MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_021200	GGCCA	2	10	981903	981912	20 %	0 %	40 %	40 %	499075292
26003	NC_021200	CGA	2	6	981920	981925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075292
26004	NC_021200	GC	3	6	981942	981947	0 %	0 %	50 %	50 %	499075292
26005	NC_021200	CG	3	6	981956	981961	0 %	0 %	50 %	50 %	499075292
26006	NC_021200	GGC	2	6	981986	981991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075292
26007	NC_021200	GGGC	2	8	981995	982002	0 %	0 %	75 %	25 %	499075292
26008	NC_021200	GCG	2	6	982006	982011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075292
26009	NC_021200	CCA	2	6	982016	982021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075292
26010	NC_021200	GCCC	2	8	982107	982114	0 %	0 %	25 %	75 %	499075292
26011	NC_021200	GC	3	6	982148	982153	0 %	0 %	50 %	50 %	499075292
26012	NC_021200	GTGC	2	8	982159	982166	0 %	25 %	50 %	25 %	499075292
26013	NC_021200	GACGTC	2	12	982170	982181	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499075292
26014	NC_021200	TCG	2	6	982194	982199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075292
26015	NC_021200	GCG	2	6	982236	982241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075292
26016	NC_021200	GGGC	2	8	982250	982257	0 %	0 %	75 %	25 %	499075292
26017	NC_021200	GCG	2	6	982271	982276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075292
26018	NC_021200	CGA	2	6	982319	982324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075292
26019	NC_021200	GCCT	2	8	982365	982372	0 %	25 %	25 %	50 %	499075292
26020	NC_021200	CCG	2	6	982399	982404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075292
26021	NC_021200	CGAGGC	2	12	982406	982417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499075292
26022	NC_021200	GGC	3	9	982439	982447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075292
26023	NC_021200	GCC	2	6	982467	982472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075292
26024	NC_021200	GCT	2	6	982499	982504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075292
26025	NC_021200	CGA	2	6	982508	982513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075292
26026	NC_021200	GC	3	6	982516	982521	0 %	0 %	50 %	50 %	499075292
26027	NC_021200	GTG	2	6	982533	982538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075292
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26031	NC_021200	CGC	2	6	982711	982716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075293
26032	NC_021200	GC	3	6	982741	982746	0 %	0 %	50 %	50 %	499075293
26033	NC_021200	GCA	2	6	982797	982802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075293
26034	NC_021200	GC	3	6	982845	982850	0 %	0 %	50 %	50 %	499075293
26035	NC_021200	CGTCAA	2	12	982884	982895	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	499075293
26036	NC_021200	CAA	3	9	982893	982901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075293
26037	NC_021200	GCC	2	6	982933	982938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075293
26038	NC_021200	CGG	2	6	982950	982955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075293
26039	NC_021200	TCG	2	6	982958	982963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075293
26040	NC_021200	GCG	3	9	983012	983020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075293
26041	NC_021200	GGCA	2	8	983044	983051	25 %	0 %	50 %	25 %	499075293
26042	NC_021200	CGA	2	6	983073	983078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075293
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26044	NC_021200	GCA	2	6	983144	983149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075293
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26047	NC_021200	GAT	2	6	983259	983264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075293
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26049	NC_021200	TCG	2	6	983342	983347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075293
26050	NC_021200	GGCC	2	8	983361	983368	0 %	0 %	50 %	50 %	499075293
26051	NC_021200	TCG	2	6	983381	983386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075293
26052	NC_021200	GAC	2	6	983397	983402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075293
26053	NC_021200	GAA	2	6	983433	983438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075293
26054	NC_021200	GCG	2	6	983467	983472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075293
26055	NC_021200	ACC	2	6	983623	983628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075293
26056	NC_021200	CGG	2	6	983631	983636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075293
26057	NC_021200	GGT	2	6	983643	983648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075293
26058	NC_021200	CGG	2	6	983658	983663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075293
26059	NC_021200	CAACA	2	10	983782	983791	60 %	0 %	0 %	40 %	499075293
26060	NC_021200	GCG	2	6	983801	983806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075293
26061	NC_021200	CGT	2	6	983811	983816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075293
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26063	NC_021200	GCG	2	6	983946	983951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075294
26064	NC_021200	CG	3	6	983971	983976	0 %	0 %	50 %	50 %	499075294
26065	NC_021200	GCC	2	6	984011	984016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075294
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26067	NC_021200	CGA	2	6	984058	984063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075294
26068	NC_021200	GCG	4	12	984099	984110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075294
26069	NC_021200	GAT	2	6	984121	984126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075294
26070	NC_021200	GCCTGG	2	12	984189	984200	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499075294
26071	NC_021200	CCA	2	6	984207	984212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075294
26072	NC_021200	GCTG	2	8	984246	984253	0 %	25 %	50 %	25 %	499075294
26073	NC_021200	TGA	2	6	984261	984266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075294
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26087	NC_021200	CGA	2	6	984724	984729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075294
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26089	NC_021200	TCG	2	6	984932	984937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075294
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26092	NC_021200	AGC	2	6	985014	985019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075294
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26097	NC_021200	GT	3	6	986118	986123	0 %	50 %	50 %	0 %	499075295
26098	NC_021200	GGCGG	2	10	986190	986199	0 %	0 %	80 %	20 %	499075295
26099	NC_021200	TGA	2	6	986222	986227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075295
26100	NC_021200	GAC	2	6	986283	986288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075295
26101	NC_021200	GC	3	6	986298	986303	0 %	0 %	50 %	50 %	499075295
26102	NC_021200	GAG	2	6	986314	986319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075295
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26107	NC_021200	GCG	2	6	986487	986492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075295
26108	NC_021200	GGTTCG	2	12	986504	986515	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499075295
26109	NC_021200	GCT	2	6	986532	986537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075295
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26119	NC_021200	CGA	2	6	986979	986984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075295
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26476	NC_021200	CGC	2	6	999424	999429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075306
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26478	NC_021200	CGA	2	6	999451	999456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075306
26479	NC_021200	CTA	2	6	999457	999462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075306
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