MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 32863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_002677	GCTT	2	8	1375458	1375465	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13002	NC_002677	GAT	2	6	1375501	1375506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_002677	GTGAG	2	10	1375571	1375580	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_002677	GTT	2	6	1375716	1375721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_002677	GAAC	2	8	1375786	1375793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13006	NC_002677	GTC	2	6	1375883	1375888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_002677	GTT	2	6	1375993	1375998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_002677	TG	3	6	1376027	1376032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_002677	CAGC	2	8	1376043	1376050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13010	NC_002677	CGAT	2	8	1376166	1376173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13011	NC_002677	GCT	2	6	1376206	1376211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_002677	GTC	2	6	1376213	1376218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_002677	GAC	2	6	1376225	1376230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_002677	TCG	2	6	1376232	1376237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_002677	CGT	2	6	1376245	1376250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_002677	CTTG	2	8	1376316	1376323	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13017	NC_002677	CCGGC	2	10	1376390	1376399	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13018	NC_002677	TG	3	6	1376444	1376449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_002677	CGT	2	6	1376474	1376479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_002677	GGA	2	6	1376537	1376542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_002677	GAG	2	6	1376698	1376703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_002677	GAC	2	6	1376780	1376785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_002677	GCTT	2	8	1376825	1376832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13024	NC_002677	CA	3	6	1376869	1376874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13025	NC_002677	GTT	2	6	1376879	1376884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_002677	CTGTT	2	10	1376892	1376901	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13027	NC_002677	TGT	2	6	1376958	1376963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_002677	GTCG	2	8	1377011	1377018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13029	NC_002677	TCG	2	6	1377155	1377160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_002677	ACAAGG	2	12	1377161	1377172	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13031	NC_002677	CAT	2	6	1377224	1377229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_002677	TGA	2	6	1377263	1377268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_002677	GAG	2	6	1377333	1377338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_002677	GC	3	6	1377342	1377347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_002677	TGT	2	6	1377399	1377404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_002677	AGC	2	6	1377430	1377435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_002677	AGA	2	6	1377576	1377581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_002677	GTTG	2	8	1377610	1377617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_002677	CGA	2	6	1377634	1377639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_002677	GCC	2	6	1377642	1377647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_002677	GTG	2	6	1377708	1377713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_002677	TGA	2	6	1377807	1377812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_002677	GGC	2	6	1377820	1377825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_002677	CGGGG	2	10	1377833	1377842	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13045	NC_002677	CTT	2	6	1377843	1377848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_002677	GAT	2	6	1377852	1377857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_002677	TAAT	2	8	1377946	1377953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_002677	AGT	2	6	1377954	1377959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_002677	TAG	2	6	1377961	1377966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_002677	TCAAAG	2	12	1378034	1378045	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13051	NC_002677	CGG	2	6	1378179	1378184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_002677	GAAG	2	8	1378254	1378261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_002677	CAT	2	6	1378280	1378285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_002677	TG	4	8	1378311	1378318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_002677	GC	3	6	1378371	1378376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13056	NC_002677	TTGC	2	8	1378498	1378505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13057	NC_002677	CTG	2	6	1378544	1378549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_002677	CGA	2	6	1378600	1378605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_002677	ACG	2	6	1378787	1378792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_002677	GCC	2	6	1378827	1378832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_002677	GCT	2	6	1378833	1378838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_002677	ACC	2	6	1378852	1378857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_002677	TTG	2	6	1378858	1378863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_002677	GTG	2	6	1378867	1378872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_002677	TGCT	2	8	1378873	1378880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13066	NC_002677	GTTGA	2	10	1378923	1378932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_002677	GC	3	6	1379056	1379061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_002677	CGA	2	6	1379086	1379091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_002677	GAG	2	6	1379134	1379139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_002677	GCG	2	6	1379149	1379154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_002677	GCC	3	9	1379202	1379210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13072	NC_002677	CAG	2	6	1379278	1379283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_002677	AAGG	2	8	1379361	1379368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_002677	TTTC	2	8	1379383	1379390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13075	NC_002677	ACG	2	6	1379422	1379427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_002677	TCG	2	6	1379443	1379448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_002677	CA	3	6	1379449	1379454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_002677	GAA	2	6	1379460	1379465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_002677	TTAA	2	8	1379500	1379507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_002677	CGG	2	6	1379573	1379578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_002677	GCG	3	9	1379591	1379599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_002677	CA	3	6	1379618	1379623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13083	NC_002677	GTGG	2	8	1379628	1379635	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_002677	TGG	2	6	1379653	1379658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_002677	TGG	2	6	1379666	1379671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_002677	AGT	2	6	1379675	1379680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13089	NC_002677	GCTG	2	8	1379824	1379831	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13090	NC_002677	TCA	2	6	1379890	1379895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_002677	GCA	2	6	1379965	1379970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_002677	CTA	2	6	1380048	1380053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_002677	CGA	2	6	1380069	1380074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_002677	GGT	2	6	1380111	1380116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_002677	GAGC	2	8	1380272	1380279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13096	NC_002677	TCC	2	6	1380597	1380602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13097	NC_002677	AGC	2	6	1380622	1380627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_002677	TTCC	2	8	1380952	1380959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_002677	CGTTG	2	10	1380968	1380977	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13100	NC_002677	TCG	2	6	1382271	1382276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_002677	TTA	2	6	1382282	1382287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_002677	TCC	2	6	1382631	1382636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_002677	ACT	2	6	1382656	1382661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_002677	TGG	2	6	1382714	1382719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_002677	ACA	2	6	1382758	1382763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_002677	ACC	2	6	1382789	1382794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13107	NC_002677	ATGC	2	8	1382915	1382922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13108	NC_002677	CCCG	2	8	1382955	1382962	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13109	NC_002677	ACC	2	6	1382976	1382981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_002677	AT	3	6	1383004	1383009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_002677	GGC	2	6	1383044	1383049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_002677	CGA	2	6	1383059	1383064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_002677	TCG	2	6	1383066	1383071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_002677	GGCGA	2	10	1383080	1383089	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13115	NC_002677	ACT	2	6	1383093	1383098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_002677	TGT	2	6	1383099	1383104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_002677	GTG	3	9	1383106	1383114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_002677	GGTA	2	8	1383119	1383126	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_002677	CCG	2	6	1383134	1383139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13120	NC_002677	GCA	2	6	1383372	1383377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13122	NC_002677	AATC	2	8	1383509	1383516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13123	NC_002677	AAC	2	6	1383580	1383585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_002677	GTT	2	6	1383680	1383685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_002677	TGT	2	6	1383688	1383693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13127	NC_002677	TCC	2	6	1383773	1383778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13128	NC_002677	TG	3	6	1383786	1383791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_002677	CAA	2	6	1383949	1383954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13132	NC_002677	TCC	2	6	1384150	1384155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13233	NC_002677	TGCC	2	8	1389891	1389898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13234	NC_002677	GT	3	6	1389975	1389980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13243	NC_002677	CGT	2	6	1390937	1390942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13245	NC_002677	ATTTA	2	10	1390982	1390991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13246	NC_002677	ATG	2	6	1390992	1390997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13247	NC_002677	TTA	2	6	1391002	1391007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13250	NC_002677	TGT	2	6	1391236	1391241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13251	NC_002677	GTT	2	6	1391279	1391284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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