MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021200	ACA	2	6	130981	130986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074509
3002	NC_021200	GC	3	6	131007	131012	0 %	0 %	50 %	50 %	499074509
3003	NC_021200	CGC	2	6	131017	131022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074509
3004	NC_021200	GCA	2	6	131050	131055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074509
3005	NC_021200	GGT	2	6	131152	131157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074509
3006	NC_021200	CCAC	2	8	131170	131177	25 %	0 %	0 %	75 %	499074509
3007	NC_021200	GAA	2	6	131204	131209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074509
3008	NC_021200	GGCCG	2	10	131211	131220	0 %	0 %	60 %	40 %	499074509
3009	NC_021200	GCT	2	6	131239	131244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074509
3010	NC_021200	GCTG	2	8	131263	131270	0 %	25 %	50 %	25 %	499074509
3011	NC_021200	GC	3	6	131389	131394	0 %	0 %	50 %	50 %	499074509
3012	NC_021200	GAT	2	6	131417	131422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074509
3013	NC_021200	CGC	2	6	131423	131428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074509
3014	NC_021200	CG	3	6	131446	131451	0 %	0 %	50 %	50 %	499074509
3015	NC_021200	GCC	2	6	131842	131847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074510
3016	NC_021200	GGT	2	6	131865	131870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074510
3017	NC_021200	GGT	2	6	131890	131895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074510
3018	NC_021200	GGCG	2	8	131931	131938	0 %	0 %	75 %	25 %	499074510
3019	NC_021200	TC	3	6	131971	131976	0 %	50 %	0 %	50 %	499074510
3020	NC_021200	GCG	2	6	132013	132018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074510
3021	NC_021200	CG	3	6	132051	132056	0 %	0 %	50 %	50 %	499074510
3022	NC_021200	CGG	3	9	132144	132152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074510
3023	NC_021200	TCG	2	6	132167	132172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074510
3024	NC_021200	TGCT	2	8	132251	132258	0 %	50 %	25 %	25 %	499074510
3025	NC_021200	GCT	2	6	132268	132273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074510
3026	NC_021200	GCC	2	6	132295	132300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074510
3027	NC_021200	CG	3	6	132304	132309	0 %	0 %	50 %	50 %	499074510
3028	NC_021200	GCC	3	9	132325	132333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074510
3029	NC_021200	CTT	2	6	132352	132357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074510
3030	NC_021200	CCG	2	6	132400	132405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074510
3031	NC_021200	CCAG	2	8	132429	132436	25 %	0 %	25 %	50 %	499074510
3032	NC_021200	CAG	2	6	132496	132501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074510
3033	NC_021200	GC	3	6	132511	132516	0 %	0 %	50 %	50 %	499074510
3034	NC_021200	CGG	2	6	132527	132532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074510
3035	NC_021200	TGA	2	6	132546	132551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074510
3036	NC_021200	GGT	2	6	132664	132669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074510
3037	NC_021200	GCT	2	6	132692	132697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074510
3038	NC_021200	CGC	2	6	132698	132703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074510
3039	NC_021200	TCA	2	6	132716	132721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074510
3040	NC_021200	ACG	2	6	132722	132727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074510
3041	NC_021200	CAGCCG	2	12	132736	132747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074510
3042	NC_021200	GCA	2	6	132921	132926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3043	NC_021200	GC	3	6	132952	132957	0 %	0 %	50 %	50 %	499074511
3044	NC_021200	GCG	2	6	132973	132978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3045	NC_021200	ATC	2	6	132980	132985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074511
3046	NC_021200	CTG	2	6	133003	133008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3047	NC_021200	CGT	2	6	133012	133017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3048	NC_021200	TCG	2	6	133082	133087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3049	NC_021200	CGT	2	6	133095	133100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3050	NC_021200	CCT	2	6	133119	133124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074511
3051	NC_021200	AAC	2	6	133157	133162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074511
3052	NC_021200	GCGAAG	2	12	133172	133183	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	499074511
3053	NC_021200	CTG	2	6	133195	133200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3054	NC_021200	GC	3	6	133253	133258	0 %	0 %	50 %	50 %	499074511
3055	NC_021200	AGC	2	6	133259	133264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3056	NC_021200	GCCCA	2	10	133327	133336	20 %	0 %	20 %	60 %	499074511
3057	NC_021200	TCG	3	9	133364	133372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3058	NC_021200	CGT	2	6	133377	133382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3059	NC_021200	CGG	2	6	133385	133390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3060	NC_021200	GCA	2	6	133488	133493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3061	NC_021200	GGC	2	6	133546	133551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3062	NC_021200	TGA	2	6	133572	133577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074511
