MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 32863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002677	CTT	2	6	1602	1607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002677	GT	3	6	1639	1644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002677	CAA	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002677	TAT	2	6	1740	1745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002677	CAA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002677	TTC	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002677	A	6	6	1855	1860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002677	ACT	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002677	CGT	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002677	CGTT	2	8	2002	2009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002677	GAG	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002677	CGA	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_002677	GTG	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002677	CTG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002677	TAAA	2	8	7267	7274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002677	ATG	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002677	TGA	2	6	11070	11075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002677	T	6	6	11099	11104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002677	TGT	2	6	12117	12122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002677	T	6	6	12134	12139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002677	TAA	2	6	12152	12157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002677	TCC	2	6	12254	12259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_002677	TGT	2	6	12288	12293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002677	TGG	2	6	12328	12333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002677	TAG	2	6	12334	12339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002677	GGC	2	6	12374	12379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002677	G	6	6	12402	12407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002677	TCCG	2	8	12610	12617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002677	TCAGC	2	10	12644	12653	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_002677	GCT	2	6	12668	12673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002677	TCG	2	6	12701	12706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002677	TGC	2	6	12738	12743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002677	CAC	2	6	12757	12762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_002677	CGT	2	6	12768	12773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002677	CTT	2	6	13355	13360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002677	TTG	2	6	13412	13417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002677	TAA	2	6	13433	13438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002677	A	6	6	13558	13563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002677	AAC	2	6	13574	13579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_002677	TAG	2	6	13591	13596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002677	GTT	2	6	13597	13602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002677	TAA	2	6	13609	13614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002677	TAC	2	6	13634	13639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002677	GTG	2	6	13642	13647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002677	T	6	6	13680	13685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002677	AT	3	6	13695	13700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002677	TAGA	2	8	13739	13746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002677	CTG	2	6	13758	13763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_002677	ACC	2	6	13973	13978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_002677	TCC	2	6	14011	14016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_002677	GTC	2	6	14028	14033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002677	AT	3	6	14211	14216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002677	ACAT	3	12	14217	14228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002677	AT	7	14	14227	14240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002677	TTGA	2	8	14321	14328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002677	T	6	6	14329	14334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002677	ACA	2	6	14335	14340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002677	T	6	6	14396	14401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002677	AC	3	6	14402	14407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002677	TTGG	2	8	14476	14483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002677	CGA	2	6	14625	14630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002677	AAC	2	6	14647	14652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002677	TCT	2	6	14661	14666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_002677	GCAT	2	8	14712	14719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_002677	TTA	2	6	14723	14728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002677	AT	3	6	14740	14745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002677	GCT	2	6	14763	14768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_002677	GTTG	2	8	14853	14860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002677	GAAA	2	8	14914	14921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002677	A	6	6	14955	14960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002677	AAG	2	6	14991	14996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002677	ATTT	2	8	15007	15014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002677	CAA	2	6	15098	15103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002677	GAT	2	6	15129	15134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002677	T	6	6	15157	15162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002677	GTT	2	6	15265	15270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002677	GCTG	2	8	15435	15442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002677	GACT	2	8	15510	15517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002677	CGGT	2	8	15558	15565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002677	ACT	2	6	15598	15603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_002677	TGGA	2	8	15640	15647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002677	CCTT	2	8	15684	15691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002677	TG	3	6	15745	15750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002677	AGT	2	6	15794	15799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002677	TGC	2	6	16543	16548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002677	CAC	2	6	16996	17001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_002677	GTT	2	6	17075	17080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002677	TCA	2	6	17112	17117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_002677	CAACGA	2	12	17440	17451	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002677	TTG	2	6	17492	17497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002677	TGC	2	6	17586	17591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_002677	GTC	2	6	17680	17685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_002677	GCC	2	6	17691	17696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_002677	AGC	2	6	17699	17704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_002677	TGC	2	6	17759	17764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_002677	GCG	2	6	17770	17775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_002677	ACG	2	6	17781	17786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002677	TGG	2	6	17841	17846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002677	TGA	2	6	17907	17912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002677	TGG	2	6	17916	17921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002677	TGG	2	6	17927	17932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002677	GGT	2	6	18027	18032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002677	GCCC	2	8	18078	18085	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_002677	CGAT	2	8	18099	18106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002677	TGT	2	6	18169	18174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002677	GAG	2	6	18197	18202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002677	CCGG	2	8	18239	18246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002677	CAC	2	6	18270	18275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_002677	AC	3	6	27098	27103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002677	GGT	2	6	27126	27131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002677	ATG	2	6	28807	28812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002677	CTA	2	6	28856	28861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_002677	GAT	2	6	28863	28868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002677	AT	3	6	29381	29386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002677	AG	3	6	29454	29459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002677	TTC	2	6	29479	29484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002677	GCA	2	6	29501	29506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002677	CGC	2	6	29550	29555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_002677	GTTC	2	8	29560	29567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_002677	TCCG	2	8	29584	29591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002677	AGA	2	6	29681	29686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002677	TGT	2	6	29702	29707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002677	TA	3	6	29767	29772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002677	CGT	2	6	30050	30055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_002677	GA	3	6	30219	30224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002677	ATTTT	2	10	30261	30270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002677	TGG	2	6	30655	30660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002677	CGAA	2	8	30677	30684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002677	GCT	2	6	30924	30929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_002677	CATT	2	8	30944	30951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002677	CGG	2	6	31002	31007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_002677	GTA	2	6	31020	31025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002677	CGG	2	6	31107	31112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002677	GTG	2	6	31137	31142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002677	CGCC	2	8	31147	31154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_002677	TGT	2	6	31223	31228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002677	TCG	2	6	31280	31285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_002677	CAG	2	6	31300	31305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_002677	GCT	2	6	31306	31311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_002677	CCA	2	6	31320	31325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_002677	GCA	2	6	31332	31337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_002677	CTGT	2	8	31391	31398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002677	GCCAC	2	10	31424	31433	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_002677	GCT	2	6	31463	31468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_002677	CCAG	2	8	31476	31483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002677	GC	3	6	31525	31530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002677	CGG	2	6	31609	31614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_002677	CGG	2	6	31625	31630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_002677	GGC	2	6	31689	31694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_002677	ACA	2	6	31714	31719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_002677	GC	3	6	31742	31747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_002677	TGG	2	6	31768	31773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_002677	CGA	2	6	31935	31940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_002677	CGG	2	6	32296	32301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_002677	CCGG	2	8	32718	32725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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181	NC_002677	TCG	2	6	33756	33761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_002677	CTG	2	6	33780	33785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_002677	CTG	2	6	36170	36175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_002677	GTG	2	6	41470	41475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_002677	TGT	2	6	42504	42509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_002677	CAT	2	6	42553	42558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_002677	GCA	2	6	42616	42621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_002677	TTCCTT	2	12	42628	42639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_002677	GCTGC	2	10	42665	42674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
277	NC_002677	CCT	2	6	42697	42702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_002677	TAA	2	6	42873	42878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_002677	AC	4	8	42985	42992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
280	NC_002677	GAA	2	6	43001	43006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_002677	GCCG	2	8	43044	43051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_002677	AGTT	2	8	43081	43088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_002677	AGC	2	6	43143	43148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_002677	GTT	2	6	43532	43537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_002677	GTG	2	6	53984	53989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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