MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 8228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_000962	GAA	2	6	2680082	2680087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_000962	TCG	2	6	2680093	2680098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_000962	GCG	2	6	2680121	2680126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_000962	ACCC	2	8	2680132	2680139	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5005	NC_000962	GCAG	2	8	2680186	2680193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_000962	GCTA	2	8	2680279	2680286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_000962	TCAC	2	8	2680325	2680332	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_000962	CGA	2	6	2680354	2680359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_000962	AG	3	6	2680443	2680448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_000962	CGA	2	6	2680453	2680458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_000962	GAA	2	6	2680485	2680490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_000962	CGA	2	6	2680505	2680510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_000962	ACC	2	6	2680572	2680577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_000962	ACT	2	6	2680582	2680587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_000962	CGGT	2	8	2680602	2680609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_000962	AC	3	6	2680611	2680616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_000962	G	6	6	2680624	2680629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_000962	CGC	2	6	2680739	2680744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_000962	TGCC	2	8	2683170	2683177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_000962	ATC	2	6	2683193	2683198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_000962	AGT	2	6	2684314	2684319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_000962	ATCC	3	12	2684391	2684402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_000962	TTG	2	6	2684407	2684412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_000962	ATC	2	6	2684423	2684428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_000962	CCAT	2	8	2684465	2684472	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_000962	CCG	2	6	2684491	2684496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_000962	TGG	2	6	2684530	2684535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_000962	CGG	2	6	2684538	2684543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_000962	GCG	2	6	2684651	2684656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_000962	TCT	2	6	2687975	2687980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_000962	CTG	2	6	2687988	2687993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_000962	CGG	2	6	2689951	2689956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_000962	AACG	2	8	2689964	2689971	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_000962	CG	3	6	2690044	2690049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_000962	CGG	2	6	2692173	2692178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_000962	TGGC	2	8	2692199	2692206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_000962	CGG	2	6	2692448	2692453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_000962	CGG	2	6	2692462	2692467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_000962	CGA	2	6	2692488	2692493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_000962	GGCG	2	8	2692503	2692510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_000962	CCG	2	6	2693894	2693899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_000962	GGCA	2	8	2698257	2698264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_000962	GT	3	6	2698274	2698279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_000962	CCG	2	6	2698294	2698299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_000962	GCT	2	6	2698325	2698330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_000962	GCAC	2	8	2698343	2698350	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_000962	GAT	3	9	2698400	2698408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_000962	C	6	6	2698433	2698438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5049	NC_000962	ACGG	2	8	2698487	2698494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_000962	GCAC	2	8	2698519	2698526	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_000962	CCGGG	2	10	2703840	2703849	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5052	NC_000962	CGA	2	6	2703909	2703914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_000962	GCC	2	6	2703920	2703925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_000962	GAG	2	6	2703938	2703943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_000962	CGA	2	6	2703966	2703971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_000962	GCC	2	6	2703977	2703982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_000962	GAG	2	6	2703995	2704000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_000962	GGT	2	6	2704452	2704457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_000962	GCG	2	6	2704491	2704496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_000962	CGG	2	6	2704549	2704554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_000962	GCC	2	6	2704586	2704591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_000962	ACCA	2	8	2705532	2705539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_000962	CGAT	2	8	2705555	2705562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_000962	AAG	2	6	2705568	2705573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_000962	CCCG	2	8	2705658	2705665	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5066	NC_000962	GCC	2	6	2705673	2705678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_000962	TCG	2	6	2705691	2705696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_000962	CGC	2	6	2705818	2705823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_000962	CTG	2	6	2705855	2705860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_000962	GGT	2	6	2705913	2705918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_000962	TCA	2	6	2705952	2705957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_000962	GC	3	6	2713819	2713824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_000962	ACG	2	6	2713825	2713830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_000962	CTG	2	6	2713844	2713849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_000962	AAC	2	6	2713924	2713929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_000962	CG	3	6	2714013	2714018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_000962	CCAT	2	8	2714027	2714034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_000962	GC	3	6	2714056	2714061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_000962	CACGTG	2	12	2715361	2715372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_000962	ACG	2	6	2715379	2715384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_000962	CGA	2	6	2715452	