MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_021200	AGG	2	6	1107440	1107445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075420
29503	NC_021200	GGT	2	6	1107485	1107490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075420
29504	NC_021200	G	6	6	1107491	1107496	0 %	0 %	100 %	0 %	499075420
29505	NC_021200	G	6	6	1107557	1107562	0 %	0 %	100 %	0 %	499075420
29506	NC_021200	GCG	2	6	1107572	1107577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075420
29507	NC_021200	CTG	2	6	1107595	1107600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075420
29508	NC_021200	AAG	2	6	1107640	1107645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075420
29509	NC_021200	GCC	2	6	1107678	1107683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075420
29510	NC_021200	CCA	3	9	1107719	1107727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075420
29511	NC_021200	GGAA	2	8	1107804	1107811	50 %	0 %	50 %	0 %	499075420
29512	NC_021200	GCG	2	6	1107837	1107842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075420
29513	NC_021200	GAG	2	6	1107865	1107870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075420
29514	NC_021200	GCC	3	9	1107892	1107900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075420
29515	NC_021200	GC	3	6	1107923	1107928	0 %	0 %	50 %	50 %	499075420
29516	NC_021200	CG	3	6	1107942	1107947	0 %	0 %	50 %	50 %	499075420
29517	NC_021200	GGC	2	6	1108008	1108013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075420
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29519	NC_021200	CGGC	2	8	1108123	1108130	0 %	0 %	50 %	50 %	499075421
29520	NC_021200	CGT	2	6	1108180	1108185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075421
29521	NC_021200	GCG	3	9	1108237	1108245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075421
29522	NC_021200	TTG	2	6	1108248	1108253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499075421
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29532	NC_021200	CGG	4	12	1108686	1108697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075422
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29544	NC_021200	CCG	3	9	1109455	1109463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075423
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29549	NC_021200	GCCG	3	12	1111527	1111538	0 %	0 %	50 %	50 %	499075424
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29551	NC_021200	CAT	2	6	1111712	1111717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075424
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29553	NC_021200	GCG	2	6	1111924	1111929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075424
29554	NC_021200	GATTCG	2	12	1111952	1111963	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	499075424
29555	NC_021200	CA	3	6	1111979	1111984	50 %	0 %	0 %	50 %	499075424
29556	NC_021200	GGC	2	6	1111986	1111991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075424
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29560	NC_021200	GCCG	2	8	1112192	1112199	0 %	0 %	50 %	50 %	499075424
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29572	NC_021200	CA	3	6	1112898	1112903	50 %	0 %	0 %	50 %	499075425
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29587	NC_021200	CAG	3	9	1113813	1113821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075427
29588	NC_021200	GCCGA	2	10	1113828	1113837	20 %	0 %	40 %	40 %	499075427
29589	NC_021200	GCG	2	6	1113874	1113879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075427
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29593	NC_021200	CGACG	2	10	1114064	1114073	20 %	0 %	40 %	40 %	499075427
29594	NC_021200	TGCT	2	8	1114092	1114099	0 %	50 %	25 %	25 %	499075427
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29598	NC_021200	GAG	2	6	1114164	1114169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075427
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29605	NC_021200	CGGC	2	8	1114448	1114455	0 %	0 %	50 %	50 %	499075427
29606	NC_021200	GCG	2	6	1114462	1114467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075427
29607	NC_021200	GC	3	6	1114520	1114525	0 %	0 %	50 %	50 %	499075427
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29616	NC_021200	CGT	2	6	1114781	1114786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075427
29617	NC_021200	GGA	2	6	1114862	1114867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075427
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29961	NC_021200	CGGC	2	8	1131479	1131486	0 %	0 %	50 %	50 %	499075445
29962	NC_021200	CGA	2	6	1131509	1131514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075445
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29992	NC_021200	ACC	2	6	1132282	1132287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075445
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