MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 32863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_002677	AC	3	6	2439550	2439555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24002	NC_002677	TAAA	2	8	2439557	2439564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24003	NC_002677	TC	3	6	2439604	2439609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24004	NC_002677	AAC	2	6	2439621	2439626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24005	NC_002677	GTAG	2	8	2439630	2439637	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24006	NC_002677	TTGTG	2	10	2439639	2439648	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24007	NC_002677	GCC	2	6	2439657	2439662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24008	NC_002677	GTC	2	6	2439690	2439695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24009	NC_002677	TGG	2	6	2439715	2439720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24010	NC_002677	CGC	2	6	2439754	2439759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24011	NC_002677	ATCGCG	2	12	2439765	2439776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24012	NC_002677	TGG	2	6	2439894	2439899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24013	NC_002677	TCG	2	6	2439927	2439932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24014	NC_002677	ATAG	2	8	2439950	2439957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24015	NC_002677	TCG	2	6	2439971	2439976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24016	NC_002677	CGGT	2	8	2440014	2440021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24017	NC_002677	CAAC	2	8	2440090	2440097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24018	NC_002677	CGG	2	6	2440101	2440106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24019	NC_002677	CGC	2	6	2440131	2440136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24020	NC_002677	TACG	2	8	2440220	2440227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24021	NC_002677	CGAT	2	8	2440269	2440276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24022	NC_002677	ACCC	2	8	2440278	2440285	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24023	NC_002677	ACCC	2	8	2440355	2440362	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24024	NC_002677	GCC	2	6	2440597	2440602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24025	NC_002677	GTG	2	6	2440603	2440608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24026	NC_002677	GAT	2	6	2440648	2440653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24027	NC_002677	GCACG	2	10	2440784	2440793	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24028	NC_002677	GCTG	2	8	2440983	2440990	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24029	NC_002677	TAG	2	6	2441057	2441062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24030	NC_002677	CAT	2	6	2442134	2442139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24031	NC_002677	CCG	2	6	2442148	2442153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24032	NC_002677	TCA	2	6	2442168	2442173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24033	NC_002677	GCGG	2	8	2442582	2442589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24034	NC_002677	CGA	2	6	2443507	2443512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24035	NC_002677	TAC	2	6	2443524	2443529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24036	NC_002677	GCTT	2	8	2443545	2443552	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24037	NC_002677	CA	3	6	2443663	2443668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24038	NC_002677	CGA	2	6	2443707	2443712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24039	NC_002677	TCCCCC	2	12	2443779	2443790	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
24040	NC_002677	CCA	2	6	2443810	2443815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24041	NC_002677	CGA	2	6	2443851	2443856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24042	NC_002677	ACG	2	6	2443969	2443974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24043	NC_002677	ACA	2	6	2444060	2444065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24044	NC_002677	TGG	2	6	2444068	2444073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24045	NC_002677	GAT	2	6	2444082	2444087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24046	NC_002677	GGCCAC	2	12	2444141	2444152	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24047	NC_002677	TCG	2	6	2444172	2444177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24048	NC_002677	AGC	2	6	2444293	2444298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24049	NC_002677	GATA	2	8	2444319	2444326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24050	NC_002677	GATA	2	8	2444340	2444347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24051	NC_002677	TA	3	6	2444346	2444351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24052	NC_002677	CGA	2	6	2444487	2444492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24053	NC_002677	CGG	2	6	2444692	2444697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24054	NC_002677	AAC	2	6	2444751	2444756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24055	NC_002677	ACC	2	6	2444767	2444772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24056	NC_002677	GCG	3	9	2444852	2444860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24057	NC_002677	CAC	2	6	2444981	2444986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24058	NC_002677	CCA	2	6	2445021	2445026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24059	NC_002677	ATTCAT	2	12	2445028	2445039	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24060	NC_002677	ATTCAT	2	12	2445050	2445061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24061	NC_002677	CAC	2	6	2445138	2445143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24062	NC_002677	TTG	2	6	2445151	2445156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24063	NC_002677	AAC	2	6	2445185	2445190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24064	NC_002677	GCA	2	6	2445263	2445268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24065	NC_002677	CAG	2	6	2445273	