MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_021200	GCT	2	6	701904	701909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075025
18503	NC_021200	CCG	2	6	701960	701965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075025
18504	NC_021200	CGG	2	6	701988	701993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075025
18505	NC_021200	AGA	2	6	702026	702031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075025
18506	NC_021200	GCC	2	6	702049	702054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075025
18507	NC_021200	GGGGC	2	10	702186	702195	0 %	0 %	80 %	20 %	499075026
18508	NC_021200	GTCG	2	8	702278	702285	0 %	25 %	50 %	25 %	499075026
18509	NC_021200	CCT	2	6	702298	702303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075026
18510	NC_021200	CGTCGG	2	12	702352	702363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499075026
18511	NC_021200	GC	3	6	702380	702385	0 %	0 %	50 %	50 %	499075026
18512	NC_021200	CGG	2	6	702436	702441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075026
18513	NC_021200	GTC	2	6	702449	702454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075026
18514	NC_021200	CG	3	6	702457	702462	0 %	0 %	50 %	50 %	499075026
18515	NC_021200	GAA	2	6	702482	702487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075026
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18517	NC_021200	TCG	2	6	702531	702536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075026
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18519	NC_021200	CCT	2	6	702664	702669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075026
18520	NC_021200	GCA	2	6	702691	702696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075026
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18551	NC_021200	GTCG	2	8	704117	704124	0 %	25 %	50 %	25 %	499075027
18552	NC_021200	GCA	2	6	704128	704133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075027
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18857	NC_021200	CGA	2	6	718046	718051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075044
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18974	NC_021200	GC	3	6	722175	722180	0 %	0 %	50 %	50 %	499075049
18975	NC_021200	GGGC	2	8	722192	722199	0 %	0 %	75 %	25 %	499075049
18976	NC_021200	GCT	2	6	722310	722315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075049
18977	NC_021200	GGT	2	6	722319	722324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075049
18978	NC_021200	GCA	2	6	722330	722335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075049
18979	NC_021200	CG	3	6	722370	722375	0 %	0 %	50 %	50 %	499075049
18980	NC_021200	GC	3	6	722376	722381	0 %	0 %	50 %	50 %	499075049
18981	NC_021200	CGA	2	6	722403	722408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075049
18982	NC_021200	CCGAC	2	10	722429	722438	20 %	0 %	20 %	60 %	499075049
18983	NC_021200	CGA	2	6	722463	722468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075049
18984	NC_021200	CGG	2	6	722562	722567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075049
18985	NC_021200	CTG	3	9	722572	722580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075049
18986	NC_021200	AGG	3	9	722609	722617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075049
18987	NC_021200	CGT	2	6	722727	722732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075050
18988	NC_021200	CGCC	2	8	722733	722740	0 %	0 %	25 %	75 %	499075050
18989	NC_021200	CTG	2	6	722743	722748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075050
18990	NC_021200	GGTCGA	2	12	722769	722780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	499075050
18991	NC_021200	CAC	2	6	722784	722789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075050
18992	NC_021200	CGCGG	2	10	722809	722818	0 %	0 %	60 %	40 %	499075050
18993	NC_021200	CGC	2	6	722913	722918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075050
18994	NC_021200	GAC	2	6	722962	722967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075050
18995	NC_021200	GGC	2	6	723028	723033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075050
18996	NC_021200	GCT	2	6	723060	723065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075050
18997	NC_021200	GC	3	6	723066	723071	0 %	0 %	50 %	50 %	499075050
18998	NC_021200	GCC	2	6	723073	723078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075050
18999	NC_021200	CACC	2	8	723092	723099	25 %	0 %	0 %	75 %	499075050
19000	NC_021200	ACC	2	6	723132	723137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075050

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