MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 3924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000916	AAACC	2	10	1604002	1604011	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3502	NC_000916	TTAT	2	8	1604017	1604024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_000916	TGGCT	2	10	1604038	1604047	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3504	NC_000916	TGA	2	6	1604056	1604061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_000916	GAG	2	6	1604092	1604097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_000916	GCC	2	6	1604140	1604145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_000916	CTGAA	2	10	1604200	1604209	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3508	NC_000916	TAG	2	6	1604216	1604221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_000916	GGA	2	6	1604224	1604229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_000916	GGA	2	6	1604277	1604282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_000916	CAT	2	6	1604294	1604299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_000916	GTG	2	6	1604306	1604311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_000916	GGTTG	2	10	1604352	1604361	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_000916	TCCTAA	2	12	1604487	1604498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_000916	CGGCA	2	10	1604599	1604608	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3516	NC_000916	GGAA	2	8	1604610	1604617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_000916	GCTG	2	8	1604663	1604670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_000916	GTGTC	2	10	1604675	1604684	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3519	NC_000916	AAG	2	6	1604733	1604738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_000916	GCA	3	9	1604776	1604784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_000916	CTGTG	2	10	1604786	1604795	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3522	NC_000916	GTG	2	6	1604943	1604948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_000916	TGG	2	6	1605018	1605023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_000916	GA	3	6	1605142	1605147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_000916	AAC	2	6	1605150	1605155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_000916	AGC	2	6	1605237	1605242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_000916	CAC	2	6	1605333	1605338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_000916	TG	3	6	1605342	1605347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_000916	GTA	3	9	1605428	1605436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_000916	GCA	2	6	1605437	1605442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_000916	GTGAG	2	10	1605445	1605454	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_000916	CCG	2	6	1605463	1605468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_000916	TTG	2	6	1605720	1605725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_000916	GGT	2	6	1605726	1605731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_000916	CTT	2	6	1605766	1605771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_000916	GCCA	2	8	1605896	1605903	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_000916	G	7	7	1605928	1605934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_000916	TAA	2	6	1605945	1605950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_000916	CTAG	2	8	1605962	1605969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_000916	GT	3	6	1605979	1605984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_000916	CGG	2	6	1606053	1606058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_000916	GCT	2	6	1606166	1606171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_000916	CTG	2	6	1606236	1606241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_000916	GTG	2	6	1606304	1606309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_000916	ACC	2	6	1606326	1606331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_000916	C	6	6	1606353	1606358	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3547	NC_000916	G	7	7	1606364	1606370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_000916	GGC	2	6	1606398	1606403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_000916	GC	3	6	1606425	1606430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_000916	CTA	2	6	1606502	1606507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_000916	TCG	2	6	1606555	1606560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_000916	GGT	2	6	1606604	1606609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_000916	GCA	3	9	1606678	1606686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_000916	GTT	2	6	1606699	1606704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_000916	CGT	2	6	1606740	1606745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_000916	GGTT	2	8	1606752	1606759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_000916	GT	3	6	1606774	1606779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_000916	GGT	2	6	1606796	1606801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_000916	GGC	2	6	1606867	1606872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_000916	GGC	2	6	1606931	1606936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_000916	AGA	2	6	1606952	1606957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_000916	TGTT	2	8	1606960	1606967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_000916	GTT	2	6	1607008	1607013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_000916	T	6	6	1607033	1607038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_000916	TGT	2	6	1607060	1607065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_000916	T	7	7	1607070	1607076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_000916	GT	4	8	1607100	1607107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_000916	T	7	7	1607119	1607125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_000916	T	6	6	1607133	1607138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_000916	GT	3	6	1607139	1607144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_000916	GGT	2	6	1607145	1607150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_000916	AGT	2	6	1607199	1607204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_000916	CTG	2	6	1607211	1607216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_000916	GT	3	6	1607225	1607230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_000916	T	6	6	1607238	1607243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_000916	ACC	2	6	1607271	1607276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_000916	TCA	2	6	1607284	1607289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_000916	TCA	2	6	1607293	1607298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_000916	AGT	2	6	1607358	