MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_000962	CGA	2	6	4287999	4288004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_000962	TGC	2	6	4288012	4288017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_000962	CCA	2	6	4288022	4288027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_000962	TGC	2	6	4288034	4288039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_000962	CGT	2	6	4288109	4288114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_000962	CAT	2	6	4288185	4288190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_000962	ACG	2	6	4288218	4288223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_000962	GTG	2	6	4291570	4291575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_000962	CAG	2	6	4291597	4291602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_000962	GCG	2	6	4293211	4293216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_000962	TGG	2	6	4299659	4299664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_000962	GC	4	8	4299770	4299777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_000962	GCCGG	2	10	4299788	4299797	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8014	NC_000962	GC	3	6	4305751	4305756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_000962	CCGG	2	8	4306834	4306841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8016	NC_000962	ACT	2	6	4308924	4308929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_000962	GGC	2	6	4308949	4308954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_000962	CCG	2	6	4309021	4309026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8019	NC_000962	CGGG	2	8	4310835	4310842	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_000962	ACG	2	6	4312683	4312688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_000962	AGG	2	6	4312753	4312758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_000962	GCC	2	6	4313550	4313555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_000962	AGG	2	6	4314080	4314085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_000962	TTA	2	6	4314086	4314091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_000962	AGTA	2	8	4314124	4314131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_000962	AGGC	2	8	4316664	4316671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8027	NC_000962	GC	3	6	4316688	4316693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8028	NC_000962	CTAC	2	8	4316723	4316730	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_000962	CGA	2	6	4316775	4316780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_000962	AGC	2	6	4316927	4316932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_000962	GCCC	2	8	4316935	4316942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8032	NC_000962	CA	3	6	4316973	4316978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_000962	CCA	2	6	4317042	4317047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_000962	TTA	2	6	4317059	4317064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_000962	CGT	2	6	4317100	4317105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_000962	CA	3	6	4317140	4317145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_000962	CGC	2	6	4317169	4317174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_000962	GCC	2	6	4317228	4317233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8039	NC_000962	C	6	6	4317357	4317362	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8040	NC_000962	GGT	2	6	4317381	4317386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_000962	TTG	2	6	4317400	4317405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_000962	TCG	2	6	4317457	4317462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_000962	AGCC	2	8	4317484	4317491	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8044	NC_000962	GT	3	6	4317556	4317561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_000962	CGG	2	6	4317780	4317785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_000962	CGA	2	6	4317819	4317824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_000962	CGGC	2	8	4317847	4317854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_000962	GGC	2	6	4317909	4317914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_000962	ACC	2	6	4317916	4317921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_000962	CGT	2	6	4317950	4317955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_000962	TCG	2	6	4317956	4317961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_000962	GCGG	2	8	4318064	4318071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8053	NC_000962	TCA	2	6	4318134	4318139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_000962	GAA	2	6	4318179	4318184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_000962	GGA	2	6	4318188	4318193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_000962	AAG	2	6	4318239	4318244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_000962	AG	3	6	4318276	4318281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_000962	TCT	2	6	4318305	4318310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_000962	TGG	2	6	4318337	4318342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_000962	GTG	2	6	4318374	4318379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_000962	TGG	2	6	4318500	4318505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_000962	GCA	2	6	4318523	4318528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_000962	ATC	2	6	4318556	4318561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_000962	CG	3	6	4318577	4318582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_000962	CGC	2	6	4318591	4318596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_000962	GAT	2	6	4318609	4318614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_000962	CCGG	2	8	4318623	4318630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_000962	CACG	2	8	4318669	4318676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8069	NC_000962	TGGG	2	8	4318686	4318693	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_000962	TCA	2	6	4318714	4318719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_000962	ACA	2	6	4318722	4318727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_000962	CAA	2	6	4318760	4318765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_000962	GCC	2	6	4319716	4319721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_000962	TTG	2	6	4319724	4319729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_000962	CGA	2	6	4319793	4319798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_000962	AC	5	10	4319931	4319940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_000962	CGA	2	6	4319969	4319974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_000962	AGC	2	6	4319984	4319989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_000962	GCA	2	6	4320008	4320013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_000962	ACA	2	6	4320014	4320019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_000962	ACGGC	2	10	4320022	4320031	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8082	NC_000962	AGC	2	6	4320032	4320037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_000962	CCG	2	6	4320136	4320141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8084	NC_000962	TCGG	2	8	4320232	4320239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_000962	CCGG	2	8	4320301	4320308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8086	NC_000962	CCT	2	6	4320346	4320351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_000962	CTT	3	9	4320395	4320403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_000962	CCCA	2	8	4320405	4320412	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8089	NC_000962	CA	3	6	4320429	4320434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_000962	GTT	2	6	4320580	4320585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_000962	AGCC	2	8	4320629	4320636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8092	NC_000962	CG	3	6	4320655	4320660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8093	NC_000962	GAAG	2	8	4320689	4320696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_000962	ATTT	2	8	4321485	4321492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_000962	GCG	2	6	4322096	4322101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_000962	AGT	2	6	4322188	4322193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_000962	TCG	2	6	4322200	4322205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_000962	GTC	2	6	4322294	4322299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_000962	CG	3	6	4323267	4323272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_000962	TCG	2	6	4323314	4323319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_000962	G	7	7	4323355	4323361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_000962	ATAC	2	8	4323450	4323457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8103	NC_000962	ACCG	2	8	4323906	4323913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8104	NC_000962	GGGTTG	2	12	4323934	4323945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_000962	GGC	2	6	4324004	4324009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_000962	CGG	2	6	4324673	4324678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_000962	ATG	2	6	4325013	4325018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_000962	CGA	2	6	4325045	4325050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_000962	TGC	2	6	4325054	4325059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_000962	GTA	2	6	4327533	4327538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_000962	TCGG	2	8	4328207	4328214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8112	NC_000962	GCC	2	6	4328364	4328369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_000962	GC	3	6	4329995	4330000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8114	NC_000962	CAG	2	6	4336097	4336102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_000962	GCC	2	6	4336115	4336120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_000962	GCA	2	6	4336228	4336233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_000962	CGG	2	6	4336330	4336335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_000962	ACCG	2	8	4336361	4336368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8119	NC_000962	GCCA	2	8	4336431	4336438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8120	NC_000962	AAC	2	6	4336507	4336512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_000962	CGG	2	6	4336521	4336526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_000962	TGT	2	6	4336534	4336539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_000962	GCC	2	6	4336551	4336556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8124	NC_000962	CGA	2	6	4336558	4336563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_000962	C	6	6	4336577	4336582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8126	NC_000962	CAGC	2	8	4336627	4336634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_000962	AGTC	2	8	4336635	4336642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_000962	TCA	2	6	4336708	4336713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_000962	ATCG	2	8	4336750	4336757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8130	NC_000962	GAG	2	6	4336768	4336773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8132	NC_000962	CTGC	2	8	4338551	4338558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8228	NC_000962	CAA	2	6	4411467	4411472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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