MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_000962	GAT	2	6	1143690	1143695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_000962	GCCA	2	8	1144512	1144519	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2003	NC_000962	CCGT	2	8	1144528	1144535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2004	NC_000962	GCA	2	6	1144536	1144541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_000962	ACG	2	6	1144545	1144550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_000962	G	6	6	1148007	1148012	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_000962	TCT	2	6	1148017	1148022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_000962	CGG	2	6	1148147	1148152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_000962	GGGCA	2	10	1148202	1148211	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2010	NC_000962	GGT	2	6	1148217	1148222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_000962	G	6	6	1151699	1151704	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_000962	CTG	2	6	1151721	1151726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_000962	TTGGTG	2	12	1151786	1151797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_000962	CGC	2	6	1151861	1151866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2015	NC_000962	ACA	2	6	1151882	1151887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_000962	GCCG	2	8	1151905	1151912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2017	NC_000962	CGGG	2	8	1158843	1158850	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2018	NC_000962	CGG	2	6	1158862	1158867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_000962	CGA	2	6	1159340	1159345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_000962	CCG	2	6	1160089	1160094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2021	NC_000962	AGT	2	6	1160456	1160461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_000962	AAC	2	6	1160475	1160480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_000962	CA	3	6	1160486	1160491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2024	NC_000962	TCC	2	6	1160832	1160837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2025	NC_000962	GTC	2	6	1160841	1160846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_000962	GTC	2	6	1161174	1161179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_000962	GTT	2	6	1161182	1161187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_000962	GGT	2	6	1161214	1161219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_000962	TTCCGT	2	12	1162479	1162490	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2030	NC_000962	GTT	2	6	1162512	1162517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_000962	GCC	2	6	1162529	1162534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2032	NC_000962	TG	4	8	1163388	1163395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_000962	GCCG	2	8	1163402	1163409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2034	NC_000962	TG	3	6	1163430	1163435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_000962	T	6	6	1163528	1163533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_000962	GGC	2	6	1163566	1163571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_000962	CA	3	6	1163615	1163620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2038	NC_000962	CG	3	6	1163628	1163633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2039	NC_000962	GC	3	6	1163634	1163639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2040	NC_000962	GC	3	6	1163889	1163894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2041	NC_000962	GAC	2	6	1163967	1163972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_000962	TTC	2	6	1164029	1164034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2043	NC_000962	CAA	2	6	1164148	1164153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_000962	CGT	2	6	1164169	1164174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_000962	GGTC	2	8	1164196	1164203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2046	NC_000962	GCG	2	6	1164271	1164276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_000962	AGGT	2	8	1164339	1164346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_000962	TGC	2	6	1164387	1164392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_000962	CTG	2	6	1164408	1164413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_000962	CAGC	2	8	1164539	1164546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2051	NC_000962	GTA	2	6	1165565	1165570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_000962	CCTTG	2	10	1165620	1165629	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2053	NC_000962	CGC	2	6	1165694	1165699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2054	NC_000962	ACC	2	6	1165732	1165737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2055	NC_000962	CACGC	2	10	1166818	1166827	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2056	NC_000962	GCC	2	6	1166850	1166855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_000962	CCG	2	6	1166890	1166895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2058	NC_000962	GC	3	6	1166988	1166993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2059	NC_000962	GCG	2	6	1168570	1168575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2060	NC_000962	ACC	2	6	1168593	1168598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2061	NC_000962	GAC	2	6	1168639	1168644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_000962	ATA	2	6	1169287	1169292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_000962	CAG	2	6	1169294	1169299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_000962	GTG	2	6	1169314	1169319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_000962	AGT	2	6	1169356	1169361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_000962	TGT	2	6	1170759	1170764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_000962	TCG	2	6	1170810	1170815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_000962	GCA	2	6	1170874	1170879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_000962	AGT	2	6	1170903	1170908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_000962	TCCC	2	8	1170953	1170960	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2072	NC_000962	GCC	2	6	1170995	1171000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2073	NC_000962	CGC	2	6	1171006	1171011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2074	NC_000962	TCG	2	6	1171031	1171036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2075	NC_000962	CTC	2	6	1172182	1172187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2078	NC_000962	GC	3	6	1172231	1172236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2079	NC_000962	TGG	2	6	1172292	1172297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2081	NC_000962	AT	3	6	1172845	1172850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2082	NC_000962	GAG	2	6	1172869	1172874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2091	NC_000962	CGAG	2	8	1174885	1174892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2092	NC_000962	CGG	2	6	1174902	1174907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_000962	CGGG	2	8	1175000	1175007	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2094	NC_000962	GCC	2	6	1175011	1175016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2095	NC_000962	GATCC	2	10	1175128	1175137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2096	NC_000962	TCG	2	6	1175151	1175156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_000962	GTG	2	6	1175186	1175191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_000962	GCG	2	6	1175253	1175258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2099	NC_000962	GTG	2	6	1175279	1175284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_000962	