MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 32863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_002677	CA	3	6	2161690	2161695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21002	NC_002677	CACG	2	8	2161894	2161901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21003	NC_002677	CCCCAC	2	12	2161904	2161915	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
21004	NC_002677	AACG	2	8	2161924	2161931	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21005	NC_002677	CGAT	2	8	2161937	2161944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21006	NC_002677	AC	3	6	2161967	2161972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21007	NC_002677	CA	3	6	2162008	2162013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21008	NC_002677	CAA	2	6	2162024	2162029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21009	NC_002677	GCA	2	6	2162034	2162039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21010	NC_002677	TGT	2	6	2162099	2162104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21011	NC_002677	TCA	2	6	2162185	2162190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21012	NC_002677	CAA	2	6	2162278	2162283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21013	NC_002677	GGT	2	6	2162362	2162367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21014	NC_002677	ACCAAC	2	12	2162399	2162410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21015	NC_002677	GGC	2	6	2162422	2162427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21016	NC_002677	GCC	2	6	2162448	2162453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21017	NC_002677	AGG	2	6	2162570	2162575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21018	NC_002677	CAC	2	6	2162622	2162627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21019	NC_002677	CCG	2	6	2162686	2162691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21020	NC_002677	CGG	2	6	2162704	2162709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21021	NC_002677	CAGC	2	8	2162728	2162735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21022	NC_002677	TGC	2	6	2162736	2162741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21023	NC_002677	AAC	2	6	2162784	2162789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21024	NC_002677	ATG	2	6	2162810	2162815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21025	NC_002677	A	7	7	2162825	2162831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21026	NC_002677	TAC	2	6	2162966	2162971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21027	NC_002677	ACG	2	6	2163150	2163155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21028	NC_002677	CAATCC	2	12	2163196	2163207	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
21029	NC_002677	TCTG	2	8	2163240	2163247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21030	NC_002677	CGA	2	6	2163286	2163291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21031	NC_002677	CTG	2	6	2163820	2163825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21032	NC_002677	GCT	2	6	2163837	2163842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21033	NC_002677	ATG	2	6	2163912	2163917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21034	NC_002677	C	6	6	2163955	2163960	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21035	NC_002677	CGA	2	6	2164060	2164065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21036	NC_002677	AAC	2	6	2164068	2164073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21037	NC_002677	ACC	2	6	2164117	2164122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21038	NC_002677	AAC	2	6	2164136	2164141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21039	NC_002677	AC	3	6	2164140	2164145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21040	NC_002677	ACG	2	6	2164148	2164153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21041	NC_002677	GCT	2	6	2164233	2164238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21042	NC_002677	GCT	2	6	2164240	2164245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21043	NC_002677	ACC	2	6	2164329	2164334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21044	NC_002677	CCA	2	6	2164337	2164342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21045	NC_002677	CTG	2	6	2164354	2164359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21046	NC_002677	GGC	2	6	2164364	2164369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21047	NC_002677	TCACC	2	10	2164412	2164421	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21048	NC_002677	GAC	2	6	2164508	2164513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21049	NC_002677	GAT	3	9	2164592	2164600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21050	NC_002677	CCG	2	6	2164644	2164649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21051	NC_002677	TCG	2	6	2164659	2164664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21052	NC_002677	CAT	2	6	2164668	2164673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21053	NC_002677	CGT	2	6	2164758	2164763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21054	NC_002677	CGA	2	6	2165049	2165054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21055	NC_002677	AAT	2	6	2165055	2165060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21056	NC_002677	GCA	2	6	2165075	2165080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21057	NC_002677	CAGC	2	8	2165088	2165095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21058	NC_002677	CAA	3	9	2165131	2165139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21059	NC_002677	TCA	2	6	2165144	2165149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21060	NC_002677	CAG	2	6	2165252	2165257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21061	NC_002677	TAA	2	6	2165320	2165325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21062	NC_002677	AC	3	6	2165527	2165532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21063	NC_002677	TCT	3	9	2165576	2165584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21064	NC_002677	TCT	2	6	2165594	2165599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21065	NC_002677	GCA	2	6	2166103	2166108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21066	