MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 9626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_002944	CGAC	2	8	3225805	3225812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_002944	GC	3	6	3227071	3227076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6503	NC_002944	CGG	2	6	3228353	3228358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_002944	GCG	2	6	3233887	3233892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_002944	CGC	2	6	3233913	3233918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_002944	GGC	2	6	3233919	3233924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_002944	CAG	2	6	3233933	3233938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_002944	CGT	2	6	3233942	3233947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_002944	GCC	2	6	3233994	3233999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6510	NC_002944	CGGG	2	8	3234002	3234009	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6511	NC_002944	GC	3	6	3234038	3234043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6512	NC_002944	GCC	2	6	3234045	3234050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6513	NC_002944	CGG	2	6	3234061	3234066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_002944	GCC	2	6	3234069	3234074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_002944	CGGC	2	8	3234159	3234166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_002944	ACCG	2	8	3234938	3234945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_002944	CCG	2	6	3234967	3234972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_002944	CAG	2	6	3234985	3234990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_002944	TGCG	2	8	3234992	3234999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6520	NC_002944	GCT	2	6	3235017	3235022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_002944	CGG	2	6	3235023	3235028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_002944	GGC	2	6	3235038	3235043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_002944	CGC	2	6	3235047	3235052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_002944	GCC	2	6	3235077	3235082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_002944	CCG	2	6	3235109	3235114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_002944	GCG	2	6	3235139	3235144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_002944	CGC	2	6	3235157	3235162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6528	NC_002944	CGG	2	6	3235206	3235211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_002944	GAC	2	6	3235273	3235278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_002944	CGG	2	6	3235290	3235295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_002944	CCGGCC	2	12	3235296	3235307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6532	NC_002944	CGG	2	6	3235374	3235379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_002944	CGG	2	6	3235410	3235415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_002944	ACCT	2	8	3235444	3235451	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6535	NC_002944	ACC	2	6	3235478	3235483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_002944	GCCT	2	8	3235489	3235496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6537	NC_002944	ACC	2	6	3235501	3235506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_002944	GCG	2	6	3235508	3235513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_002944	CCT	3	9	3237046	3237054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6540	NC_002944	CAC	2	6	3240306	3240311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6541	NC_002944	CTC	3	9	3241419	3241427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_002944	CGCTC	2	10	3241430	3241439	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6543	NC_002944	TCG	2	6	3241444	3241449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_002944	CTC	2	6	3242003	3242008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_002944	GGC	2	6	3242062	3242067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_002944	CGG	2	6	3242079	3242084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_002944	CA	3	6	3242087	3242092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6548	NC_002944	CTAGC	2	10	3244951	3244960	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6549	NC_002944	CGG	2	6	3246257	3246262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_002944	GCAT	2	8	3246263	3246270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6551	NC_002944	CCG	2	6	3246363	3246368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6552	NC_002944	CGA	2	6	3246390	3246395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_002944	CTC	3	9	3253667	3253675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6554	NC_002944	TCG	3	9	3253692	3253700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_002944	CTC	3	9	3253720	3253728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6556	NC_002944	TCG	3	9	3253745	3253753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_002944	CTC	3	9	3253773	3253781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_002944	TCG	3	9	3253798	3253806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_002944	TTG	2	6	3255324	3255329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_002944	CG	3	6	3255390	3255395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6561	NC_002944	CGC	2	6	3255400	3255405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6562	NC_002944	GCC	2	6	3259129	3259134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_002944	CCG	2	6	3259145	3259150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_002944	GC	3	6	3259155	3259160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6565	NC_002944	CGG	2	6	3260326	3260331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_002944	CCGA	2	8	3260349	3260356	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6567	NC_002944	CG	3	6	3260379	3260384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6568	NC_002944	CG	3	6	3260863	3260868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6569	NC_002944	GAAG	2	8	3260919	3260926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_002944	TG	3	6	3266791	3266796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_002944	CAA	2	6	3266850	3266855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_002944	TAGC	2	8	3269244	3269251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6573	NC_002944	CCG	2	6	3269873	3269878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6574	NC_002944	CG	4	8	3269877	3269884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6575	NC_002944	CCG	2	6	3271811	3271816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6576	NC_002944	CT	3	6	3272715	3272720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6577	NC_002944	TGC	2	6	3272722	3272727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_002944	CG	3	6	3278175	3278180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6579	NC_002944	CGG	2	6	3278243	3278248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_002944	CAGGCC	2	12	3278260	3278271	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6581	NC_002944	CTC	2	6	3281762	3281767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6582	NC_002944	TC	3	6	3281794	3281799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6583	NC_002944	GCA	2	6	3281829	3281834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_002944	GTCCG	2	10	3282346	3282355	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6585	NC_002944	GGGCC	2	10	3282363	3282372	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6586	NC_002944	CGG	2	6	3282405	3282410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_002944	CCGCA	2	10	3284190	3284199	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6588	NC_002944	TGCGG	2	10	3284216	3284225	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6589	NC_002944	TTC	2	6	3284230	3284235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_002944	C	6	6	3284852	3284857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6591	NC_002944	CAA	2	6	3284892	3284897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_002944	ATT	2	6	3284963	3284968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_002944	CGA	2	6	3284974	3284979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_002944	CCG	2	6	3285058	3285063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6595	NC_002944	GTC	2	6	3285068	3285073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_002944	GCCC	2	8	3285083	3285090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6597	NC_002944	GAC	2	6	3285168	3285173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_002944	CCG	2	6	3285249	3285254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6599	NC_002944	CGA	3	9	3285257	3285265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_002944	CCG	2	6	3285280	3285285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6601	NC_002944	GCC	2	6	3285320	3285325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_002944	GAC	2	6	3285335	3285340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_002944	AGC	2	6	3285350	3285355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_002944	CCGG	2	8	3286241	3286248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_002944	GCC	2	6	3286275	3286280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6606	NC_002944	CCT	2	6	3286716	3286721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6607	NC_002944	TG	3	6	3286722	3286727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_002944	CCG	2	6	3286743	3286748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6609	NC_002944	CGC	2	6	3286780	3286785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_002944	CG	3	6	3288684	3288689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6611	NC_002944	GC	3	6	3288719	3288724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6612	NC_002944	GCG	2	6	3290464	3290469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_002944	CG	3	6	3290555	3290560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_002944	CAG	2	6	3290587	3290592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_002944	CAG	2	6	3290605	3290610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_002944	GCC	4	12	3290625	3290636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_002944	GGC	2	6	3290643	3290648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_002944	GCC	3	9	3290649	3290657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6619	NC_002944	GCG	2	6	3290658	3290663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_002944	GC	3	6	3291181	3291186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6621	NC_002944	CGCGG	2	10	3291220	3291229	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6622	NC_002944	TCG	2	6	3291231	3291236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_002944	CGC	2	6	3291243	3291248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6624	NC_002944	CG	3	6	3291266	3291271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6625	NC_002944	GGC	2	6	3292204	3292209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_002944	CGA	2	6	3294105	3294110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_002944	GTT	2	6	3294204	3294209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_002944	TCC	2	6	3294256	3294261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6629	NC_002944	CCG	2	6	3294277	3294282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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