3063	NC_021200	CTCGCC	2	12	133582	133593	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	499074511
3064	NC_021200	CAG	2	6	133624	133629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3065	NC_021200	GCG	2	6	133633	133638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3066	NC_021200	CCA	2	6	133698	133703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074511
3067	NC_021200	GGC	2	6	133728	133733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3068	NC_021200	GAC	2	6	133753	133758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3069	NC_021200	CGTG	2	8	133785	133792	0 %	25 %	50 %	25 %	499074511
3070	NC_021200	GCGT	2	8	133808	133815	0 %	25 %	50 %	25 %	499074511
3071	NC_021200	GCG	2	6	133874	133879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3072	NC_021200	CAC	2	6	133969	133974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074511
3073	NC_021200	CGG	2	6	134010	134015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3074	NC_021200	GAA	2	6	134017	134022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074511
3075	NC_021200	GCC	2	6	134044	134049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074511
3076	NC_021200	GTA	2	6	134101	134106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074511
3077	NC_021200	CGG	3	9	134115	134123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3078	NC_021200	CCCG	2	8	134131	134138	0 %	0 %	25 %	75 %	499074511
3079	NC_021200	GCC	2	6	134237	134242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074511
3080	NC_021200	TCG	2	6	134255	134260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3081	NC_021200	GCCCCA	2	12	134280	134291	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	499074511
3082	NC_021200	AGT	2	6	134316	134321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074511
3083	NC_021200	CAG	2	6	134410	134415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3084	NC_021200	GTC	2	6	134479	134484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074511
3085	NC_021200	GAA	2	6	134515	134520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074511
3086	NC_021200	CCG	2	6	134544	134549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074511
3087	NC_021200	GCG	2	6	134551	134556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3088	NC_021200	GCG	2	6	134566	134571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074511
3089	NC_021200	CGCTG	2	10	134762	134771	0 %	20 %	40 %	40 %	499074512
3090	NC_021200	TCA	2	6	134800	134805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074512
3091	NC_021200	ACC	2	6	134808	134813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074512
3092	NC_021200	CGA	2	6	134846	134851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3093	NC_021200	AGC	2	6	134854	134859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3094	NC_021200	GC	3	6	134898	134903	0 %	0 %	50 %	50 %	499074512
3095	NC_021200	TCG	2	6	134917	134922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3096	NC_021200	CGG	2	6	134974	134979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074512
3097	NC_021200	ATG	2	6	135025	135030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074512
3098	NC_021200	GGC	2	6	135072	135077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074512
3099	NC_021200	TGC	2	6	135202	135207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3100	NC_021200	GGCGCA	2	12	135215	135226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499074512
3101	NC_021200	CAG	2	6	135288	135293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3102	NC_021200	GAG	3	9	135303	135311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074512
3103	NC_021200	GTG	2	6	135330	135335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074512
3104	NC_021200	CGC	2	6	135386	135391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074512
3105	NC_021200	TCG	2	6	135460	135465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3106	NC_021200	ACG	2	6	135511	135516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3107	NC_021200	GAG	2	6	135543	135548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074512
3108	NC_021200	ACG	2	6	135595	135600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3109	NC_021200	AGC	2	6	135616	135621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3110	NC_021200	GCG	2	6	135622	135627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074512
3111	NC_021200	CGA	2	6	135632	135637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3112	NC_021200	TCG	2	6	135655	135660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074512
3113	NC_021200	GGCGC	2	10	135773	135782	0 %	0 %	60 %	40 %	499074513
3114	NC_021200	TGG	2	6	135790	135795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074513
3115	NC_021200	GCG	2	6	135807	135812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074513
3116	NC_021200	CAACAC	2	12	135885	135896	50 %	0 %	0 %	50 %	499074513
3117	NC_021200	GCC	2	6	135955	135960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074513
