MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000962	CTC	2	6	1976543	1976548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_000962	GCCG	2	8	1977932	1977939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_000962	GC	3	6	1981012	1981017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_000962	CGC	3	9	1981015	1981023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_000962	TCA	2	6	1981066	1981071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_000962	CGT	2	6	1981088	1981093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_000962	GCA	2	6	1981098	1981103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_000962	GTCG	2	8	1981592	1981599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_000962	CGT	2	6	1984862	1984867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_000962	GCG	2	6	1984959	1984964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_000962	ACC	2	6	1986701	1986706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_000962	CGA	2	6	1986719	1986724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_000962	CAA	2	6	1986761	1986766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_000962	CT	3	6	1987728	1987733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_000962	CGT	2	6	1989609	1989614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_000962	CGG	2	6	1989618	1989623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_000962	CAA	2	6	1989645	1989650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_000962	CGC	2	6	1989651	1989656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_000962	GTG	2	6	1989700	1989705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_000962	GCG	2	6	1989792	1989797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_000962	GTC	2	6	1989813	1989818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_000962	CCG	2	6	1989825	1989830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_000962	ACC	2	6	1992601	1992606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_000962	CGA	2	6	1992616	1992621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_000962	GGGC	2	8	1992667	1992674	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_000962	GGT	2	6	1992738	1992743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_000962	GC	3	6	1992849	1992854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_000962	CGC	2	6	1992865	1992870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_000962	CGC	2	6	1992882	1992887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_000962	GCC	2	6	1992917	1992922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_000962	CAC	2	6	1993010	1993015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_000962	AGC	2	6	1993054	1993059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_000962	CGC	2	6	1993099	1993104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_000962	TCCT	2	8	1995852	1995859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_000962	GTG	2	6	1995860	1995865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_000962	TG	3	6	1995864	1995869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_000962	ACG	2	6	1995877	1995882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_000962	CGG	2	6	1995924	1995929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_000962	TGT	2	6	1995950	1995955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_000962	GCCG	2	8	1995999	1996006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_000962	TGAG	2	8	1996011	1996018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_000962	CGC	2	6	1996035	1996040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_000962	CCG	2	6	1996062	1996067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_000962	TCA	2	6	1998520	1998525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_000962	GCA	2	6	1998528	1998533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_000962	GCCGT	2	10	1998573	1998582	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3547	NC_000962	CCG	2	6	1998610	1998615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_000962	GCC	2	6	1998651	1998656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_000962	CAA	2	6	1998664	1998669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_000962	CAC	2	6	1998700	1998705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_000962	CAA	2	6	1998739	1998744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_000962	CCGCA	2	10	1998762	1998771	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3553	NC_000962	C	6	6	1998776	1998781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3554	NC_000962	TGGC	2	8	1998860	1998867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_000962	GGC	2	6	1998893	1998898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_000962	CCAG	2	8	1998957	1998964	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_000962	CGG	2	6	1998970	1998975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_000962	CGT	2	6	1998988	1998993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_000962	CCGA	2	8	1999086	1999093	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_000962	GTCG	2	8	1999117	1999124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3561	NC_000962	GCCG	2	8	1999400	1999407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_000962	GGT	2	6	1999428	1999433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_000962	CGC	2	6	1999450	1999455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_000962	CGGG	2	8	1999478	1999485	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3565	NC_000962	AGT	2	6	1999555	1999560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_000962	CGG	2	6	1999639	1999644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_000962	C	6	6	1999688	1999693	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3568	NC_000962	GCC	2	6	2000034	2000039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3569	NC_000962	CCG	2	6	2000582	2000587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_000962	CAG	2	6	2002529	2002534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_000962	CA	3	6	2002539	2002544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_000962	GTGG	2	8	2002568	2002575	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_000962	GGC	2	6	2002620	2002625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_000962	GTG	2	6	2006468	2006473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_000962	GGT	2	6	2006518	