MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_021200	ATC	2	6	948652	948657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075260
25003	NC_021200	CGT	2	6	948665	948670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075260
25004	NC_021200	TCG	2	6	948671	948676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075260
25005	NC_021200	CCG	2	6	948713	948718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075260
25006	NC_021200	GCT	2	6	948819	948824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075260
25007	NC_021200	GC	3	6	948852	948857	0 %	0 %	50 %	50 %	499075260
25008	NC_021200	CGCC	2	8	948858	948865	0 %	0 %	25 %	75 %	499075260
25009	NC_021200	CGC	2	6	948912	948917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075260
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25011	NC_021200	TCA	2	6	948953	948958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075260
25012	NC_021200	CGG	2	6	948981	948986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075260
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25015	NC_021200	GCCG	2	8	949029	949036	0 %	0 %	50 %	50 %	499075261
25016	NC_021200	CCG	2	6	949046	949051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075261
25017	NC_021200	GGC	2	6	949060	949065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075261
25018	NC_021200	CGCC	2	8	949082	949089	0 %	0 %	25 %	75 %	499075261
25019	NC_021200	CGG	2	6	949137	949142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075261
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25021	NC_021200	CGA	2	6	949175	949180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075261
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25033	NC_021200	GGCGTA	2	12	949518	949529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	499075261
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25063	NC_021200	GC	3	6	950669	950674	0 %	0 %	50 %	50 %	499075263
25064	NC_021200	CGG	2	6	950681	950686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075263
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25112	NC_021200	GGCA	2	8	952182	952189	25 %	0 %	50 %	25 %	499075264
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25472	NC_021200	GATCAG	2	12	964701	964712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	499075274
25473	NC_021200	GAC	2	6	964726	964731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075274
25474	NC_021200	GGCG	2	8	964755	964762	0 %	0 %	75 %	25 %	499075274
25475	NC_021200	CGC	2	6	964807	964812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075274
25476	NC_021200	GCG	2	6	964916	964921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075274
25477	NC_021200	GGC	2	6	964932	964937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075274
25478	NC_021200	CTGG	2	8	964938	964945	0 %	25 %	50 %	25 %	499075274
25479	NC_021200	GAT	2	6	964947	964952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075274
25480	NC_021200	GCA	2	6	964989	964994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075274
25481	NC_021200	GCG	2	6	965048	965053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075274
25482	NC_021200	ACA	2	6	965117	965122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075274
25483	NC_021200	GC	3	6	965145	965150	0 %	0 %	50 %	50 %	499075274
25484	NC_021200	GC	3	6	965170	965175	0 %	0 %	50 %	50 %	499075274
25485	NC_021200	GTC	2	6	965176	965181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075274
25486	NC_021200	CGA	2	6	965187	965192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075274
25487	NC_021200	GCT	2	6	965202	965207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075274
25488	NC_021200	TGG	2	6	965269	965274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075274
25489	NC_021200	GGA	2	6	965286	965291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075274
25490	NC_021200	CGT	2	6	965331	965336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075274
25491	NC_021200	CCG	2	6	965391	965396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075274
25492	NC_021200	CTG	2	6	965470	965475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075274
25493	NC_021200	ACA	2	6	965492	965497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075274
25494	NC_021200	CGA	2	6	965517	965522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075274
25495	NC_021200	CCCGCT	2	12	965523	965534	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	499075274
25496	NC_021200	CGC	2	6	965553	965558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075274
25497	NC_021200	CGG	2	6	965685	965690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075274
25498	NC_021200	CTG	2	6	965698	965703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075274
25499	NC_021200	CGC	2	6	965732	965737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075274
25500	NC_021200	ACG	2	6	965738	965743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075274

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