MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_021200	GCGG	2	8	108929	108936	0 %	0 %	75 %	25 %	499074493
2503	NC_021200	GCG	2	6	108941	108946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074493
2504	NC_021200	ATC	2	6	108962	108967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074493
2505	NC_021200	CGG	2	6	108978	108983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074493
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2509	NC_021200	ACC	2	6	109245	109250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074494
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2511	NC_021200	GCT	2	6	109314	109319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074494
2512	NC_021200	CTGC	2	8	109330	109337	0 %	25 %	25 %	50 %	499074494
2513	NC_021200	CCGGCG	2	12	109346	109357	0 %	0 %	50 %	50 %	499074494
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2522	NC_021200	CTT	2	6	109878	109883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074496
2523	NC_021200	TGG	2	6	109933	109938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074496
2524	NC_021200	GCT	2	6	109941	109946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074496
2525	NC_021200	CGC	4	12	110022	110033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074496
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2555	NC_021200	GCC	2	6	110635	110640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074496
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2606	NC_021200	TCGGC	2	10	112538	112547	0 %	20 %	40 %	40 %	499074496
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2612	NC_021200	TGG	2	6	112712	112717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074496
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2850	NC_021200	ACGCC	2	10	123455	123464	20 %	0 %	20 %	60 %	499074503
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2862	NC_021200	ACCG	2	8	124119	124126	25 %	0 %	25 %	50 %	499074504
2863	NC_021200	CGC	2	6	124224	124229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074505
2864	NC_021200	CAC	2	6	124243	124248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074505
2865	NC_021200	ACC	2	6	124258	124263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074505
2866	NC_021200	CTC	2	6	124293	124298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074505
2867	NC_021200	CCG	2	6	124420	124425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074505
2868	NC_021200	GCG	2	6	124507	124512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074505
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2870	NC_021200	G	6	6	124606	124611	0 %	0 %	100 %	0 %	499074505
2871	NC_021200	GGC	2	6	124642	124647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074505
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2875	NC_021200	CGG	2	6	124835	124840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074505
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2877	NC_021200	CTC	2	6	124887	124892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074505
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2879	NC_021200	CCG	2	6	124920	124925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074505
2880	NC_021200	TCG	2	6	125002	125007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074505
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2883	NC_021200	CCA	3	9	125042	125050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074505
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2885	NC_021200	GTC	2	6	125082	125087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074505
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2891	NC_021200	GTC	2	6	125289	125294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074505
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2894	NC_021200	CGA	2	6	125306	125311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074505
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2902	NC_021200	TCG	2	6	125571	125576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074505
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2982	NC_021200	TCG	3	9	130186	130194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074508
2983	NC_021200	CGGC	2	8	130331	130338	0 %	0 %	50 %	50 %	499074508
2984	NC_021200	GATC	2	8	130343	130350	25 %	25 %	25 %	25 %	499074508
2985	NC_021200	CTC	2	6	130377	130382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074508
2986	NC_021200	AGA	2	6	130385	130390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074508
2987	NC_021200	CGT	2	6	130409	130414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074508
2988	NC_021200	GTG	2	6	130422	130427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074508
2989	NC_021200	TCG	2	6	130432	130437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074508
2990	NC_021200	CCT	2	6	130487	130492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074508
2991	NC_021200	TCG	2	6	130519	130524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074508
2992	NC_021200	TCG	3	9	130633	130641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074508
2993	NC_021200	GCC	2	6	130710	130715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074508
2994	NC_021200	C	6	6	130753	130758	0 %	0 %	0 %	100 %	499074508
2995	NC_021200	GGTTC	2	10	130779	130788	0 %	40 %	40 %	20 %	499074508
2996	NC_021200	CCT	2	6	130795	130800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074509
2997	NC_021200	CGG	2	6	130843	130848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074509
2998	NC_021200	GCT	2	6	130885	130890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074509
2999	NC_021200	TCG	2	6	130902	130907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074509
3000	NC_021200	CAG	3	9	130967	130975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074509

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