MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CDC1551 chromosome

Total Repeats: 9899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002755	CGG	2	6	543384	543389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_002755	AGCCT	2	10	543444	543453	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1003	NC_002755	GGC	2	6	544328	544333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_002755	CTT	2	6	544354	544359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_002755	ATAGTC	2	12	544405	544416	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1006	NC_002755	TTG	2	6	544419	544424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_002755	GC	4	8	544521	544528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_002755	TG	3	6	544557	544562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_002755	TGG	2	6	546740	546745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_002755	ACA	2	6	546746	546751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_002755	CGC	2	6	548296	548301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_002755	CGG	2	6	548444	548449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_002755	GCA	2	6	548461	548466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_002755	GTA	2	6	548943	548948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_002755	CGG	2	6	551058	551063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_002755	GAG	2	6	551093	551098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_002755	CGA	2	6	554016	554021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_002755	TAGGG	2	10	554034	554043	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_002755	TGC	2	6	557793	557798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_002755	GAG	2	6	557868	557873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_002755	GAC	2	6	558905	558910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_002755	TGTC	2	8	558961	558968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_002755	GCG	2	6	560277	560282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_002755	GAG	2	6	560317	560322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_002755	GCGAT	2	10	560332	560341	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1026	NC_002755	GTA	2	6	561281	561286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_002755	CGGC	2	8	561313	561320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_002755	ACG	2	6	561364	561369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_002755	CGA	2	6	561374	561379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_002755	GAA	2	6	561452	561457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_002755	GCT	2	6	561517	561522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_002755	GTG	2	6	561543	561548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_002755	TGC	3	9	561807	561815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_002755	GAA	2	6	561905	561910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_002755	GGC	2	6	561964	561969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_002755	TGC	2	6	561996	562001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_002755	AGC	2	6	562002	562007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_002755	GCG	2	6	562034	562039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_002755	GAG	2	6	562082	562087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_002755	ACA	2	6	562092	562097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_002755	CTT	2	6	562129	562134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_002755	CGC	2	6	562186	562191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_002755	CCGG	2	8	562247	562254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_002755	GC	3	6	562265	562270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_002755	GCT	2	6	563232	563237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_002755	GGC	2	6	563242	563247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_002755	GTC	2	6	564956	564961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_002755	GAT	2	6	564987	564992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_002755	GTG	2	6	564996	565001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_002755	CGC	3	9	565027	565035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_002755	GCG	2	6	565070	565075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_002755	CCT	2	6	565084	565089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_002755	CGC	2	6	565103	565108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_002755	GCC	2	6	565128	565133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_002755	CGG	2	6	565134	565139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_002755	AGCA	2	8	566391	566398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_002755	TGG	2	6	566412	566417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_002755	GTC	2	6	566455	566460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_002755	GGA	2	6	566461	566466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_002755	CCGAC	2	10	567071	567080	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1061	NC_002755	AGG	2	6	567085	567090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_002755	TCC	2	6	567138	567143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_002755	GGA	2	6	567146	567151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_002755	CCG	3	9	568022	568030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_002755	TGGT	2	8	568051	568058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_002755	GGC	2	6	569346	569351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_002755	GGC	2	6	573098	573103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_002755	GC	3	6	573107	573112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_002755	GT	3	6	575267	575272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_002755	ACG	2	6	575293	575298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_002755	GTT	2	6	575324	575329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_002755	GCC	2	6	575330	575335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_002755	CAG	2	6	575364	575369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_002755	GAA	2	6	575405	575410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_002755	CG	3	6	576752	576757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_002755	GC	3	6	578794	578799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_002755	CGA	3	9	578837	578845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_002755	GC	3	6	578852	578857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_002755	ATG	2	6	579038	579043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_002755	ACC	2	6	579699	579704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_002755	CGG	2	6	579706	579711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_002755	GAG	2	6	579736	579741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_002755	GAG	2	6	579766	579771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_002755	GA	3	6	579785	579790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_002755	CGG	2	6	580570	580575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_002755	CGG	2	6	580579	580584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_002755	GT	3	6	580653	580658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_002755	CAC	2	6	581998	582003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_002755	TGA	2	6	582027	582032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_002755	CGA	3	9	582040	582048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_002755	CAC	2	6	582075	582080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_002755	G	6	6	582089	582094	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_002755	TGA	2	6	582105	582110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_002755	CGA	3	9	582118	582126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_002755	GAG	3	9	582143	582151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_002755	TGA	2	6	582158	582163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_002755	CGAA	2	8	584929	584936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_002755	GAA	2	6	584942	584947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_002755	GCG	2	6	584958	584963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_002755	CGG	2	6	584968	584973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_002755	CGG	2	6	584979	584984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_002755	CAG	2	6	585026	585031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_002755	CGG	2	6	585032	585037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_002755	GTTT	2	8	587687	587694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_002755	GTT	2	6	590542	590547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_002755	ACCAGT	2	12	592350	592361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_002755	AAG	2	6	592841	592846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_002755	GCT	2	6	592882	592887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_002755	CGC	2	6	592971	592976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_002755	GAGT	2	8	593003	593010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_002755	TCG	2	6	593011	593016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_002755	TCG	2	6	596730	596735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_002755	CTC	3	9	596758	596766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_002755	TCG	2	6	596787	596792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_002755	TGC	2	6	597774	597779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_002755	GCG	2	6	597809	597814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_002755	TGGC	2	8	597822	597829	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_002755	TCG	2	6	597886	597891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_002755	TTC	2	6	597973	597978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_002755	GCTA	2	8	598002	598009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_002755	TAC	2	6	598029	598034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_002755	AGG	2	6	598052	598057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_002755	CG	3	6	598086	598091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_002755	GAT	2	6	598114	598119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_002755	GGT	2	6	601779	601784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_002755	TGC	2	6	601798	601803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_002755	GCGT	2	8	605888	605895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_002755	CCGA	2	8	605913	605920	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_002755	CCGA	2	8	609916	609923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_002755	GCC	2	6	609977	609982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_002755	AAG	2	6	609997	610002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_002755	TGA	2	6	610089	610094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_002755	GGT	2	6	610102	610107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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