MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000962	TCG	2	6	1625399	1625404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_000962	GAT	2	6	1630223	1630228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_000962	CG	3	6	1630311	1630316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_000962	CTG	3	9	1630379	1630387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_000962	GTG	2	6	1630420	1630425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_000962	CGGC	2	8	1630435	1630442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_000962	CAT	2	6	1630481	1630486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_000962	TGG	2	6	1630577	1630582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_000962	GAA	2	6	1630597	1630602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_000962	GCCCCT	2	12	1634645	1634656	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_000962	CGC	2	6	1634690	1634695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_000962	CTG	2	6	1634741	1634746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_000962	CTA	2	6	1634766	1634771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_000962	CTG	2	6	1634952	1634957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_000962	GTA	2	6	1634985	1634990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_000962	GC	3	6	1634997	1635002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_000962	GAG	2	6	1635016	1635021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_000962	GCCCCT	2	12	1638247	1638258	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_000962	CGC	2	6	1638292	1638297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_000962	CTG	2	6	1638343	1638348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_000962	CTA	2	6	1638368	1638373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_000962	GCA	2	6	1639656	1639661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_000962	GTA	2	6	1642441	1642446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_000962	GGC	2	6	1642527	1642532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_000962	CTC	3	9	1644269	1644277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_000962	TCGCT	2	10	1644279	1644288	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3027	NC_000962	TCG	3	9	1644294	1644302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_000962	CTC	3	9	1644322	1644330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_000962	TCGCT	2	10	1644332	1644341	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3030	NC_000962	TCG	3	9	1644347	1644355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_000962	CCG	2	6	1653628	1653633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_000962	CGG	2	6	1653646	1653651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_000962	GCGA	2	8	1653657	1653664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_000962	TC	3	6	1655546	1655551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_000962	GAA	2	6	1655559	1655564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_000962	GCG	2	6	1655602	1655607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_000962	CGAC	2	8	1656748	1656755	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_000962	GCAAT	2	10	1656875	1656884	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3039	NC_000962	GCC	2	6	1656954	1656959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_000962	AGGC	2	8	1659362	1659369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_000962	CGA	2	6	1660637	1660642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_000962	CAC	2	6	1662322	1662327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_000962	GCG	3	9	1662332	1662340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_000962	CCG	2	6	1662574	1662579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_000962	GAC	2	6	1662591	1662596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_000962	GCG	2	6	1662603	1662608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_000962	CGT	2	6	1662614	1662619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_000962	CGCC	2	8	1666069	1666076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3049	NC_000962	GTG	2	6	1666096	1666101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_000962	TTG	2	6	1666129	1666134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_000962	GC	3	6	1666145	1666150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_000962	AGC	2	6	1666160	1666165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_000962	AGGA	2	8	1666192	1666199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_000962	ATCT	2	8	1666773	1666780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_000962	GTT	2	6	1666809	1666814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_000962	CG	3	6	1666824	1666829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_000962	ATG	2	6	1666918	1666923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_000962	CAC	2	6	1669165	1669170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_000962	AGG	2	6	1669190	1669195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_000962	GGA	2	6	1669272	1669277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_000962	CCG	2	6	1673361	1673366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_000962	CGGCC	2	10	1673406	1673415	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3063	NC_000962	GCG	2	6	1673416	1673421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_000962	GTT	2	6	1676898	1676903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_000962	AC	3	6	1679217	1679222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_000962	GCGA	2	8	1679230	1679237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_000962	ACC	2	6	1680643	1680648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_000962	CCG	2	6	1680677	1680682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_000962	CGG	2	6	1680782	1680787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_000962	CGT	2	6	1680806	1680811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_000962	TGG	2	6	1680871	1680876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_000962	GAA	2	6	1680924	1680929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_000962	CCA	2	6	1680935	1680940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_000962	GT	3	6	1680971	1680976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_000962	TCC	2	6	1681029	1681034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_000962	GTT	2	6	1681048	1681053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_000962	CCGA	2	8	1681119	1681126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_000962	CCGA	2	8	1681193	1681200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_000962	TTA	2	6	1682085	1682090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_000962	AAGC	2	8	1682108	1682115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_000962	GCG	2	6	1689258	1689263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_000962	CA	3	6	1689941	1689946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_000962	CGA	2	6	1689962	1689967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_000962	GCC	2	6	1689993	1689998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_000962	CGG	2	6	1690034	1690039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_000962	ATG	2	6	1690099	1690104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_000962	GAG	2	6	1690810	1690815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_000962	GGAT	2	8	1690837	1690844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_000962	TGG	2	6	1692817	1692822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_000962	GAT	2	6	1692859	1692864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_000962	TGA	2	6	1693852	1693857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_000962	ATT	2	6	1693887	1693892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_000962	GAT	2	6	1693904	1693909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_000962	TCG	3	9	1693921	1693929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_000962	TCAC	2	8	1693936	1693943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_000962	TCG	2	6	1693947	1693952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_000962	ATC	2	6	1695163	1695168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_000962	