_003552	TTATT	2	10	3043460	3043469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_003552	TGAGGA	2	12	3043674	3043685	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17519	NC_003552	ATG	2	6	3043705	3043710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17520	NC_003552	T	8	8	3043751	3043758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17521	NC_003552	GCA	2	6	3043774	3043779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17522	NC_003552	GCT	2	6	3043835	3043840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17523	NC_003552	CTT	2	6	3043874	3043879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17524	NC_003552	AAG	2	6	3043896	3043901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_003552	TAT	2	6	3043948	3043953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17526	NC_003552	AGG	2	6	3046404	3046409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17527	NC_003552	GAA	2	6	3047559	3047564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_003552	AAC	2	6	3047637	3047642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17529	NC_003552	TTG	2	6	3047676	3047681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17530	NC_003552	AAT	2	6	3047686	3047691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_003552	T	6	6	3047719	3047724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17532	NC_003552	GTA	2	6	3047732	3047737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17533	NC_003552	TACC	2	8	3047754	3047761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17534	NC_003552	TTC	2	6	3048101	3048106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17535	NC_003552	ATA	2	6	3048187	3048192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17536	NC_003552	ATT	2	6	3048194	3048199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_003552	AT	3	6	3048211	3048216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17538	NC_003552	TGC	2	6	3048254	3048259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17539	NC_003552	TAAA	2	8	3048411	3048418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_003552	A	6	6	3048416	3048421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_003552	TAAA	2	8	3048431	3048438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_003552	A	6	6	3048436	3048441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_003552	TAAA	2	8	3048451	3048458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17544	NC_003552	A	6	6	3048456	3048461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17545	NC_003552	TAAA	2	8	3048471	3048478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17546	NC_003552	A	6	6	3048476	3048481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_003552	TAAA	2	8	3048491	3048498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17548	NC_003552	A	6	6	3048496	3048501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17549	NC_003552	A	7	7	3048516	3048522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17550	NC_003552	A	6	6	3048560	3048565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_003552	AGAA	2	8	3048571	3048578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_003552	AAC	2	6	3048582	3048587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17553	NC_003552	AATCA	2	10	3048595	3048604	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17554	NC_003552	ACA	2	6	3048648	3048653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17555	NC_003552	T	6	6	3048789	3048794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17556	NC_003552	A	7	7	3048829	3048835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_003552	TTC	2	6	3048860	3048865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17558	NC_003552	CTG	2	6	3048875	3048880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17559	NC_003552	AT	3	6	3050454	3050459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17560	NC_003552	A	6	6	3050464	3050469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_003552	TTA	2	6	3050478	3050483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_003552	AAT	3	9	3050495	3050503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17563	NC_003552	CGATA	2	10	3050505	3050514	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17564	NC_003552	AAAT	2	8	3050526	3050533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17565	NC_003552	AAAT	2	8	3050541	3050548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17566	NC_003552	CT	3	6	3050560	3050565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17567	NC_003552	T	9	9	3050593	3050601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17568	NC_003552	CTT	3	9	3053521	3053529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17569	NC_003552	T	6	6	3053528	3053533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17572	NC_003552	ATAG	2	8	3053614	3053621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17573	NC_003552	ATT	2	6	3053631	3053636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_003552	AT	3	6	3053643	3053648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17575	NC_003552	TTA	2	6	3053694	3053699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17578	NC_003552	T	6	6	3053910	3053915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17579	NC_003552	TC	3	6	3053919	3053924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17580	NC_003552	CAA	2	6	3053937	3053942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17581	NC_003552	ATT	2	6	3053970	3053975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17584	NC_003552	GAA	2	6	3054168	3054173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17589	NC_003552	GA	3	6	3054967	3054972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17592	NC_003552	TTCA	2	8	3058510	3058517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17593	NC_003552	CAT	3	9	3059486	3059494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17596	NC_003552	TA	3	6	3059651	3059656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17597	NC_003552	T	6	6	3059721	3059726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17601	NC_003552	TATAA	2	10	3060255	3060264	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17602	NC_003552	AT	4	8	3060271	3060278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17603	NC_003552	TAA	2	6	3060287	3060292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17604	NC_003552	AT	3	6	3060336	3060341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17605	NC_003552	GTA	2	6	3060416	3060421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17609	NC_003552	AATG	2	8	3060567	3060574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17610	NC_003552	T	6	6	3060631	3060636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17612	NC_003552	TTA	2	6	3060729	3060734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17615	NC_003552	ATA	2	6	3061265	3061270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17616	NC_003552	T	6	6	3061284	3061289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17617	NC_003552	TGA	2	6	3061293	3061298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17618	NC_003552	T	6	6	3061335	3061340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17619	NC_003552	AAT	2	6	3061349	3061354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17620	NC_003552	TCA	2	6	3061365	3061370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17622	NC_003552	ATT	2	6	3061427	3061432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17623	NC_003552	TA	3	6	3061475	3061480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17624	NC_003552	TCC	2	6	3061487	3061492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17625	NC_003552	TCT	2	6	3061526	3061531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17626	NC_003552	TTC	2	6	3061583	3061588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17627	NC_003552	TATT	2	8	3061626	3061633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17628	NC_003552	A	6	6	3061647	3061652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17629	NC_003552	TA	3	6	3061685	3061690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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