MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_000962	GGC	2	6	1355687	1355692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_000962	GAG	3	9	1355707	1355715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_000962	GGC	2	6	1355721	1355726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_000962	GCG	2	6	1357060	1357065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_000962	GC	3	6	1357134	1357139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_000962	GGC	2	6	1357153	1357158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_000962	GCC	2	6	1357188	1357193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_000962	GCCG	2	8	1357200	1357207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_000962	CGG	2	6	1357208	1357213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_000962	CGC	2	6	1357231	1357236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_000962	C	6	6	1357250	1357255	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2512	NC_000962	CCG	2	6	1357260	1357265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_000962	CCA	2	6	1357636	1357641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2514	NC_000962	CGC	2	6	1357712	1357717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_000962	CG	3	6	1357726	1357731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_000962	CAGC	2	8	1357736	1357743	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2517	NC_000962	CTC	2	6	1360149	1360154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_000962	ACGT	2	8	1363376	1363383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2519	NC_000962	AGGG	2	8	1363397	1363404	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_000962	GTC	2	6	1364151	1364156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_000962	GC	3	6	1364217	1364222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2522	NC_000962	GCCG	2	8	1364234	1364241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_000962	CGA	2	6	1364295	1364300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_000962	AT	3	6	1364375	1364380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_000962	ACT	2	6	1365187	1365192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_000962	GCC	2	6	1365198	1365203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2527	NC_000962	CCGCG	2	10	1365286	1365295	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2528	NC_000962	AGG	2	6	1365333	1365338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_000962	TGC	2	6	1365843	1365848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_000962	CGGC	2	8	1367867	1367874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2531	NC_000962	TCGACA	2	12	1368744	1368755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_000962	CAA	2	6	1370878	1370883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_000962	CCA	2	6	1371492	1371497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_000962	ACA	2	6	1371510	1371515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_000962	ACC	2	6	1371638	1371643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_000962	TCG	2	6	1371670	1371675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_000962	GT	3	6	1374211	1374216	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_000962	TCT	2	6	1374236	1374241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_000962	CTT	2	6	1374245	1374250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_000962	TTCGT	2	10	1374253	1374262	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2541	NC_000962	CATA	2	8	1374275	1374282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2542	NC_000962	TCGC	2	8	1376876	1376883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_000962	G	6	6	1376951	1376956	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_000962	GGA	2	6	1376958	1376963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_000962	GGC	2	6	1381867	1381872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_000962	GTCC	2	8	1383150	1383157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_000962	GT	3	6	1384247	1384252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_000962	CAT	2	6	1384262	1384267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_000962	CT	3	6	1386686	1386691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2550	NC_000962	GCC	2	6	1387718	1387723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_000962	AC	3	6	1387748	1387753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_000962	AAC	2	6	1387765	1387770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_000962	GC	3	6	1387777	1387782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2554	NC_000962	CCCT	2	8	1388635	1388642	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2555	NC_000962	TCG	2	6	1389314	1389319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_000962	TTC	2	6	1393071	1393076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_000962	GCG	2	6	1393106	1393111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_000962	CTG	2	6	1393113	1393118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_000962	AG	3	6	1393173	1393178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_000962	CG	3	6	1393188	1393193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2561	NC_000962	GCG	2	6	1394051	1394056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_000962	AAT	2	6	1394077	1394082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_000962	GCG	2	6	1394083	1394088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_000962	CTC	2	6	1399249	1399254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_000962	CAC	2	6	1399948	1399953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2566	NC_000962	CGT	2	6	1404679	1404684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_000962	CGG	2	6	1404697	1404702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_000962	TCG	2	6	1409391	1409396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_000962	GCC	2	6	1410425	1410430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_000962	GCG	3	9	1411872	1411880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_000962	G	6	6	1413130	1413135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_000962	CGGC	2	8	1413166	1413173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2573	NC_000962	CCG	2	6	1413948	1413953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_000962	TCC	2	6	1415847	1415852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_000962	CAAC	2	8	1415853	1415860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_000962	GCC	2	6	1415866	1415871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2577	NC_000962	CAA	2	6	1415880	1415885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_000962	CAA	2	6	1415937	1415942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_000962	CGC	2	6	1416037	1416042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2580	NC_000962	CGG	2	6	1416093	1416098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_000962	GC	3	6	1416102	1416107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2582	NC_000962	TCC	2	6	1417354	1417359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2583	NC_000962	GAT	2	6	1417533	1417538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_000962	CGG	2	6	1417587	1417592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_000962	CGG	2	6	1418534	1418539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_000962	CGA	2	6	1418543	1418548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_000962	TCGG	2	8	1418549	1418556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2588	NC_000962	CGG	2	6	1418975	1418980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_000962	GCG	2	6	1418982	1418987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_000962	CAA	2	6	1418992	1418997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_000962	CCGAGT	2	12	1419822	1419833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_000962	CGG	2	6	1419900	1419905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_000962	G	6	6	1420351	1420356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_000962	CAA	2	6	1420373	1420378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_000962	CTT	2	6	1420379	1420384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_000962	TGC	2	6	1424075	1424080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_000962	GC	4	8	1425323	1425330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2598	NC_000962	CG	3	6	1425368	1425373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_000962	GTC	3	9	1425990	1425998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_000962	CGC	2	6	1426007	1426012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2601	NC_000962	TAGG	2	8	1426085	1426092	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_000962	TGC	2	6	1426151	1426156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_000962	CCG	2	6	1426158	1426163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_000962	CGC	2	6	1431655	1431660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_000962	ACC	2	6	1437123	1437128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_000962	GCC	2	6	1437169	1437174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_000962	GC	3	6	1437176	1437181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2608	NC_000962	GTT	2	6	1437255	1437260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_000962	GAG	2	6	1437312	1437317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_000962	CCG	2	6	1437859	1437864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_000962	CTG	2	6	1440767	1440772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_000962	GCCT	2	8	1441311	1441318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_000962	CAC	2	6	1442722	1442727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_000962	CCG	2	6	1443418	1443423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_000962	CTC	2	6	1443444	1443449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2616	NC_000962	CCG	2	6	1443453	1443458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2617	NC_000962	TCG	2	6	1443471	1443476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_000962	GGC	2	6	1445373	1445378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_000962	TGA	2	6	1445417	1445422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_000962	GTG	2	6	1445485	1445490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_000962	TGA	2	6	1445835	1445840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_000962	ACA	2	6	1446018	1446023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_000962	CGA	2	6	1446090	1446095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_000962	GCC	2	6	1446129	1446134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2625	NC_000962	TTG	2	6	1446157	1446162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_000962	ACG	2	6	1446268	1446273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_000962	ACC	2	6	1446326	1446331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2628	NC_000962	ACC	2	6	1446351	1446356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2629	NC_000962	GCG	2	6	1451794	1451799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2631	NC_000962	GCG	2	6	1451851	1451856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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