CCA	2	6	1695209	1695214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_000962	CGG	2	6	1695231	1695236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_000962	CGC	2	6	1696491	1696496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_000962	GTA	2	6	1696527	1696532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_000962	TG	5	10	1696592	1696601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_000962	GCG	2	6	1696655	1696660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_000962	CCG	2	6	1696678	1696683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_000962	GATA	2	8	1696716	1696723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_000962	CAC	2	6	1697896	1697901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_000962	GC	3	6	1697992	1697997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_000962	ACCA	2	8	1698052	1698059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_000962	CG	3	6	1701122	1701127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_000962	CTG	2	6	1701141	1701146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_000962	CGT	2	6	1702858	1702863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_000962	TCC	2	6	1702872	1702877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_000962	CG	3	6	1702885	1702890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_000962	AGG	2	6	1702971	1702976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_000962	CTA	2	6	1703008	1703013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_000962	GCG	2	6	1703024	1703029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_000962	GGC	2	6	1706615	1706620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_000962	GCCG	2	8	1708604	1708611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_000962	CGT	2	6	1708617	1708622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_000962	TGG	2	6	1708627	1708632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_000962	CGG	2	6	1708634	1708639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_000962	GC	3	6	1708702	1708707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_000962	CGCGG	2	10	1708768	1708777	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3124	NC_000962	GC	3	6	1708841	1708846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_000962	GTA	2	6	1708853	1708858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_000962	CGT	2	6	1710623	1710628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_000962	GGC	2	6	1710662	1710667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_000962	ATGG	2	8	1712097	1712104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_000962	GCC	2	6	1712127	1712132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_000962	CGA	2	6	1712137	1712142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_000962	CCG	2	6	1712193	1712198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_000962	TCC	2	6	1712208	1712213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_000962	GA	3	6	1712272	1712277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_000962	AAC	2	6	1712278	1712283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_000962	GAT	2	6	1720009	1720014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_000962	GCG	2	6	1728427	1728432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_000962	TCG	2	6	1728435	1728440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_000962	GCA	2	6	1728466	1728471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3139	NC_000962	CACC	2	8	1728479	1728486	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3140	NC_000962	CAG	2	6	1728530	1728535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_000962	AT	3	6	1728553	1728558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_000962	A	7	7	1728582	1728588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_000962	TGAT	2	8	1728631	1728638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_000962	TCA	2	6	1728639	1728644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3145	NC_000962	TCG	2	6	1728745	1728750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3146	NC_000962	TGG	2	6	1728762	1728767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_000962	AGCC	2	8	1728797	1728804	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3148	NC_000962	TGC	2	6	1729495	1729500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_000962	CACGA	2	10	1731347	1731356	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3151	NC_000962	ATCA	2	8	1733581	1733588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3152	NC_000962	CGT	2	6	1733600	1733605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_000962	CCCG	2	8	1735457	1735464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3154	NC_000962	GGC	2	6	1735528	1735533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3156	NC_000962	CGT	2	6	1735640	1735645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3157	NC_000962	GTG	2	6	1735646	1735651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_000962	GAG	2	6	1735755	1735760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3161	NC_000962	ACGGG	2	10	1735893	1735902	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3163	NC_000962	GCAG	2	8	1736221	1736228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3164	NC_000962	GCG	2	6	1736255	1736260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3165	NC_000962	GAA	2	6	1736326	1736331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3170	NC_000962	CGCGG	2	10	1739714	1739723	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3171	NC_000962	GGGC	2	8	1742208	1742215	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3172	NC_000962	GAT	3	9	1742232	1742240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_000962	TGCC	2	8	1744861	1744868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3174	NC_000962	GCC	2	6	1744916	1744921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3237	NC_000962	AAG	2	6	1789864	1789869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3240	NC_000962	CGG	2	6	1789954	1789959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3243	NC_000962	TG	3	6	1790086	1790091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_000962	CGAGTG	2	12	1790107	1790118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3245	NC_000962	GCC	2	6	1790217	1790222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3246	NC_000962	GGC	2	6	1790228	1790233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3247	NC_000962	CG	3	6	1790244	1790249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3248	NC_000962	GCC	2	6	1792246	1792251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3249	NC_000962	TCG	2	6	1792315	1792320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_000962	TG	3	6	1792349	1792354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_000962	CG	3	6	1793771	1793776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3252	NC_000962	AGC	2	6	1793797	1793802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_000962	GCG	2	6	1793935	1793940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3256	NC_000962	GGC	2	6	1798269	1798274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3257	NC_000962	GGC	2	6	1799484	1799489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_000962	GCT	2	6	1799542	1799547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3260	NC_000962	CGC	2	6	1806003	1806008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3261	NC_000962	CGC	2	6	1806084	1806089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3262	NC_000962	CGAG	2	8	1806090	1806097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3374	NC_000962	TGCG	2	8	1901037	1901044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3384	NC_000962	TGA	2	6	1912922	1912927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3385	NC_000962	TGGGG	2	10	1914993	1915002	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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3387	NC_000962	G	6	6	1915057	1915062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3388	NC_000962	TGA	2	6	1915072	1915077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3389	NC_000962	CGG	2	6	1915112	1915117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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