MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000962	TGC	2	6	2957539	2957544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_000962	CGCC	2	8	2959219	2959226	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5503	NC_000962	TATC	2	8	2959252	2959259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_000962	CAC	2	6	2959264	2959269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_000962	CGC	2	6	2959870	2959875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_000962	AAG	2	6	2959911	2959916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_000962	GCC	2	6	2959979	2959984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_000962	CTC	2	6	2960027	2960032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_000962	GTTCGG	2	12	2960053	2960064	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5510	NC_000962	CAA	2	6	2960099	2960104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_000962	CCT	2	6	2962448	2962453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_000962	CG	3	6	2963457	2963462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_000962	TCG	2	6	2963480	2963485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_000962	CG	3	6	2963488	2963493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_000962	CGG	2	6	2963520	2963525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_000962	GTCAT	2	10	2964302	2964311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5517	NC_000962	CCG	2	6	2964366	2964371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_000962	CCG	2	6	2964878	2964883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_000962	CCG	2	6	2964911	2964916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_000962	CG	3	6	2964915	2964920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_000962	GC	3	6	2964937	2964942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_000962	CTTGC	2	10	2964954	2964963	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5523	NC_000962	GC	3	6	2965012	2965017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_000962	GCA	2	6	2965019	2965024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_000962	CTGCC	2	10	2965381	2965390	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5526	NC_000962	C	6	6	2965392	2965397	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5527	NC_000962	AT	3	6	2965864	2965869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_000962	AAC	2	6	2965917	2965922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_000962	TGC	2	6	2968423	2968428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_000962	CGG	2	6	2968473	2968478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_000962	CGG	2	6	2968859	2968864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_000962	GTG	2	6	2968868	2968873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_000962	TTCGA	2	10	2968920	2968929	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5534	NC_000962	CGT	2	6	2968943	2968948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_000962	ACC	2	6	2969010	2969015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_000962	ACA	2	6	2969055	2969060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_000962	TCA	2	6	2969172	2969177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_000962	CGGG	2	8	2969186	2969193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_000962	GAAAC	2	10	2969194	2969203	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5540	NC_000962	GC	3	6	2969231	2969236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_000962	CGC	2	6	2969243	2969248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_000962	TC	3	6	2969251	2969256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_000962	AGG	2	6	2969305	2969310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_000962	TGA	2	6	2969330	2969335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_000962	GTC	2	6	2969349	2969354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_000962	CAC	2	6	2969374	2969379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_000962	ACG	2	6	2969386	2969391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_000962	AGC	2	6	2969450	2969455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_000962	GCC	2	6	2969467	2969472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_000962	AAT	2	6	2969477	2969482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_000962	GAG	2	6	2969575	2969580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_000962	CAG	3	9	2969619	2969627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_000962	TG	3	6	2969687	2969692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_000962	TCG	2	6	2969712	2969717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_000962	CGA	2	6	2969732	2969737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_000962	TCGT	2	8	2969740	2969747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_000962	GC	3	6	2969749	2969754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_000962	GTG	2	6	2969869	2969874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_000962	GCC	2	6	2970086	2970091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_000962	GGA	2	6	2970108	2970113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_000962	TGC	2	6	2971564	2971569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_000962	GGC	2	6	2971594	2971599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_000962	GCG	2	6	2971613	2971618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_000962	GCT	2	6	2971634	2971639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_000962	CCG	2	6	2972028	2972033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_000962	CGG	2	6	2972051	2972056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_000962	TCAGA	2	10	2973426	2973435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5568	NC_000962	CGG	2	6	2973465	2973470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_000962	GGC	2	6	2973492	2973497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_000962	CG	3	6	2973535	2973540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_000962	GCT	3	9	2973573	2973581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5573	NC_000962	GCC	2	6	2973777	2973782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_000962	GA	3	6	2975235	2975240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_000962	CG	3	6	2975807	2975812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_000962	GGC	2	6	2975831	2975836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5578	NC_000962	CGG	2	6	2975879	2975884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_000962	CA	4	8	2975912	2975919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_000962	C	7	7	2976559	2976565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5583	NC_000962	GC	3	6	2979310	2979315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_000962	GTC	2	6	2980820	2980825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_000962	GCTT	2	8	2980873	2980880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5586	NC_000962	TGT	2	6	2980901	2980906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_000962	GACC	2	8	2981774	2981781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_000962	GCC	2	6	2981793	2981798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_000962	TGT	2	6	2981830	2981835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5596	NC_000962	GT	3	6	2982542	2982547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_000962	TGG	2	6	2982671	2982676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_000962	GCGA	2	8	2984656	2984663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5600	NC_000962	CCCCT	2	10	2984664	2984673	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5601	NC_000962	GAG	2	6	2984721	2984726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5603	NC_000962	TCG	2	6	2987668	2987673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_000962	GCGG	2	8	2989277	2989284	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_000962	GCG	2	6	2990601	2990606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5607	NC_000962	TGC	2	6	2995072	2995077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5609	NC_000962	CGG	2	6	2995976	2995981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5613	NC_000962	CCG	2	6	2996061	2996066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_000962	CGA	2	6	2996068	2996073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_000962	GAG	3	9	2996090	2996098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_000962	GCA	2	6	2999982	2999987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_000962	C	7	7	2999989	2999995	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5618	NC_000962	GCC	2	6	3000012	3000017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_000962	GC	3	6	3000058	3000063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_000962	GAC	2	6	3001936	3001941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_000962	GGA	2	6	3001971	3001976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5623	NC_000962	GCTGC	2	10	3005777	3005786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5624	NC_000962	ACG	2	6	3005804	3005809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5626	NC_000962	CTC	2	6	3007071	3007076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_000962	TCG	2	6	3007096	3007101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_000962	CTC	2	6	3007124	3007129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5629	NC_000962	TCG	2	6	3007149	3007154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5631	NC_000962	TCG	2	6	3007202	3007207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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