2715457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_000962	TCGCT	2	10	2716357	2716366	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5083	NC_000962	TCG	2	6	2716372	2716377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_000962	GCCA	2	8	2718883	2718890	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_000962	AGC	2	6	2718900	2718905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_000962	GCA	2	6	2718916	2718921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_000962	ATC	2	6	2718950	2718955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_000962	GAGGTC	2	12	2718973	2718984	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5089	NC_000962	GCG	2	6	2719075	2719080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_000962	CG	3	6	2719434	2719439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_000962	GCT	2	6	2719457	2719462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_000962	CGC	2	6	2719500	2719505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5093	NC_000962	CCG	2	6	2720720	2720725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_000962	GT	3	6	2720759	2720764	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_000962	CAG	2	6	2721780	2721785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_000962	CAA	2	6	2721802	2721807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_000962	CAT	2	6	2721835	2721840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_000962	GCCC	2	8	2721855	2721862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5099	NC_000962	GAC	2	6	2725513	2725518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_000962	GGT	2	6	2725552	2725557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_000962	GCC	2	6	2725641	2725646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_000962	TCG	2	6	2725671	2725676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5105	NC_000962	CCG	2	6	2725770	2725775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5108	NC_000962	GCA	2	6	2725822	2725827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5110	NC_000962	GCT	2	6	2725907	2725912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5113	NC_000962	CTG	2	6	2726008	2726013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5115	NC_000962	CG	3	6	2726043	2726048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_000962	CGGC	2	8	2726060	2726067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_000962	GGC	2	6	2726079	2726084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_000962	AT	3	6	2726106	2726111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_000962	TGA	3	9	2726176	2726184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5121	NC_000962	GTT	2	6	2727931	2727936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5124	NC_000962	ACC	2	6	2728319	2728324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_000962	GTT	2	6	2728326	2728331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_000962	CTG	2	6	2732762	2732767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_000962	GCT	2	6	2732778	2732783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_000962	ACG	2	6	2732786	2732791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_000962	GCA	2	6	2732802	2732807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_000962	GCCCA	2	10	2732817	2732826	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5131	NC_000962	ATC	2	6	2732829	2732834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_000962	CCA	2	6	2732850	2732855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_000962	TCG	2	6	2732902	2732907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5135	NC_000962	GGT	2	6	2732926	2732931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_000962	GGT	2	6	2732946	2732951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_000962	CCGGCA	2	12	2733024	2733035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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5141	NC_000962	ACC	2	6	2734184	2734189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5142	NC_000962	GCA	2	6	2734258	2734263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5146	NC_000962	CG	4	8	2740403	2740410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5147	NC_000962	GCG	2	6	2740416	2740421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5156	NC_000962	GCC	2	6	2745288	2745293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5157	NC_000962	CGG	2	6	2750228	2750233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5160	NC_000962	TGC	2	6	2752256	2752261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5161	NC_000962	GTG	2	6	2752671	2752676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_000962	CCA	2	6	2752710	2752715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5165	NC_000962	CAG	2	6	2752840	2752845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5167	NC_000962	CGC	2	6	2756784	2756789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5168	NC_000962	CATTT	2	10	2756822	2756831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5256	NC_000962	TCC	2	6	2821600	2821605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5257	NC_000962	GCACCC	2	12	2822394	2822405	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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5261	NC_000962	CGGC	2	8	2827839	2827846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5262	NC_000962	TCAC	2	8	2827918	2827925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5263	NC_000962	GGC	2	6	2827934	2827939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5264	NC_000962	CCG	2	6	2827973	2827978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5265	NC_000962	CGC	2	6	2828038	2828043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5267	NC_000962	CCG	2	6	2828072	2828077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5268	NC_000962	TGCC	2	8	2828149	2828156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5269	NC_000962	ACTC	2	8	2828192	2828199	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5270	NC_000962	TGC	2	6	2828298	2828303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5281	NC_000962	AT	3	6	2830092	2830097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_000962	GAAT	2	8	2830111	2830118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5380	NC_000962	CG	3	6	2880029	2880034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5381	NC_000962	CCG	2	6	2881060	2881065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5382	NC_000962	CTGAT	2	10	2881236	2881245	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5383	NC_000962	GCC	2	6	2881281	2881286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5388	NC_000962	AGC	2	6	2881711	2881716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5389	NC_000962	TCG	2	6	2881738	2881743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5391	NC_000962	CGAC	2	8	2882189	2882196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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