NC_002677	CCTCGA	2	12	2166128	2166139	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21067	NC_002677	GTG	2	6	2166236	2166241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21068	NC_002677	TGC	2	6	2166330	2166335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21069	NC_002677	GTG	2	6	2166384	2166389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21070	NC_002677	ACTTT	2	10	2166408	2166417	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21071	NC_002677	GT	3	6	2166420	2166425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21072	NC_002677	GA	3	6	2166450	2166455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21073	NC_002677	A	6	6	2166469	2166474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21074	NC_002677	GC	3	6	2166646	2166651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21075	NC_002677	CAC	2	6	2166657	2166662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21076	NC_002677	CTG	2	6	2166666	2166671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21077	NC_002677	AC	3	6	2166691	2166696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21078	NC_002677	CAG	2	6	2166731	2166736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21079	NC_002677	GTC	2	6	2166762	2166767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21080	NC_002677	C	6	6	2166825	2166830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21081	NC_002677	CTG	2	6	2166847	2166852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21082	NC_002677	GAG	2	6	2166890	2166895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21083	NC_002677	CATGAA	2	12	2166943	2166954	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21084	NC_002677	TCA	2	6	2166985	2166990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21085	NC_002677	ATG	2	6	2167029	2167034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21086	NC_002677	CAC	2	6	2167103	2167108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21087	NC_002677	TGC	2	6	2167156	2167161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21088	NC_002677	GC	3	6	2167160	2167165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21089	NC_002677	CGG	2	6	2167315	2167320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21090	NC_002677	GC	3	6	2167380	2167385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21091	NC_002677	CAAT	2	8	2167416	2167423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21092	NC_002677	GCA	2	6	2167429	2167434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21093	NC_002677	TGA	2	6	2167551	2167556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21094	NC_002677	GGGT	2	8	2167625	2167632	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21095	NC_002677	ACACC	2	10	2167634	2167643	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
21096	NC_002677	TCA	2	6	2167672	2167677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21097	NC_002677	CAC	2	6	2167706	2167711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21098	NC_002677	CAG	2	6	2167853	2167858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21099	NC_002677	TTA	2	6	2167912	2167917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21100	NC_002677	CGT	2	6	2167946	2167951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21101	NC_002677	CGG	2	6	2168047	2168052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21102	NC_002677	GTTCG	2	10	2168069	2168078	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21103	NC_002677	ACT	2	6	2168081	2168086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21104	NC_002677	GAA	2	6	2168109	2168114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21105	NC_002677	CGC	2	6	2168117	2168122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21106	NC_002677	CAACGC	2	12	2168129	2168140	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21107	NC_002677	CGA	2	6	2168141	2168146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21108	NC_002677	GCG	2	6	2168186	2168191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21109	NC_002677	TCA	2	6	2168254	2168259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21110	NC_002677	TAC	2	6	2168269	2168274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21111	NC_002677	CAC	2	6	2168343	2168348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21112	NC_002677	CAGT	2	8	2168352	2168359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21113	NC_002677	TGCCG	2	10	2168426	2168435	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21114	NC_002677	CG	3	6	2168434	2168439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21115	NC_002677	C	6	6	2168447	2168452	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21116	NC_002677	GTC	2	6	2168498	2168503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21117	NC_002677	CTGTG	2	10	2168587	2168596	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21118	NC_002677	GCA	2	6	2168688	2168693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21119	NC_002677	CCA	2	6	2168727	2168732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21120	NC_002677	CGG	2	6	2168805	2168810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21121	NC_002677	GCA	2	6	2168922	2168927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21122	NC_002677	AAG	2	6	2168999	2169004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21123	NC_002677	TTC	2	6	2169439	2169444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21124	NC_002677	ACCGTA	2	12	2169448	2169459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21126	NC_002677	CCGA	2	8	2169491	2169498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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21489	NC_002677	CA	3	6	2210171	2210176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21490	NC_002677	TCC	2	6	2210202	2210207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21498	NC_002677	CGTCC	2	10	2210583	2210592	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21499	NC_002677	ACCA	2	8	2210640	2210647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21500	NC_002677	CA	3	6	2210646	2210651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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