2006523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_000962	GCA	2	6	2006555	2006560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_000962	GGT	2	6	2006960	2006965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_000962	CCG	2	6	2006977	2006982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_000962	TTC	2	6	2010592	2010597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_000962	CTTA	2	8	2010616	2010623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_000962	CGA	2	6	2011966	2011971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_000962	GCA	2	6	2011980	2011985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_000962	CAG	2	6	2012002	2012007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_000962	CGC	3	9	2012533	2012541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_000962	GGTC	2	8	2012604	2012611	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_000962	GACT	2	8	2012629	2012636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_000962	ATA	2	6	2012653	2012658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_000962	TGT	2	6	2012679	2012684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_000962	CCT	2	6	2014493	2014498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_000962	AC	3	6	2014528	2014533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_000962	GTT	2	6	2014558	2014563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_000962	GA	3	6	2014575	2014580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_000962	CAGCA	2	10	2017537	2017546	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3594	NC_000962	GCGGA	2	10	2017594	2017603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3595	NC_000962	CGC	2	6	2017630	2017635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_000962	ACG	2	6	2017655	2017660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_000962	CACC	2	8	2024718	2024725	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3598	NC_000962	GGA	2	6	2024816	2024821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_000962	GAAT	2	8	2025084	2025091	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_000962	GC	3	6	2025211	2025216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_000962	TGG	2	6	2025234	2025239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_000962	TCA	2	6	2025246	2025251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_000962	GT	3	6	2025279	2025284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_000962	GAGG	2	8	2025288	2025295	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_000962	T	6	6	2028073	2028078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_000962	GGT	2	6	2028152	2028157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_000962	GGT	2	6	2028179	2028184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_000962	GCG	2	6	2028191	2028196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_000962	GCC	2	6	2028259	2028264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_000962	GCG	2	6	2028289	2028294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_000962	AGC	2	6	2028296	2028301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_000962	AGC	2	6	2028325	2028330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_000962	GCC	2	6	2029498	2029503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_000962	TGC	2	6	2029509	2029514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_000962	CGGT	2	8	2029534	2029541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_000962	CGC	2	6	2029545	2029550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_000962	CGG	2	6	2029572	2029577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_000962	CGGT	2	8	2029641	2029648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_000962	TTG	2	6	2029834	2029839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_000962	CT	3	6	2029855	2029860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_000962	AG	3	6	2029864	2029869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_000962	CTG	2	6	2030220	2030225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_000962	CAG	2	6	2030305	2030310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_000962	ATGCG	2	10	2030375	2030384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3625	NC_000962	GGA	2	6	2030424	2030429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_000962	TGC	2	6	2030555	2030560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_000962	CAA	2	6	2030592	2030597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_000962	CAG	2	6	2030623	2030628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_000962	AGC	2	6	2030635	2030640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_000962	GCA	2	6	2030997	2031002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_000962	ACCA	2	8	2031004	2031011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3763	NC_000962	GGTGG	2	10	2078850	2078859	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3764	NC_000962	CAA	2	6	2078889	2078894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3777	NC_000962	CTC	2	6	2089525	2089530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3876	NC_000962	CAGG	2	8	2142456	2142463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3877	NC_000962	AAAG	2	8	2142500	2142507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3878	NC_000962	TGC	2	6	2144892	2144897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3879	NC_000962	GCTGGG	2	12	2144916	2144927	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3880	NC_000962	CAG	2	6	2148970	2148975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3882	NC_000962	GCG	2	6	2150330	2150335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3883	NC_000962	TGG	2	6	2150781	2150786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3884	NC_000962	G	6	6	2150785	2150790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3885	NC_000962	TGA	2	6	2150878	2150883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3886	NC_000962	GCA	2	6	2150916	2150921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3887	NC_000962	ACG	3	9	2150933	2150941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3888	NC_000962	ACCG	2	8	2151397	2151404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3889	NC_000962	CA	3	6	2152896	2152901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3891	NC_000962	CGC	2	6	2152966	2152971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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