MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_021200	CGG	2	6	723174	723179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075050
19003	NC_021200	TCG	2	6	723218	723223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075050
19004	NC_021200	GGC	2	6	723249	723254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075050
19005	NC_021200	CGT	2	6	723332	723337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075050
19006	NC_021200	CTG	2	6	723385	723390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075050
19007	NC_021200	GC	3	6	723405	723410	0 %	0 %	50 %	50 %	499075050
19008	NC_021200	CGG	2	6	723495	723500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075050
19009	NC_021200	CTG	2	6	723577	723582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075050
19010	NC_021200	CGA	2	6	723588	723593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075050
19011	NC_021200	ATC	2	6	723637	723642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075050
19012	NC_021200	GCG	2	6	723681	723686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075050
19013	NC_021200	TCCG	2	8	723801	723808	0 %	25 %	25 %	50 %	499075050
19014	NC_021200	GCG	2	6	723818	723823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075050
19015	NC_021200	CGA	2	6	723828	723833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075050
19016	NC_021200	GTG	2	6	723835	723840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075050
19017	NC_021200	AGA	2	6	723875	723880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075050
19018	NC_021200	CTG	2	6	723925	723930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075050
19019	NC_021200	CG	3	6	723931	723936	0 %	0 %	50 %	50 %	499075050
19020	NC_021200	GC	3	6	723956	723961	0 %	0 %	50 %	50 %	499075050
19021	NC_021200	GGCC	2	8	724009	724016	0 %	0 %	50 %	50 %	499075051
19022	NC_021200	GCC	2	6	724032	724037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075051
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19025	NC_021200	GCC	2	6	724127	724132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075051
19026	NC_021200	CG	3	6	724134	724139	0 %	0 %	50 %	50 %	499075051
19027	NC_021200	TCG	2	6	724158	724163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075051
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19029	NC_021200	TGA	2	6	724183	724188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075051
19030	NC_021200	CGA	2	6	724192	724197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075051
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19032	NC_021200	GCCG	2	8	724218	724225	0 %	0 %	50 %	50 %	499075051
19033	NC_021200	GCCG	2	8	724251	724258	0 %	0 %	50 %	50 %	499075051
19034	NC_021200	CCG	2	6	724271	724276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075051
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19038	NC_021200	GTC	2	6	724352	724357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075051
19039	NC_021200	TGG	2	6	724426	724431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075051
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19042	NC_021200	CAG	2	6	724496	724501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075051
19043	NC_021200	TCG	2	6	724537	724542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075051
19044	NC_021200	CCG	2	6	724548	724553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075051
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19047	NC_021200	GCA	2	6	724615	724620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075051
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19049	NC_021200	GCC	2	6	724656	724661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075051
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19052	NC_021200	GCA	3	9	724789	724797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075051
19053	NC_021200	CGG	2	6	724806	724811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075051
19054	NC_021200	CGC	2	6	724814	724819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075051
19055	NC_021200	CGG	2	6	724832	724837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075051
19056	NC_021200	GGCCG	2	10	724857	724866	0 %	0 %	60 %	40 %	499075051
19057	NC_021200	AG	3	6	724884	724889	50 %	0 %	50 %	0 %	499075051
19058	NC_021200	GCT	2	6	724921	724926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075051
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19060	NC_021200	GCG	2	6	724976	724981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075051
19061	NC_021200	CAG	2	6	724991	724996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075051
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19119	NC_021200	CCA	2	6	726999	727004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075052
19120	NC_021200	CAC	2	6	727038	727043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075052
19121	NC_021200	AGC	2	6	727069	727074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075052
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19123	NC_021200	CCG	2	6	727163	727168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075052
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19128	NC_021200	GCC	2	6	727221	727226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075052
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19132	NC_021200	GAT	2	6	727290	727295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075052
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19214	NC_021200	CGA	2	6	730729	730734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075054
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19216	NC_021200	CTCA	2	8	730790	730797	25 %	25 %	0 %	50 %	499075054
19217	NC_021200	CCCG	2	8	730804	730811	0 %	0 %	25 %	75 %	499075055
19218	NC_021200	TGA	2	6	730817	730822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075055
19219	NC_021200	GAC	2	6	730830	730835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075055
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19221	NC_021200	GCCC	2	8	730917	730924	0 %	0 %	25 %	75 %	499075055
19222	NC_021200	CCA	2	6	730931	730936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075055
19223	NC_021200	CGC	2	6	731022	731027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075056
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19230	NC_021200	CGGC	2	8	731207	731214	0 %	0 %	50 %	50 %	499075056
19231	NC_021200	CCG	2	6	731234	731239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075056
19232	NC_021200	GTC	2	6	731248	731253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075056
19233	NC_021200	CAG	2	6	731254	731259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075056
19234	NC_021200	CAG	2	6	731269	731274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075056
19235	NC_021200	ACGGGT	2	12	731313	731324	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	499075056
19236	NC_021200	GAA	2	6	731338	731343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075056
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19472	NC_021200	CGT	2	6	740139	740144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075066
19473	NC_021200	CACCG	2	10	740157	740166	20 %	0 %	20 %	60 %	499075066
19474	NC_021200	CTC	2	6	740187	740192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075066
19475	NC_021200	GTCC	2	8	740201	740208	0 %	25 %	25 %	50 %	499075066
19476	NC_021200	GGC	2	6	740228	740233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075066
19477	NC_021200	GTC	2	6	740238	740243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075066
19478	NC_021200	TGT	2	6	740357	740362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499075066
19479	NC_021200	GCGCG	2	10	740363	740372	0 %	0 %	60 %	40 %	499075066
19480	NC_021200	CGC	2	6	740377	740382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075066
19481	NC_021200	ACC	2	6	740386	740391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075066
19482	NC_021200	CGGC	2	8	740408	740415	0 %	0 %	50 %	50 %	499075066
19483	NC_021200	ACC	2	6	740449	740454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075066
19484	NC_021200	CGCCTC	2	12	740463	740474	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	499075066
19485	NC_021200	GC	3	6	740611	740616	0 %	0 %	50 %	50 %	499075066
19486	NC_021200	GCC	2	6	740640	740645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075066
19487	NC_021200	CCG	2	6	740650	740655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075066
19488	NC_021200	CG	3	6	740694	740699	0 %	0 %	50 %	50 %	499075066
19489	NC_021200	GCA	2	6	740717	740722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075066
19490	NC_021200	CAG	2	6	740730	740735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075066
19491	NC_021200	TCG	2	6	740741	740746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075066
19492	NC_021200	CGC	2	6	740766	740771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075066
19493	NC_021200	CGT	2	6	740777	740782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075066
19494	NC_021200	GCG	2	6	740835	740840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075066
19495	NC_021200	CCT	2	6	740858	740863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075066
19496	NC_021200	GCGG	2	8	740865	740872	0 %	0 %	75 %	25 %	499075066
19497	NC_021200	CG	3	6	740892	740897	0 %	0 %	50 %	50 %	499075066
19498	NC_021200	CGG	2	6	740900	740905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075066
19499	NC_021200	CGA	2	6	740945	740950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075066
19500	NC_021200	TCG	2	6	740956	740961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075066

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