MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 32863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_002677	CGG	2	6	1225386	1225391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_002677	CGA	2	6	1225468	1225473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_002677	GCA	2	6	1225485	1225490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_002677	GCG	2	6	1225504	1225509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_002677	ATC	2	6	1225577	1225582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_002677	TTC	2	6	1225630	1225635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_002677	GTG	2	6	1225667	1225672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_002677	CTC	2	6	1225693	1225698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11509	NC_002677	TCG	2	6	1225754	1225759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_002677	GGA	2	6	1225775	1225780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_002677	CAG	2	6	1225812	1225817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_002677	GCG	2	6	1225852	1225857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_002677	ATC	2	6	1225876	1225881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_002677	TCG	2	6	1225949	1225954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_002677	AGC	2	6	1225961	1225966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_002677	CG	3	6	1225971	1225976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11517	NC_002677	GCT	2	6	1226011	1226016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_002677	GGT	2	6	1226060	1226065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_002677	CACC	2	8	1226208	1226215	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11520	NC_002677	GGGT	2	8	1226229	1226236	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_002677	GGC	2	6	1226318	1226323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_002677	TTG	2	6	1226327	1226332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_002677	TG	3	6	1226371	1226376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_002677	TG	3	6	1226390	1226395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_002677	TGC	2	6	1227050	1227055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_002677	GC	3	6	1227054	1227059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11527	NC_002677	GAG	2	6	1227132	1227137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_002677	GAA	2	6	1227169	1227174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_002677	CAG	2	6	1227195	1227200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_002677	GCTC	2	8	1227207	1227214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_002677	TTC	2	6	1227228	1227233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_002677	AGT	2	6	1227293	1227298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_002677	ACG	2	6	1227326	1227331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_002677	GAT	2	6	1227339	1227344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_002677	GCTG	2	8	1227369	1227376	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11536	NC_002677	GCG	2	6	1227397	1227402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_002677	TCG	2	6	1227565	1227570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_002677	ATC	2	6	1227640	1227645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_002677	TGA	2	6	1227665	1227670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_002677	TAC	2	6	1227673	1227678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_002677	GGC	2	6	1227680	1227685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_002677	TGG	2	6	1227695	1227700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_002677	GAA	2	6	1227726	1227731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_002677	CGG	2	6	1227789	1227794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_002677	CTA	2	6	1227961	1227966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_002677	CAC	2	6	1227987	1227992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11547	NC_002677	GT	5	10	1228012	1228021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_002677	TCAATA	2	12	1228057	1228068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11549	NC_002677	GCTG	2	8	1228109	1228116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11550	NC_002677	TGA	2	6	1228198	1228203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_002677	TAA	2	6	1228269	1228274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_002677	CCA	2	6	1228280	1228285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11553	NC_002677	CA	3	6	1228284	1228289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11554	NC_002677	GTG	2	6	1228297	1228302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_002677	GAG	2	6	1228324	1228329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_002677	CCG	2	6	1228361	1228366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11557	NC_002677	CG	3	6	1228432	1228437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11558	NC_002677	CTA	2	6	1228458	1228463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_002677	GTCGA	2	10	1228487	1228496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11560	NC_002677	CAC	3	9	1228504	1228512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11561	NC_002677	AAGC	2	8	1228541	1228548	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11562	NC_002677	TGCCG	2	10	1228590	1228599	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11563	NC_002677	TAC	2	6	1228620	1228625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_002677	GTC	2	6	1228647	1228652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_002677	CAA	2	6	1228738	1228743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_002677	GTC	2	6	1228752	1228757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_002677	CGA	2	6	1231587	1231592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_002677	TTG	2	6	1231597	1231602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_002677	G	6	6	1231604	1231609	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_002677	GCA	2	6	1231623	1231628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_002677	GAGC	2	8	1231635	1231642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11572	NC_002677	GAA	2	6	1231714	1231719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_002677	GTC	2	6	1232199	1232204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_002677	ACT	2	6	1232278	1232283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_002677	AC	3	6	1232343	1232348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11576	NC_002677	GTTA	2	8	1232434	1232441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_002677	CGG	2	6	1232447	1232452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_002677	ATCC	2	8	1232573	1232580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11579	NC_002677	GCA	2	6	1232711	1232716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_002677	GAT	2	6	1232733	1232738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_002677	AGTG	2	8	1232833	1232840	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_002677	CCAG	2	8	1232887	1232894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11583	NC_002677	TGG	2	6	1232924	1232929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_002677	TCA	2	6	1232951	1232956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_002677	CGA	2	6	1232961	1232966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11586	NC_002677	AGGT	2	8	1232969	1232976	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_002677	CGG	2	6	1233005	1233010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11588	NC_002677	TCA	2	6	1233151	1233156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_002677	GTG	2	6	1233207	1233212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_002677	C	6	6	1233307	1233312	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11591	NC_002677	GCTA	2	8	1234570	1234577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11592	NC_002677	GTT	2	6	1234583	1234588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_002677	CTG	2	6	1235328	1235333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_002677	TG	3	6	1235332	1235337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_002677	TCG	2	6	1235382	1235387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_002677	CAG	2	6	1235426	1235431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_002677	ACAT	2	8	1235488	1235495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11598	NC_002677	TA	3	6	1235515	1235520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_002677	ACGGTG	2	12	1235551	1235562	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11600	NC_002677	GCT	2	6	1235614	1235619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_002677	TACC	3	12	1235651	1235662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11602	NC_002677	ATC	3	9	1235684	1235692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_002677	TGA	2	6	1235719	1235724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_002677	CCAAGT	2	12	1235801	1235812	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_002677	TGA	2	6	1235820	1235825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_002677	ACCT	2	8	1235834	1235841	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11607	NC_002677	CTG	2	6	1235852	1235857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_002677	TTA	2	6	1235909	1235914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_002677	ATCG	2	8	1235922	1235929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11610	NC_002677	CAAAG	2	10	1235938	1235947	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11611	NC_002677	CCG	2	6	1235965	1235970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11612	NC_002677	GT	3	6	1235985	1235990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_002677	GAA	2	6	1236060	1236065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_002677	CAA	2	6	1236138	1236143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_002677	CCA	2	6	1236188	1236193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11616	NC_002677	TGC	2	6	1236259	1236264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_002677	CCAA	2	8	1236272	1236279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11618	NC_002677	AAT	2	6	1236291	1236296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_002677	A	7	7	1236317	1236323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_002677	TTCT	2	8	1236358	1236365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11621	NC_002677	GGT	2	6	1236388	1236393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_002677	CAT	2	6	1236415	1236420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_002677	TGT	3	9	1236486	1236494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_002677	TGAT	2	8	1236534	1236541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_002677	GGC	2	6	1236563	1236568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11627	NC_002677	CAG	2	6	1236626	1236631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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