MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_021200	ATG	2	6	1052374	1052379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075360
28003	NC_021200	TGCTC	2	10	1052405	1052414	0 %	40 %	20 %	40 %	499075360
28004	NC_021200	GGT	2	6	1052415	1052420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075360
28005	NC_021200	GGC	2	6	1052427	1052432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075360
28006	NC_021200	CGT	2	6	1052441	1052446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075360
28007	NC_021200	CGG	2	6	1052499	1052504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075360
28008	NC_021200	CAGC	2	8	1052520	1052527	25 %	0 %	25 %	50 %	499075360
28009	NC_021200	ACCGG	2	10	1052559	1052568	20 %	0 %	40 %	40 %	499075360
28010	NC_021200	TGC	2	6	1052624	1052629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075360
28011	NC_021200	ATC	2	6	1052650	1052655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075360
28012	NC_021200	CCG	2	6	1052657	1052662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075360
28013	NC_021200	TG	3	6	1052739	1052744	0 %	50 %	50 %	0 %	499075360
28014	NC_021200	GCG	2	6	1052834	1052839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075360
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28016	NC_021200	CCG	2	6	1052890	1052895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075360
28017	NC_021200	CCGG	2	8	1052923	1052930	0 %	0 %	50 %	50 %	499075360
28018	NC_021200	GGC	2	6	1052935	1052940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075360
28019	NC_021200	GCC	2	6	1052959	1052964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075360
28020	NC_021200	TGG	2	6	1053011	1053016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075360
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28024	NC_021200	CGG	2	6	1053162	1053167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075360
28025	NC_021200	GCG	2	6	1053218	1053223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075361
28026	NC_021200	GC	4	8	1053235	1053242	0 %	0 %	50 %	50 %	499075361
28027	NC_021200	TCA	2	6	1053250	1053255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075361
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28032	NC_021200	GGC	2	6	1053665	1053670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075361
28033	NC_021200	GTC	2	6	1053734	1053739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075361
28034	NC_021200	GGTC	2	8	1053796	1053803	0 %	25 %	50 %	25 %	499075361
28035	NC_021200	CTGC	2	8	1053809	1053816	0 %	25 %	25 %	50 %	499075361
28036	NC_021200	CGG	2	6	1053838	1053843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075361
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28040	NC_021200	ACC	2	6	1053966	1053971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075361
28041	NC_021200	GTC	2	6	1053995	1054000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075361
28042	NC_021200	CCA	2	6	1054009	1054014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075361
28043	NC_021200	GCG	2	6	1054035	1054040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075361
28044	NC_021200	ACC	3	9	1054080	1054088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075361
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28046	NC_021200	GCCG	2	8	1054173	1054180	0 %	0 %	50 %	50 %	499075361
28047	NC_021200	GAC	2	6	1054196	1054201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075361
28048	NC_021200	CCTCGA	2	12	1054243	1054254	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499075361
28049	NC_021200	CGA	2	6	1054267	1054272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075361
28050	NC_021200	CAG	2	6	1054289	1054294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075361
28051	NC_021200	CAC	2	6	1054325	1054330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075361
28052	NC_021200	CAG	2	6	1054367	1054372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075361
28053	NC_021200	CGG	2	6	1054375	1054380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075361
28054	NC_021200	TCT	2	6	1054387	1054392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499075361
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28056	NC_021200	CGA	2	6	1054525	1054530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075361
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28060	NC_021200	CCCG	2	8	1054772	1054779	0 %	0 %	25 %	75 %	499075362
28061	NC_021200	GC	3	6	1054781	1054786	0 %	0 %	50 %	50 %	499075362
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28081	NC_021200	GC	3	6	1055217	1055222	0 %	0 %	50 %	50 %	499075362
28082	NC_021200	AGCGC	2	10	1055258	1055267	20 %	0 %	40 %	40 %	499075362
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28087	NC_021200	GC	3	6	1055524	1055529	0 %	0 %	50 %	50 %	499075362
28088	NC_021200	GCTGGT	2	12	1055559	1055570	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499075362
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28233	NC_021200	CG	3	6	1062046	1062051	0 %	0 %	50 %	50 %	499075370
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28331	NC_021200	GCT	2	6	1065325	1065330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075374
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28333	NC_021200	TGA	2	6	1065376	1065381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075374
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28338	NC_021200	CCCA	2	8	1065512	1065519	25 %	0 %	0 %	75 %	499075375
28339	NC_021200	GCA	2	6	1065528	1065533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075375
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28344	NC_021200	CGG	2	6	1065672	1065677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075375
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28463	NC_021200	CGA	2	6	1069219	1069224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075381
28464	NC_021200	CAG	2	6	1069226	1069231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075381
28465	NC_021200	TCG	2	6	1069233	1069238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075381
28466	NC_021200	TCC	2	6	1069257	1069262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075381
28467	NC_021200	CG	3	6	1069276	1069281	0 %	0 %	50 %	50 %	499075381
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28470	NC_021200	GTC	2	6	1069358	1069363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075381
28471	NC_021200	CGACGG	2	12	1069429	1069440	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499075381
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28475	NC_021200	CCA	2	6	1069543	1069548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075381
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28492	NC_021200	CCCGA	2	10	1070037	1070046	20 %	0 %	20 %	60 %	499075382
28493	NC_021200	GGTCG	2	10	1070153	1070162	0 %	20 %	60 %	20 %	499075382
28494	NC_021200	GCA	2	6	1070188	1070193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075382
28495	NC_021200	AGC	2	6	1070202	1070207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075382
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28497	NC_021200	TGG	2	6	1070236	1070241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075382
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