1607363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_000916	CTG	2	6	1607370	1607375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_000916	GT	3	6	1607384	1607389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_000916	T	6	6	1607397	1607402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_000916	GCCA	2	8	1607425	1607432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_000916	A	6	6	1607442	1607447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_000916	ATG	2	6	1607514	1607519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_000916	AGA	2	6	1607542	1607547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_000916	CTGC	2	8	1607566	1607573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_000916	GGGA	2	8	1607589	1607596	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_000916	TAA	2	6	1611615	1611620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_000916	T	7	7	1611624	1611630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_000916	TAA	2	6	1611654	1611659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_000916	AT	4	8	1615494	1615501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_000916	AAT	2	6	1615587	1615592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_000916	GCT	2	6	1615607	1615612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_000916	TCC	2	6	1618064	1618069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_000916	AAT	2	6	1619429	1619434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_000916	AAT	2	6	1619439	1619444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_000916	TCC	2	6	1619473	1619478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_000916	GGA	2	6	1619482	1619487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_000916	T	7	7	1619542	1619548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_000916	GGC	2	6	1620160	1620165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_000916	TTA	2	6	1620195	1620200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_000916	GCT	2	6	1622446	1622451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_000916	CT	3	6	1622453	1622458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_000916	GT	3	6	1622892	1622897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_000916	TAT	2	6	1624918	1624923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_000916	TC	3	6	1625504	1625509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_000916	CTG	2	6	1626738	1626743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_000916	AGTT	2	8	1626758	1626765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_000916	TGGA	2	8	1626799	1626806	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_000916	T	6	6	1626841	1626846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_000916	TGG	2	6	1626881	1626886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_000916	ACCCAT	2	12	1626912	1626923	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_000916	GCT	2	6	1629007	1629012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_000916	TGA	2	6	1629776	1629781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_000916	TTAT	2	8	1629787	1629794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_000916	ATT	2	6	1630105	1630110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_000916	CTG	2	6	1630622	1630627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_000916	AG	3	6	1631553	1631558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_000916	TGT	2	6	1631592	1631597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_000916	ACCTGA	2	12	1632516	1632527	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_000916	CAC	3	9	1633029	1633037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_000916	T	6	6	1633040	1633045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_000916	ATC	2	6	1633046	1633051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_000916	TCA	2	6	1633064	1633069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_000916	C	6	6	1635901	1635906	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3627	NC_000916	CATC	2	8	1636934	1636941	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_000916	CCT	2	6	1639410	1639415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_000916	CT	4	8	1640278	1640285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_000916	ATCC	2	8	1641351	1641358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3632	NC_000916	TTC	2	6	1642858	1642863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3898	NC_000916	TTCC	2	8	1738818	1738825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3899	NC_000916	AAT	2	6	1740960	1740965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3900	NC_000916	ATC	2	6	1740966	1740971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3901	NC_000916	AAT	2	6	1741000	1741005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3902	NC_000916	TC	3	6	1743213	1743218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3903	NC_000916	AGGTG	2	10	1744866	1744875	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3904	NC_000916	CTTC	2	8	1744887	1744894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3905	NC_000916	TCATA	2	10	1744899	1744908	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3906	NC_000916	AG	3	6	1744927	1744932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3907	NC_000916	AAT	2	6	1744948	1744953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3908	NC_000916	TA	3	6	1745008	1745013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3909	NC_000916	AAC	2	6	1745035	1745040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3910	NC_000916	TTC	2	6	1745044	1745049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3911	NC_000916	ATTT	2	8	1745419	1745426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3912	NC_000916	ATA	2	6	1745427	1745432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3913	NC_000916	AAT	2	6	1745438	1745443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3914	NC_000916	TAT	2	6	1745444	1745449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3916	NC_000916	GGA	2	6	1745467	1745472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3918	NC_000916	T	7	7	1748222	1748228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3919	NC_000916	AT	3	6	1750569	1750574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3920	NC_000916	TGAA	2	8	1750582	1750589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3921	NC_000916	TAG	2	6	1750672	1750677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3922	NC_000916	GA	4	8	1750682	1750689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3923	NC_000916	AGG	2	6	1750690	1750695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3924	NC_000916	TGC	2	6	1750726	1750731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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