GCG	2	6	1175321	1175326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2101	NC_000962	GGC	2	6	1175330	1175335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_000962	CGATC	2	10	1175338	1175347	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2103	NC_000962	CGG	2	6	1175353	1175358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_000962	GTAG	2	8	1175374	1175381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_000962	GCCT	2	8	1175408	1175415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2106	NC_000962	GC	3	6	1175416	1175421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2107	NC_000962	GC	3	6	1175431	1175436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2108	NC_000962	GGCC	2	8	1175444	1175451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2109	NC_000962	CGG	2	6	1175605	1175610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2118	NC_000962	GGA	2	6	1176527	1176532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2124	NC_000962	GCG	2	6	1176873	1176878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_000962	GTT	2	6	1177480	1177485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_000962	CTG	3	9	1177507	1177515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2127	NC_000962	CGC	2	6	1177518	1177523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2128	NC_000962	CAACC	2	10	1177533	1177542	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2129	NC_000962	GGC	2	6	1178414	1178419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_000962	GCA	2	6	1178462	1178467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_000962	TCT	3	9	1178532	1178540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_000962	GCGCA	2	10	1178545	1178554	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2133	NC_000962	GCC	2	6	1178621	1178626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2134	NC_000962	GAGC	2	8	1178631	1178638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2135	NC_000962	CGG	2	6	1178640	1178645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2137	NC_000962	CGG	2	6	1178726	1178731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2138	NC_000962	GCTG	2	8	1178775	1178782	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2139	NC_000962	CCG	2	6	1178832	1178837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2140	NC_000962	AT	3	6	1178867	1178872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_000962	CGA	2	6	1178927	1178932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_000962	TTTGA	2	10	1178981	1178990	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2143	NC_000962	GTT	2	6	1179035	1179040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2144	NC_000962	GCG	2	6	1179250	1179255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2145	NC_000962	TGCTG	2	10	1179288	1179297	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2146	NC_000962	GAG	2	6	1179331	1179336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2151	NC_000962	GCG	2	6	1180621	1180626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2152	NC_000962	GAG	2	6	1180640	1180645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_000962	GC	3	6	1180654	1180659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2154	NC_000962	CG	3	6	1182318	1182323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2157	NC_000962	GCG	2	6	1183982	1183987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2159	NC_000962	GCTG	2	8	1188408	1188415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2162	NC_000962	CATT	2	8	1190652	1190659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2163	NC_000962	TCG	2	6	1190711	1190716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2164	NC_000962	TG	3	6	1190718	1190723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2165	NC_000962	CGT	2	6	1190727	1190732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2244	NC_000962	CG	3	6	1221900	1221905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2245	NC_000962	CGG	2	6	1221909	1221914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2247	NC_000962	GC	3	6	1222797	1222802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2248	NC_000962	CGGC	2	8	1222819	1222826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2249	NC_000962	CTG	2	6	1222862	1222867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2252	NC_000962	CCG	2	6	1222942	1222947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2253	NC_000962	GGGT	2	8	1222956	1222963	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2254	NC_000962	GAG	2	6	1222985	1222990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2255	NC_000962	CCGGC	2	10	1224336	1224345	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2256	NC_000962	TG	3	6	1227579	1227584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2257	NC_000962	CTT	2	6	1230566	1230571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_000962	CAG	2	6	1230589	1230594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2259	NC_000962	GTG	2	6	1230616	1230621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2260	NC_000962	TCG	2	6	1232152	1232157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2261	NC_000962	CTG	2	6	1232166	1232171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_000962	AGG	2	6	1232197	1232202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_000962	ATC	2	6	1232226	1232231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2264	NC_000962	CAA	2	6	1232237	1232242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2265	NC_000962	CGC	2	6	1232275	1232280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2267	NC_000962	AGC	2	6	1236114	1236119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2269	NC_000962	CGCCT	2	10	1238230	1238239	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2270	NC_000962	CT	3	6	1238249	1238254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2271	NC_000962	CAT	2	6	1239369	1239374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2274	NC_000962	TCG	2	6	1241397	1241402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2282	NC_000962	ACT	2	6	1251485	1251490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2287	NC_000962	CTG	2	6	1253019	1253024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2292	NC_000962	CCGAT	2	10	1261394	1261403	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2294	NC_000962	GCGCG	2	10	1261475	1261484	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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2299	NC_000962	CGGC	2	8	1261751	1261758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2323	NC_000962	CAGCC	2	10	1267063	1267072	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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2368	NC_000962	GTT	2	6	1276289	1276294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2372	NC_000962	ACC	2	6	1278341	1278346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2373	NC_000962	CAGGC	2	10	1278402	1278411	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2374	NC_000962	CTG	2	6	1278428	1278433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2375	NC_000962	CGA	2	6	1278442	1278447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2376	NC_000962	GCA	2	6	1278480	1278485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2378	NC_000962	AGATC	2	10	1278583	1278592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2379	NC_000962	CGG	2	6	1278619	1278624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2383	NC_000962	CGG	2	6	1278748	1278753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2389	NC_000962	TCG	2	6	1282006	1282011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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