2445278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24066	NC_002677	GCA	2	6	2445281	2445286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24067	NC_002677	AGC	2	6	2445337	2445342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24068	NC_002677	AC	3	6	2445343	2445348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24069	NC_002677	GCG	2	6	2445494	2445499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24070	NC_002677	GTC	2	6	2445536	2445541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24071	NC_002677	CTT	2	6	2445637	2445642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24072	NC_002677	TGG	2	6	2445697	2445702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24073	NC_002677	GC	3	6	2445722	2445727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24074	NC_002677	GGT	2	6	2445764	2445769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24075	NC_002677	TTC	2	6	2445802	2445807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24076	NC_002677	ACCAC	2	10	2445885	2445894	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
24077	NC_002677	CAC	2	6	2445953	2445958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24078	NC_002677	AAT	2	6	2446009	2446014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24079	NC_002677	GTG	2	6	2446042	2446047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24080	NC_002677	CG	3	6	2446050	2446055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24081	NC_002677	TCGACG	2	12	2446104	2446115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24082	NC_002677	GCT	2	6	2446145	2446150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24083	NC_002677	GAC	2	6	2446230	2446235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24084	NC_002677	CGC	2	6	2446256	2446261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24085	NC_002677	CAG	2	6	2446283	2446288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24086	NC_002677	TCG	2	6	2446291	2446296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24087	NC_002677	CGC	2	6	2446482	2446487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24088	NC_002677	GAG	2	6	2446547	2446552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24089	NC_002677	ACG	2	6	2447349	2447354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24090	NC_002677	GACTT	2	10	2447394	2447403	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24091	NC_002677	AGTCA	2	10	2447405	2447414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24092	NC_002677	CACC	2	8	2447450	2447457	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24093	NC_002677	ACC	2	6	2447480	2447485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24094	NC_002677	GC	3	6	2447499	2447504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24095	NC_002677	TAT	2	6	2447509	2447514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24096	NC_002677	CTG	2	6	2447577	2447582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24097	NC_002677	TCA	2	6	2447590	2447595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24098	NC_002677	CAG	2	6	2447618	2447623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24099	NC_002677	TCGAGC	2	12	2447658	2447669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24100	NC_002677	CGA	2	6	2447723	2447728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24101	NC_002677	AAT	2	6	2447760	2447765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24102	NC_002677	C	7	7	2447828	2447834	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24103	NC_002677	CGG	2	6	2447861	2447866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24104	NC_002677	GAA	2	6	2447876	2447881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24105	NC_002677	CAAGG	3	15	2447937	2447951	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24106	NC_002677	ATG	2	6	2447957	2447962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24107	NC_002677	CGG	2	6	2447963	2447968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24108	NC_002677	ATT	2	6	2448030	2448035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24109	NC_002677	CAA	2	6	2448195	2448200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24110	NC_002677	GTCAC	2	10	2448271	2448280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24111	NC_002677	CA	3	6	2448321	2448326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24112	NC_002677	AGC	2	6	2448348	2448353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24113	NC_002677	TAG	2	6	2448371	2448376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24114	NC_002677	AGC	2	6	2448411	2448416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24115	NC_002677	AGC	2	6	2449853	2449858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24116	NC_002677	TGG	2	6	2449979	2449984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24117	NC_002677	GAT	2	6	2450004	2450009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24118	NC_002677	TTG	2	6	2450029	2450034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24119	NC_002677	GCA	2	6	2450059	2450064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24120	NC_002677	GCC	2	6	2450084	2450089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24121	NC_002677	CAG	2	6	2450114	2450119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24122	NC_002677	CCG	2	6	2450126	2450131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24123	NC_002677	CAT	2	6	2450282	2450287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24124	NC_002677	CAAC	2	8	2450317	2450324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24125	NC_002677	GCC	2	6	2450377	2450382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24126	NC_002677	ACG	2	6	2450468	2450473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24253	NC_002677	CGCT	2	8	2471440	2471447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24254	NC_002677	GGTT	2	8	2471571	2471578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24255	NC_002677	GAT	2	6	2471602	2471607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24257	NC_002677	GTC	2	6	2471655	2471660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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