MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_000962	CAG	2	6	918846	918851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_000962	CGG	2	6	918870	918875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_000962	GTC	2	6	918905	918910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_000962	CAG	2	6	919616	919621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_000962	ACC	2	6	919627	919632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_000962	GCG	2	6	920700	920705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_000962	GTG	2	6	921156	921161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_000962	TCAC	2	8	921876	921883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_000962	GTA	2	6	921914	921919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_000962	AGCA	2	8	923714	923721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_000962	TTGCT	2	10	923730	923739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1512	NC_000962	GGGA	2	8	923761	923768	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_000962	CCA	2	6	923808	923813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_000962	CAC	2	6	923963	923968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_000962	GA	3	6	923984	923989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_000962	CGC	2	6	924025	924030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_000962	CA	3	6	924095	924100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_000962	GC	3	6	924132	924137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_000962	CGG	2	6	924148	924153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_000962	TGC	2	6	924202	924207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_000962	CGG	2	6	924261	924266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_000962	CCA	2	6	924284	924289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_000962	GGC	2	6	924313	924318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_000962	CTGGGT	2	12	924340	924351	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1525	NC_000962	GAT	2	6	924430	924435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_000962	GCCG	2	8	924443	924450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_000962	CGG	2	6	924483	924488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_000962	CTC	2	6	924498	924503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_000962	ACC	2	6	924590	924595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_000962	GGT	2	6	924604	924609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_000962	AGA	2	6	924700	924705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_000962	CCAT	2	8	924741	924748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_000962	CG	3	6	924772	924777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_000962	TGGCG	2	10	924794	924803	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1535	NC_000962	GCC	2	6	924808	924813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_000962	GGC	2	6	924845	924850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_000962	CTG	2	6	924872	924877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_000962	TCC	2	6	924880	924885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_000962	GAG	2	6	924938	924943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_000962	CGA	2	6	927634	927639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_000962	CGG	2	6	927673	927678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_000962	CGC	2	6	927694	927699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_000962	ACT	2	6	927731	927736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_000962	GCC	2	6	930592	930597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_000962	CGG	2	6	930615	930620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_000962	GGGC	2	8	930627	930634	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_000962	CGC	2	6	930700	930705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_000962	GCG	2	6	930718	930723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_000962	GCA	2	6	930759	930764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_000962	GGC	2	6	930786	930791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_000962	CGG	2	6	930800	930805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_000962	GC	4	8	930924	930931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_000962	AGC	3	9	931615	931623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_000962	GGC	2	6	931624	931629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_000962	ACG	2	6	931663	931668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_000962	GAA	3	9	931680	931688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_000962	CTG	2	6	931715	931720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_000962	AGC	2	6	931774	931779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_000962	AAC	2	6	931861	931866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_000962	ACG	2	6	931933	931938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_000962	GTT	2	6	931979	931984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_000962	TCT	2	6	932003	932008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_000962	GCC	2	6	932015	932020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_000962	CTTA	2	8	932046	932053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_000962	GCC	2	6	932063	932068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_000962	CAGTCG	2	12	932078	932089	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_000962	TGC	3	9	932098	932106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_000962	GGC	2	6	932118	932123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_000962	ACC	2	6	932141	932146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_000962	TGG	3	9	932269	932277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_000962	ACG	2	6	932949	932954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_000962	AGG	2	6	932991	932996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_000962	CACT	2	8	934135	934142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_000962	CCT	2	6	934144	934149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_000962	TGA	2	6	934189	934194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_000962	GCA	2	6	934201	934206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_000962	CCT	2	6	934219	934224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_000962	GGT	2	6	934259	934264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_000962	ACG	2	6	934349	934354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_000962	CAA	2	6	934359	934364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_000962	TGG	2	6	934369	934374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_000962	CGG	2	6	934393	934398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_000962	CCG	2	6	934436	934441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_000962	GCG	2	6	934510	934515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_000962	CGA	2	6	934523	934528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_000962	GCC	2	6	934538	934543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_000962	CAG	2	6	934557	934562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_000962	GTG	2	6	934608	934613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_000962	CAA	2	6	934697	934702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_000962	AAAT	2	8	935505	935512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_000962	CG	3	6	936401	936406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_000962	CG	3	6	936412	936417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_000962	GTTG	2	8	936418	936425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_000962	CGA	2	6	936427	936432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_000962	TCGCC	2	10	937391	937400	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1597	NC_000962	CTG	2	6	937501	937506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_000962	GCCG	2	8	937507	937514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_000962	AGC	2	6	937891	937896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_000962	GCA	2	6	937968	937973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_000962	TCC	2	6	937990	937995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_000962	GGA	2	6	938036	938041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_000962	GCG	2	6	938085	938090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_000962	CGGT	2	8	940423	940430	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1605	NC_000962	CGC	2	6	940442	940447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_000962	GC	3	6	941108	941113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_000962	GCT	2	6	941134	941139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_000962	GTT	2	6	942474	942479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_000962	CCG	2	6	942553	942558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_000962	CCGG	2	8	942574	942581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_000962	GCC	2	6	942672	942677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_000962	CTC	2	6	944201	944206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_000962	TGA	2	6	944265	944270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_000962	CAC	2	6	944272	944277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_000962	CAT	2	6	944280	944285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_000962	TA	3	6	944313	944318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_000962	GGT	2	6	944752	944757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_000962	CGA	2	6	944831	944836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_000962	AAC	3	9	944845	944853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_000962	CAA	2	6	944879	944884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_000962	GCACC	2	10	944925	944934	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1622	NC_000962	CGGCC	2	10	949413	949422	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1623	NC_000962	GAC	2	6	951122	951127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_000962	CGGCG	2	10	952742	952751	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1625	NC_000962	GTG	2	6	952819	952824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_000962	CGA	2	6	954941	954946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_000962	GC	3	6	954948	954953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_000962	CAAC	2	8	954971	954978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_000962	GAA	2	6	955026	955031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_000962	GTCA	2	8	960164	960171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_000962	CTC	3	9	960181	960189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_000962	TCG	2	6	960206	960211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1634	NC_000962	CTC	3	9	960234	960242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1767	NC_000962	TCG	2	6	1023983	1023988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1769	NC_000962	CCACG	2	10	1024071	1024080	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1771	NC_000962	GC	3	6	1024107	1024112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1772	NC_000962	GGA	2	6	1024143	1024148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1775	NC_000962	CGC	2	6	1025432	1025437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1776	NC_000962	GCCG	2	8	1025438	1025445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1783	NC_000962	GT	3	6	1027008	1027013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1785	NC_000962	GT	3	6	1027085	1027090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1786	NC_000962	GGC	2	6	1027098	1027103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1798	NC_000962	GACTGC	2	12	1033813	1033824	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1802	NC_000962	CAT	2	6	1034783	1034788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1806	NC_000962	GGT	2	6	1041094	1041099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1809	NC_000962	GTA	2	6	1041248	1041253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1826	NC_000962	CCG	2	6	1057001	1057006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1893	NC_000962	CG	4	8	1093278	1093285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1894	NC_000962	CCGG	2	8	1093318	1093325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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