3118	NC_021200	GTC	2	6	136012	136017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074513
3119	NC_021200	GCG	2	6	136031	136036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074513
3120	NC_021200	CCA	2	6	136079	136084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074513
3121	NC_021200	GCG	2	6	136154	136159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074513
3122	NC_021200	ACC	2	6	136180	136185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074513
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3237	NC_021200	GCCG	2	8	139583	139590	0 %	0 %	50 %	50 %	499074515
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3241	NC_021200	CTG	2	6	139746	139751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074515
3242	NC_021200	CGG	2	6	139765	139770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074515
3243	NC_021200	GCC	3	9	139776	139784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074515
3244	NC_021200	GCTG	2	8	139792	139799	0 %	25 %	50 %	25 %	499074515
3245	NC_021200	GCC	2	6	139833	139838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074515
3246	NC_021200	GCG	3	9	139854	139862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074515
3247	NC_021200	GAC	2	6	139875	139880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074515
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3252	NC_021200	CTGGC	2	10	139959	139968	0 %	20 %	40 %	40 %	499074515
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3363	NC_021200	GCC	2	6	144074	144079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074520
3364	NC_021200	GCG	2	6	144096	144101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074520
3365	NC_021200	CCG	2	6	144102	144107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074520
3366	NC_021200	GCG	2	6	144138	144143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074520
3367	NC_021200	CG	3	6	144147	144152	0 %	0 %	50 %	50 %	499074520
3368	NC_021200	CTA	2	6	144160	144165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074520
3369	NC_021200	GACG	2	8	144176	144183	25 %	0 %	50 %	25 %	499074520
3370	NC_021200	GCGCT	2	10	144203	144212	0 %	20 %	40 %	40 %	499074520
3371	NC_021200	GGC	2	6	144247	144252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074520
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3373	NC_021200	GCT	2	6	144271	144276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074520
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3375	NC_021200	GCT	2	6	144304	144309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074520
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3381	NC_021200	ACG	2	6	144450	144455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074520
3382	NC_021200	CGA	2	6	144460	144465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074520
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3389	NC_021200	TCG	2	6	144757	144762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074521
3390	NC_021200	ACG	2	6	144797	144802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074521
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3392	NC_021200	CGC	2	6	144851	144856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074521
3393	NC_021200	GTC	2	6	144864	144869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074521
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3399	NC_021200	CGGTGG	2	12	145037	145048	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499074522
3400	NC_021200	TCG	2	6	145057	145062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074522
3401	NC_021200	TCG	2	6	145075	145080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074522
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3474	NC_021200	GATCC	2	10	147311	147320	20 %	20 %	20 %	40 %	499074523
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3480	NC_021200	TTG	2	6	147808	147813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074524
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3482	NC_021200	GGGT	2	8	147851	147858	0 %	25 %	75 %	0 %	499074524
3483	NC_021200	GCGG	2	8	147859	147866	0 %	0 %	75 %	25 %	499074524
3484	NC_021200	GCC	2	6	147874	147879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074524
3485	NC_021200	TGG	2	6	147940	147945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074524
3486	NC_021200	GGC	2	6	147948	147953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074524
3487	NC_021200	CCA	2	6	147992	147997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074524
3488	NC_021200	CAG	2	6	148065	148070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074524
3489	NC_021200	CGT	2	6	148085	148090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074524
3490	NC_021200	GCA	3	9	148094	148102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074524
3491	NC_021200	TCG	2	6	148148	148153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074524
3492	NC_021200	GTGGCG	2	12	148198	148209	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499074524
3493	NC_021200	CGG	3	9	148248	148256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074524
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3495	NC_021200	GCC	2	6	148349	148354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074524
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