MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_021200	GCC	2	6	817280	817285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21502	NC_021200	GGA	2	6	817312	817317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075136
21503	NC_021200	CGT	2	6	817362	817367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21504	NC_021200	GCA	2	6	817378	817383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21505	NC_021200	GCG	2	6	817421	817426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075136
21506	NC_021200	CGA	2	6	817459	817464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21507	NC_021200	ACG	2	6	817479	817484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21508	NC_021200	CGG	2	6	817560	817565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075136
21509	NC_021200	GCC	2	6	817589	817594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21510	NC_021200	CGC	3	9	817680	817688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21511	NC_021200	GCG	2	6	817718	817723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075136
21512	NC_021200	GCA	2	6	817752	817757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21513	NC_021200	TGC	2	6	817806	817811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21514	NC_021200	TCG	2	6	817860	817865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21515	NC_021200	GCC	3	9	817871	817879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21516	NC_021200	CGA	2	6	817935	817940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21517	NC_021200	GCT	2	6	817951	817956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21518	NC_021200	CGC	2	6	817963	817968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21519	NC_021200	TCT	2	6	817986	817991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499075136
21520	NC_021200	TCG	2	6	817992	817997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21521	NC_021200	CTA	2	6	818044	818049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075136
21522	NC_021200	ACC	2	6	818066	818071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075136
21523	NC_021200	GGC	2	6	818191	818196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075136
21524	NC_021200	GGC	2	6	818283	818288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075136
21525	NC_021200	TGG	3	9	818328	818336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075136
21526	NC_021200	TCG	2	6	818352	818357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21527	NC_021200	ACG	2	6	818391	818396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21528	NC_021200	GCC	2	6	818444	818449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21529	NC_021200	TGA	2	6	818490	818495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075136
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21531	NC_021200	GCA	2	6	818658	818663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21532	NC_021200	GCA	2	6	818667	818672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21533	NC_021200	GC	3	6	818698	818703	0 %	0 %	50 %	50 %	499075136
21534	NC_021200	CAG	2	6	818759	818764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21535	NC_021200	AGC	2	6	818778	818783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21536	NC_021200	CCAC	2	8	818793	818800	25 %	0 %	0 %	75 %	499075136
21537	NC_021200	CAT	2	6	818833	818838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075136
21538	NC_021200	CGA	2	6	818869	818874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21539	NC_021200	CCGG	2	8	818881	818888	0 %	0 %	50 %	50 %	499075136
21540	NC_021200	CGA	2	6	818977	818982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21541	NC_021200	GC	3	6	818988	818993	0 %	0 %	50 %	50 %	499075136
21542	NC_021200	GCC	2	6	819061	819066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21543	NC_021200	GAA	2	6	819085	819090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075136
21544	NC_021200	CCA	2	6	819117	819122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075136
21545	NC_021200	ACACCG	2	12	819153	819164	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	499075136
21546	NC_021200	ACG	2	6	819186	819191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
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21548	NC_021200	CGA	2	6	819202	819207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21549	NC_021200	GCC	2	6	819220	819225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21550	NC_021200	GCC	2	6	819290	819295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21551	NC_021200	ATC	2	6	819302	819307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075136
21552	NC_021200	CGC	2	6	819367	819372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21553	NC_021200	ATCT	2	8	819413	819420	25 %	50 %	0 %	25 %	499075136
21554	NC_021200	CCG	2	6	819429	819434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21555	NC_021200	CTG	2	6	819473	819478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21556	NC_021200	CGC	2	6	819490	819495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21557	NC_021200	CTG	2	6	819509	819514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21558	NC_021200	TCA	2	6	819525	819530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075136
21559	NC_021200	CGC	2	6	819544	819549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21560	NC_021200	ATCGTC	2	12	819551	819562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	499075136
21561	NC_021200	TCA	2	6	819666	819671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075136
21562	NC_021200	CTG	2	6	819674	819679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21563	NC_021200	CTG	3	9	819701	819709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
21564	NC_021200	GAG	2	6	819725	819730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075136
21565	NC_021200	CAT	2	6	819754	819759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075136
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21567	NC_021200	CCG	2	6	819795	819800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075136
21568	NC_021200	CCT	2	6	819825	819830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075136
21569	NC_021200	GAC	2	6	819868	819873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075136
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21571	NC_021200	GTCG	2	8	819928	819935	0 %	25 %	50 %	25 %	499075136
21572	NC_021200	GCT	2	6	819940	819945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
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21576	NC_021200	TGC	2	6	819999	820004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
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21578	NC_021200	GCT	3	9	820036	820044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075136
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21602	NC_021200	CGG	3	9	821087	821095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075138
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21604	NC_021200	GTC	2	6	821142	821147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075138
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21611	NC_021200	CCCG	2	8	821596	821603	0 %	0 %	25 %	75 %	499075139
21612	NC_021200	CCTG	2	8	821617	821624	0 %	25 %	25 %	50 %	499075139
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21974	NC_021200	GAA	2	6	835380	835385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075151
21975	NC_021200	CCG	2	6	835412	835417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075151
21976	NC_021200	GC	4	8	835464	835471	0 %	0 %	50 %	50 %	499075151
21977	NC_021200	GGCC	2	8	835514	835521	0 %	0 %	50 %	50 %	499075151
21978	NC_021200	CGA	2	6	835565	835570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075151
21979	NC_021200	GCT	2	6	835720	835725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075152
21980	NC_021200	GGC	2	6	835726	835731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075152
21981	NC_021200	GCT	2	6	835750	835755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075152
21982	NC_021200	CCA	2	6	835767	835772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075152
21983	NC_021200	GGC	2	6	835792	835797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075152
21984	NC_021200	TCG	2	6	835815	835820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075152
21985	NC_021200	CG	4	8	835819	835826	0 %	0 %	50 %	50 %	499075152
21986	NC_021200	CGC	2	6	835858	835863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075152
21987	NC_021200	TGG	2	6	835881	835886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075152
21988	NC_021200	GCC	2	6	835916	835921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075152
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21990	NC_021200	GCC	2	6	835946	835951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075152
21991	NC_021200	GC	3	6	835952	835957	0 %	0 %	50 %	50 %	499075152
21992	NC_021200	CGG	2	6	835965	835970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075152
21993	NC_021200	GTC	2	6	836005	836010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075152
21994	NC_021200	CGT	2	6	836047	836052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075152
21995	NC_021200	CGCGC	2	10	836144	836153	0 %	0 %	40 %	60 %	499075152
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21997	NC_021200	GCT	2	6	836185	836190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075152
21998	NC_021200	CGG	2	6	836238	836243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075152
21999	NC_021200	TCA	2	6	836286	836291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075152
22000	NC_021200	CGC	2	6	836299	836304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075152

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