MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_021200	GCCGGC	2	12	1016863	1016874	0 %	0 %	50 %	50 %	499075323
27003	NC_021200	GCCG	2	8	1016885	1016892	0 %	0 %	50 %	50 %	499075323
27004	NC_021200	GCT	2	6	1016923	1016928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075323
27005	NC_021200	TCT	2	6	1016949	1016954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499075323
27006	NC_021200	GCCG	2	8	1017010	1017017	0 %	0 %	50 %	50 %	499075323
27007	NC_021200	CTA	2	6	1017034	1017039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075323
27008	NC_021200	GCT	2	6	1017049	1017054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075323
27009	NC_021200	GGC	2	6	1017070	1017075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075323
27010	NC_021200	CGC	2	6	1017163	1017168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075323
27011	NC_021200	CTGG	2	8	1017202	1017209	0 %	25 %	50 %	25 %	499075323
27012	NC_021200	GGGC	2	8	1017214	1017221	0 %	0 %	75 %	25 %	499075323
27013	NC_021200	TCTGGC	2	12	1017244	1017255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075323
27014	NC_021200	TGCG	2	8	1017258	1017265	0 %	25 %	50 %	25 %	499075323
27015	NC_021200	CGC	2	6	1017391	1017396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075324
27016	NC_021200	CCGACG	2	12	1017457	1017468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499075324
27017	NC_021200	CGGG	2	8	1017494	1017501	0 %	0 %	75 %	25 %	499075324
27018	NC_021200	AACCC	2	10	1017523	1017532	40 %	0 %	0 %	60 %	499075324
27019	NC_021200	CAT	2	6	1017566	1017571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075324
27020	NC_021200	CCGGCA	2	12	1017659	1017670	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499075324
27021	NC_021200	CGT	3	9	1017722	1017730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075324
27022	NC_021200	GCC	2	6	1017731	1017736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075324
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27024	NC_021200	GCA	2	6	1017761	1017766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075324
27025	NC_021200	GGCCGC	2	12	1017773	1017784	0 %	0 %	50 %	50 %	499075324
27026	NC_021200	GCT	2	6	1017812	1017817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075324
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27028	NC_021200	GC	3	6	1017876	1017881	0 %	0 %	50 %	50 %	499075324
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27031	NC_021200	TGC	2	6	1017898	1017903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075324
27032	NC_021200	TCG	2	6	1017925	1017930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075324
27033	NC_021200	CGG	2	6	1018002	1018007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075324
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27037	NC_021200	ATC	2	6	1018289	1018294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075325
27038	NC_021200	TCG	2	6	1018295	1018300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075325
27039	NC_021200	TGG	2	6	1018319	1018324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075325
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27042	NC_021200	GAC	2	6	1018360	1018365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075325
27043	NC_021200	GCT	2	6	1018377	1018382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075325
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27047	NC_021200	CTG	2	6	1018501	1018506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075325
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27050	NC_021200	TGC	2	6	1018592	1018597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075325
27051	NC_021200	GGT	2	6	1018620	1018625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075325
27052	NC_021200	TCGAG	2	10	1018631	1018640	20 %	20 %	40 %	20 %	499075325
27053	NC_021200	CG	3	6	1018648	1018653	0 %	0 %	50 %	50 %	499075325
27054	NC_021200	TCG	2	6	1018673	1018678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075325
27055	NC_021200	CGG	2	6	1018710	1018715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075325
27056	NC_021200	ATC	2	6	1018720	1018725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075325
27057	NC_021200	CTA	2	6	1018743	1018748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075325
27058	NC_021200	GAC	2	6	1018756	1018761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075325
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27232	NC_021200	CGT	2	6	1024879	1024884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075330
27233	NC_021200	TCG	2	6	1024890	1024895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075330
27234	NC_021200	TGA	3	9	1024911	1024919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075330
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27238	NC_021200	CGT	2	6	1025020	1025025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075330
27239	NC_021200	CGT	2	6	1025073	1025078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075330
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27243	NC_021200	CGC	2	6	1025227	1025232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075330
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27260	NC_021200	GCA	2	6	1025903	1025908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075331
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27464	NC_021200	ACG	2	6	1033150	1033155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075342
27465	NC_021200	CGC	2	6	1033280	1033285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075342
27466	NC_021200	AGC	2	6	1033412	1033417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075342
27467	NC_021200	CTT	2	6	1033446	1033451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499075342
27468	NC_021200	ACG	2	6	1033460	1033465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075342
27469	NC_021200	GAA	2	6	1033485	1033490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075342
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27471	NC_021200	GAG	2	6	1033586	1033591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075343
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27475	NC_021200	CGGC	2	8	1033654	1033661	0 %	0 %	50 %	50 %	499075343
27476	NC_021200	CGA	2	6	1033681	1033686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075343
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27483	NC_021200	ACG	2	6	1033836	1033841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075343
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27490	NC_021200	GCC	2	6	1034049	1034054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075343
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27494	NC_021200	GCC	2	6	1034243	1034248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075344
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