MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000962	ACC	2	6	2223320	2223325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_000962	TCC	2	6	2224038	2224043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_000962	AGT	2	6	2224047	2224052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_000962	GCA	2	6	2224055	2224060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_000962	CCG	2	6	2224061	2224066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_000962	GATTG	2	10	2224080	2224089	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_000962	CGA	2	6	2224105	2224110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_000962	GCT	2	6	2224128	2224133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_000962	GAC	2	6	2224134	2224139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_000962	GATC	2	8	2224166	2224173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_000962	GTG	2	6	2224188	2224193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_000962	TCC	2	6	2225289	2225294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_000962	TTC	2	6	2225364	2225369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_000962	GC	3	6	2226209	2226214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_000962	CGT	2	6	2228628	2228633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_000962	GTC	2	6	2228691	2228696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_000962	GGTC	2	8	2228735	2228742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_000962	GCT	2	6	2228813	2228818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_000962	ACA	3	9	2228970	2228978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_000962	TAA	2	6	2229942	2229947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_000962	GAA	2	6	2229961	2229966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_000962	TTA	2	6	2229967	2229972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_000962	TCG	2	6	2230647	2230652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_000962	AGG	2	6	2230673	2230678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_000962	GC	3	6	2230679	2230684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_000962	CGG	2	6	2230724	2230729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_000962	CCA	2	6	2230751	2230756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_000962	GGCCG	2	10	2230896	2230905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4029	NC_000962	GGGT	2	8	2230918	2230925	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_000962	TCA	2	6	2230938	2230943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_000962	CGGTTG	2	12	2230944	2230955	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4032	NC_000962	GAG	2	6	2230981	2230986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_000962	CAA	2	6	2231485	2231490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_000962	GTC	2	6	2231519	2231524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_000962	TGA	2	6	2231579	2231584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_000962	GCC	2	6	2232227	2232232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_000962	ACC	2	6	2232242	2232247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_000962	GCC	2	6	2232341	2232346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_000962	ATT	2	6	2232376	2232381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_000962	GCG	2	6	2232382	2232387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_000962	ATC	2	6	2232392	2232397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_000962	CGA	2	6	2232404	2232409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_000962	CGT	2	6	2232428	2232433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_000962	ACG	2	6	2232442	2232447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_000962	GCT	2	6	2232455	2232460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_000962	AGC	2	6	2232483	2232488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_000962	TGC	2	6	2232507	2232512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_000962	TCA	2	6	2232530	2232535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_000962	GAC	2	6	2232558	2232563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_000962	CGCT	2	8	2232565	2232572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_000962	GCA	2	6	2232576	2232581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_000962	TAT	2	6	2233676	2233681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_000962	ACG	2	6	2233717	2233722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_000962	CAC	2	6	2233797	2233802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_000962	ACG	2	6	2233841	2233846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_000962	GCCGCA	2	12	2233849	2233860	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_000962	ACC	2	6	2234220	2234225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_000962	AGT	2	6	2234233	2234238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_000962	CGG	2	6	2234244	2234249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_000962	G	7	7	2234248	2234254	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_000962	AGA	2	6	2234920	2234925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_000962	CGG	2	6	2234926	2234931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_000962	AC	3	6	2234966	2234971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_000962	CG	3	6	2234982	2234987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4065	NC_000962	CTTTG	2	10	2237587	2237596	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4066	NC_000962	GTCGT	2	10	2237611	2237620	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4067	NC_000962	CTG	2	6	2237621	2237626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_000962	GC	3	6	2238056	2238061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_000962	GCC	2	6	2238084	2238089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_000962	CCT	2	6	2238941	2238946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_000962	GTA	2	6	2238976	2238981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_000962	GTG	2	6	2239979	2239984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_000962	CG	3	6	2239991	2239996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_000962	CGGGC	2	10	2240030	2240039	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4075	NC_000962	CAG	2	6	2240040	2240045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_000962	GAGGT	2	10	2240147	2240156	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_000962	CCGT	2	8	2242881	2242888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_000962	GTGC	2	8	2242898	2242905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_000962	CTG	2	6	2243733	2243738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_000962	TG	3	6	2243758	2243763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_000962	CAG	2	6	2243772	2243777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_000962	CGC	2	6	2243798	2243803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_000962	CGG	2	6	2247599	2247604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_000962	ACC	2	6	2247612	2247617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_000962	GAG	2	6	2247649	2247654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_000962	GGCA	2	8	2248452	2248459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_000962	CGT	2	6	2248552	2248557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_000962	CGA	2	6	2249425	2249430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_000962	TGC	2	6	2249433	2249438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_000962	AGCCA	2	10	2250981	2250990	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4091	NC_000962	TGG	2	6	2255999	2256004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_000962	CGA	2	6	2256007	2256012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_000962	TC	3	6	2256013	2256018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_000962	CGGC	2	8	2256029	2256036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_000962	TG	3	6	2256064	2256069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_000962	TCG	2	6	2256071	2256076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_000962	CGT	3	9	2258717	2258725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_000962	CCG	3	9	2258726	2258734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_000962	TGAG	2	8	2258775	2258782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_000962	