MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_021200	GCC	2	6	930687	930692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075244
24502	NC_021200	TCG	2	6	930766	930771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075244
24503	NC_021200	GCCA	2	8	930789	930796	25 %	0 %	25 %	50 %	499075244
24504	NC_021200	GGT	2	6	930800	930805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075244
24505	NC_021200	CCG	2	6	930806	930811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075244
24506	NC_021200	CGG	2	6	930857	930862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075244
24507	NC_021200	CGC	2	6	930896	930901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075244
24508	NC_021200	GTG	2	6	930930	930935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075244
24509	NC_021200	GCCT	2	8	930936	930943	0 %	25 %	25 %	50 %	499075244
24510	NC_021200	GTT	2	6	930953	930958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499075244
24511	NC_021200	CTG	2	6	931049	931054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075244
24512	NC_021200	GTT	2	6	931061	931066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499075244
24513	NC_021200	CCT	2	6	931069	931074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075244
24514	NC_021200	CGC	2	6	931076	931081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075244
24515	NC_021200	CTG	2	6	931083	931088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075244
24516	NC_021200	CCG	2	6	931096	931101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075244
24517	NC_021200	CGGG	2	8	931109	931116	0 %	0 %	75 %	25 %	499075244
24518	NC_021200	TGA	2	6	931126	931131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075244
24519	NC_021200	GTG	2	6	931137	931142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075244
24520	NC_021200	CGG	2	6	931154	931159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075244
24521	NC_021200	GGC	2	6	931274	931279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075244
24522	NC_021200	GTGG	2	8	931304	931311	0 %	25 %	75 %	0 %	499075244
24523	NC_021200	GC	3	6	931312	931317	0 %	0 %	50 %	50 %	499075244
24524	NC_021200	GTG	2	6	931326	931331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075244
24525	NC_021200	TGG	2	6	931360	931365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075244
24526	NC_021200	GCT	2	6	931409	931414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075244
24527	NC_021200	CGG	2	6	931424	931429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075244
24528	NC_021200	TGC	2	6	931453	931458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075244
24529	NC_021200	CGG	2	6	931462	931467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075244
24530	NC_021200	CGC	2	6	931469	931474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075244
24531	NC_021200	GGCC	2	8	931502	931509	0 %	0 %	50 %	50 %	499075244
24532	NC_021200	CAA	2	6	931543	931548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075245
24533	NC_021200	GCC	2	6	931578	931583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075245
24534	NC_021200	AGC	2	6	931661	931666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075245
24535	NC_021200	TAC	2	6	931678	931683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075245
24536	NC_021200	GCCG	2	8	931722	931729	0 %	0 %	50 %	50 %	499075245
24537	NC_021200	CCGCA	2	10	931873	931882	20 %	0 %	20 %	60 %	499075245
24538	NC_021200	TCG	2	6	931897	931902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075245
24539	NC_021200	GGGC	2	8	931947	931954	0 %	0 %	75 %	25 %	499075245
24540	NC_021200	GC	3	6	931995	932000	0 %	0 %	50 %	50 %	499075245
24541	NC_021200	CGGCG	2	10	932001	932010	0 %	0 %	60 %	40 %	499075245
24542	NC_021200	CGA	2	6	932019	932024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075245
24543	NC_021200	GTG	2	6	932047	932052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075245
24544	NC_021200	CATGGG	2	12	932055	932066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	499075245
24545	NC_021200	CG	3	6	932085	932090	0 %	0 %	50 %	50 %	499075245
24546	NC_021200	GGT	2	6	932091	932096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075245
24547	NC_021200	GCG	2	6	932106	932111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075245
24548	NC_021200	TCG	2	6	932114	932119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075245
24549	NC_021200	CGC	3	9	932123	932131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075245
24550	NC_021200	CGA	2	6	932205	932210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075245
24551	NC_021200	CGA	3	9	932250	932258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075245
24552	NC_021200	CAA	2	6	932283	932288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075245
24553	NC_021200	CGC	2	6	932316	932321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075245
24554	NC_021200	GC	3	6	932400	932405	0 %	0 %	50 %	50 %	499075245
24555	NC_021200	GCG	2	6	932418	932423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075245
24556	NC_021200	CG	3	6	932431	932436	0 %	0 %	50 %	50 %	499075245
24557	NC_021200	CGG	2	6	932533	932538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075245
24558	NC_021200	GC	3	6	932541	932546	0 %	0 %	50 %	50 %	499075245
24559	NC_021200	GCC	2	6	932596	932601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075245
24560	NC_021200	GCC	2	6	932614	932619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075245
24561	NC_021200	CG	4	8	932844	932851	0 %	0 %	50 %	50 %	499075246
24562	NC_021200	CGA	2	6	932860	932865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075246
24563	NC_021200	GCG	2	6	932895	932900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075246
24564	NC_021200	CCG	2	6	932934	932939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075246
24565	NC_021200	GTG	2	6	932959	932964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075246
24566	NC_021200	GCC	3	9	933005	933013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075246
24567	NC_021200	TCG	2	6	933030	933035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075246
24568	NC_021200	CGC	2	6	933040	933045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075246
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24572	NC_021200	GCC	2	6	933239	933244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075246
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24574	NC_021200	GCC	2	6	933297	933302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075247
24575	NC_021200	TGG	2	6	933307	933312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075247
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24579	NC_021200	CGCGG	2	10	933369	933378	0 %	0 %	60 %	40 %	499075247
24580	NC_021200	CGG	2	6	933403	933408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075247
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24584	NC_021200	CGG	2	6	933487	933492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075247
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24589	NC_021200	GCT	2	6	933566	933571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075247
24590	NC_021200	CCGG	2	8	933602	933609	0 %	0 %	50 %	50 %	499075247
24591	NC_021200	CG	3	6	933632	933637	0 %	0 %	50 %	50 %	499075247
24592	NC_021200	GCTCG	2	10	933638	933647	0 %	20 %	40 %	40 %	499075247
24593	NC_021200	TACGGC	2	12	933651	933662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499075247
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24599	NC_021200	CGGC	2	8	933826	933833	0 %	0 %	50 %	50 %	499075247
24600	NC_021200	GCG	2	6	933834	933839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075247
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24602	NC_021200	TGC	2	6	933862	933867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075247
24603	NC_021200	TCG	2	6	933871	933876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075247
24604	NC_021200	GCG	2	6	933886	933891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075247
24605	NC_021200	GGTGCT	2	12	933893	933904	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499075247
24606	NC_021200	CGG	2	6	933929	933934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075247
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24608	NC_021200	GGC	2	6	933997	934002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075247
24609	NC_021200	GCGCTG	2	12	934053	934064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499075247
24610	NC_021200	GGC	2	6	934073	934078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075247
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24614	NC_021200	GCA	2	6	934238	934243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075247
24615	NC_021200	CAG	3	9	934248	934256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075247
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24619	NC_021200	CGC	2	6	934317	934322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075247
24620	NC_021200	TCGGA	2	10	934392	934401	20 %	20 %	40 %	20 %	499075247
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24976	NC_021200	CCG	2	6	947730	947735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075259
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