MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000962	GGT	2	6	677004	677009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_000962	GC	3	6	677010	677015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_000962	TCG	2	6	677021	677026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_000962	CGG	2	6	677054	677059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_000962	GCG	2	6	677066	677071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_000962	CCA	2	6	677080	677085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_000962	CGGC	2	8	677100	677107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_000962	CAA	2	6	677671	677676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_000962	AT	3	6	677678	677683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_000962	GTA	2	6	677694	677699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_000962	TGC	2	6	678346	678351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_000962	GC	3	6	679077	679082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_000962	CCGG	2	8	679106	679113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_000962	GC	3	6	679146	679151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_000962	TTCA	2	8	684392	684399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_000962	CGG	2	6	694806	694811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_000962	GCT	2	6	695503	695508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_000962	CGC	2	6	695513	695518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_000962	GCT	2	6	695562	695567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_000962	TGG	2	6	695588	695593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_000962	GC	3	6	695615	695620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_000962	CGGA	2	8	695622	695629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_000962	GCC	2	6	695631	695636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_000962	CAT	2	6	696979	696984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_000962	TCCG	2	8	696994	697001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_000962	CGG	2	6	697003	697008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_000962	CGA	2	6	697025	697030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_000962	GCT	2	6	697046	697051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_000962	CGGG	2	8	697086	697093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_000962	TGG	2	6	697102	697107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_000962	GTT	2	6	697133	697138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_000962	CCG	2	6	697849	697854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_000962	CGA	2	6	697867	697872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_000962	GCG	2	6	697887	697892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_000962	CGG	2	6	698487	698492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_000962	TTC	2	6	698495	698500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_000962	GCG	2	6	698517	698522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_000962	GGC	2	6	698995	699000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_000962	GAG	2	6	700230	700235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_000962	CGC	2	6	701215	701220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_000962	ACC	2	6	701223	701228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_000962	CGT	2	6	701252	701257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_000962	CACGG	2	10	701305	701314	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1044	NC_000962	GCG	2	6	702781	702786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_000962	CG	3	6	704136	704141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_000962	GCG	2	6	704153	704158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_000962	GTC	2	6	704160	704165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_000962	CCCA	2	8	704221	704228	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1049	NC_000962	CGA	2	6	704287	704292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_000962	TGG	2	6	704307	704312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_000962	ACCG	2	8	704318	704325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_000962	GCA	2	6	704388	704393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_000962	CCG	2	6	704449	704454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_000962	TCG	2	6	704480	704485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_000962	GCG	2	6	704600	704605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_000962	GAC	2	6	704613	704618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_000962	CGA	2	6	704627	704632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_000962	TCG	2	6	704662	704667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_000962	ACG	2	6	704671	704676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_000962	GCC	2	6	704739	704744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_000962	GCA	2	6	705931	705936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_000962	CCGC	2	8	706933	706940	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1063	NC_000962	CGG	2	6	711422	711427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_000962	GCC	2	6	711436	711441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_000962	GGTC	2	8	713970	713977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_000962	GC	3	6	714051	714056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_000962	CGC	2	6	714070	714075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_000962	GCC	2	6	714133	714138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_000962	TCA	2	6	715310	715315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_000962	ACG	2	6	715339	715344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_000962	GAC	2	6	715358	715363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_000962	CTA	2	6	716389	716394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_000962	CGC	2	6	717080	717085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_000962	GTT	2	6	717111	717116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_000962	CGT	2	6	717932	717937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_000962	TC	3	6	718705	718710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_000962	TGT	2	6	718715	718720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_000962	CGG	2	6	718753	718758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_000962	ATG	2	6	719919	719924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_000962	CGCCGT	2	12	719925	719936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_000962	CGA	2	6	719978	719983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_000962	CGA	2	6	719998	720003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_000962	CGGC	2	8	728327	728334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_000962	CATG	2	8	728341	728348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_000962	CTT	2	6	728409	728414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_000962	TCA	2	6	728457	728462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_000962	GCC	2	6	728498	728503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_000962	AC	3	6	728513	728518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_000962	GGA	2	6	728527	728532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_000962	CACC	2	8	728573	728580	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1091	NC_000962	ATCAG	2	10	729291	729300	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_000962	GCTG	2	8	730238	730245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_000962	CGC	2	6	731058	731063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_000962	GAC	2	6	731380	731385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_000962	GGT	2	6	731413	731418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_000962	TGG	2	6	731420	731425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_000962	GC	3	6	731430	731435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_000962	CGG	2	6	731567	731572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_000962	ACA	2	6	731676	731681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_000962	AG	3	6	731699	731704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_000962	CCG	2	6	731880	731885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_000962	GACT	2	8	731905	731912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_000962	AGGT	2	8	731913	731920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_000962	GC	3	6	733383	733388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_000962	GTC	2	6	733414	733419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_000962	GC	3	6	733452	733457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_000962	CTGGT	2	10	733496	733505	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1108	NC_000962	TGCC	2	8	733508	733515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_000962	AGC	2	6	733546	733551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_000962	CTG	2	6	733594	733599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_000962	CGA	3	9	733612	733620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_000962	TGG	2	6	733665	733670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_000962	CCA	2	6	733686	733691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_000962	AG	3	6	734237	734242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_000962	CAG	2	6	734973	734978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_000962	CA	3	6	734986	734991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_000962	AAGG	2	8	735001	735008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_000962	CGCA	2	8	736254	736261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_000962	TCC	2	6	738153	738158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_000962	CAG	2	6	738177	738182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_000962	GCC	2	6	739266	739271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_000962	ACCC	2	8	742662	742669	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1123	NC_000962	GCGAC	2	10	747963	747972	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1124	NC_000962	GCG	2	6	747981	747986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_000962	GACCG	2	10	748029	748038	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1126	NC_000962	AGG	2	6	748128	748133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_000962	GCA	2	6	748139	748144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_000962	CCG	2	6	748145	748150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_000962	GC	4	8	748151	748158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_000962	TCG	2	6	748201	748206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_000962	GGT	2	6	748213	748218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_000962	CGT	2	6	748230	748235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1134	NC_000962	AGG	2	6	748265	748270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_000962	GCG	2	6	863247	863252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_000962	CGG	3	9	887123	887131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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