ACC	2	6	2258790	2258795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_000962	AT	3	6	2259305	2259310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_000962	TCA	2	6	2259313	2259318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_000962	CAG	2	6	2259845	2259850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_000962	GGC	2	6	2259869	2259874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_000962	GAT	2	6	2259886	2259891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_000962	TCA	2	6	2259903	2259908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_000962	GCG	2	6	2259985	2259990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_000962	CG	3	6	2260035	2260040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_000962	CGA	2	6	2260072	2260077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_000962	GGT	2	6	2260144	2260149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_000962	GAT	2	6	2260159	2260164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_000962	CGAGC	2	10	2260183	2260192	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4113	NC_000962	GTG	2	6	2260212	2260217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_000962	CCG	3	9	2260222	2260230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_000962	TGGA	2	8	2260289	2260296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_000962	GCTC	2	8	2260335	2260342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_000962	CGG	2	6	2260379	2260384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_000962	CGA	2	6	2260423	2260428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_000962	CGA	2	6	2260466	2260471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_000962	GAT	2	6	2260512	2260517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_000962	TCG	2	6	2260531	2260536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_000962	CGC	2	6	2260557	2260562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_000962	CGC	2	6	2260580	2260585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_000962	GCT	2	6	2260598	2260603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_000962	GCT	2	6	2260607	2260612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_000962	GCCGG	2	10	2260615	2260624	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4127	NC_000962	CCA	2	6	2261722	2261727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_000962	ACGA	2	8	2261737	2261744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_000962	TCA	2	6	2263077	2263082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_000962	GCA	2	6	2263085	2263090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_000962	GCCGT	2	10	2263130	2263139	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4132	NC_000962	CGGCTC	2	12	2263162	2263173	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_000962	CCG	2	6	2263179	2263184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_000962	CCA	2	6	2263221	2263226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4135	NC_000962	AGC	2	6	2263273	2263278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_000962	TGG	2	6	2263279	2263284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_000962	ATAG	2	8	2263292	2263299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_000962	CAGC	2	8	2263310	2263317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4139	NC_000962	CCGA	2	8	2263408	2263415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4140	NC_000962	CA	3	6	2265085	2265090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4141	NC_000962	GGC	2	6	2265092	2265097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4142	NC_000962	ACC	2	6	2265216	2265221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4143	NC_000962	TGG	2	6	2265244	2265249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_000962	GGT	2	6	2266761	2266766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_000962	TCT	2	6	2268156	2268161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4146	NC_000962	CAC	2	6	2268163	2268168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4147	NC_000962	CTG	2	6	2268180	2268185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4148	NC_000962	CCAG	2	8	2268207	2268214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4149	NC_000962	AGGC	2	8	2268270	2268277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4150	NC_000962	TTTCC	2	10	2268321	2268330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4151	NC_000962	ATT	2	6	2268448	2268453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_000962	TTTG	2	8	2268527	2268534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_000962	GTC	2	6	2268541	2268546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4154	NC_000962	GCC	2	6	2268570	2268575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4155	NC_000962	CAT	2	6	2268589	2268594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4156	NC_000962	GATC	2	8	2268634	2268641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4157	NC_000962	GTA	2	6	2268673	2268678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_000962	GGC	2	6	2270258	2270263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4159	NC_000962	CCAAC	2	10	2270297	2270306	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4160	NC_000962	GT	3	6	2270436	2270441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_000962	CTT	2	6	2270512	2270517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4162	NC_000962	TCG	2	6	2270550	2270555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4163	NC_000962	TG	3	6	2270601	2270606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_000962	GCC	2	6	2270656	2270661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4165	NC_000962	ACG	2	6	2270712	2270717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4169	NC_000962	AAGC	2	8	2271800	2271807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4170	NC_000962	ATA	2	6	2271832	2271837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4171	NC_000962	CAAC	2	8	2274537	2274544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4172	NC_000962	CCT	2	6	2278939	2278944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4173	NC_000962	TGT	2	6	2279069	2279074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4206	NC_000962	CGG	2	6	2310848	2310853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4212	NC_000962	GCG	2	6	2314022	2314027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4215	NC_000962	AAT	2	6	2315142	2315147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4232	NC_000962	ACC	2	6	2334664	2334669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4233	NC_000962	CA	3	6	2334695	2334700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4234	NC_000962	CAC	2	6	2334720	2334725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4235	NC_000962	GT	3	6	2334741	2334746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4241	NC_000962	GTC	2	6	2334906	2334911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4242	NC_000962	ACCC	2	8	2337984	2337991	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4243	NC_000962	CGC	3	9	2338006	2338014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4244	NC_000962	GTA	2	6	2338042	2338047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_000962	GCC	2	6	2338051	2338056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4246	NC_000962	CAG	2	6	2338534	2338539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_000962	TGCACT	2	12	2338584	2338595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_000962	CAG	2	6	2338658	2338663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_000962	ATG	2	6	2338667	2338672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_000962	GC	3	6	2338687	2338692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4251	NC_000962	CCG	2	6	2342959	2342964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4252	NC_000962	TTG	2	6	2342971	2342976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_000962	GGC	2	6	2342995	2343000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_000962	TCA	2	6	2343939	2343944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_000962	AT	3	6	2343973	2343978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_000962	ACG	2	6	2344241	2344246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_000962	GATG	2	8	2344396	2344403	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4395	NC_000962	GAC	2	6	2387192	2387197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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