MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021200	CGG	2	6	681237	681242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075002
18002	NC_021200	TGCC	2	8	681277	681284	0 %	25 %	25 %	50 %	499075002
18003	NC_021200	CGG	2	6	681286	681291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075002
18004	NC_021200	CGT	2	6	681306	681311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075002
18005	NC_021200	GGT	2	6	681340	681345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075002
18006	NC_021200	CAG	2	6	681347	681352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075002
18007	NC_021200	CGG	3	9	681366	681374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075002
18008	NC_021200	GCG	2	6	681384	681389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075002
18009	NC_021200	TGC	2	6	681417	681422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075002
18010	NC_021200	GAG	2	6	681434	681439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075002
18011	NC_021200	GGGGT	2	10	681452	681461	0 %	20 %	80 %	0 %	499075002
18012	NC_021200	CGG	2	6	681552	681557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075002
18013	NC_021200	CGG	2	6	681565	681570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075002
18014	NC_021200	AGC	2	6	681576	681581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075002
18015	NC_021200	GC	3	6	681586	681591	0 %	0 %	50 %	50 %	499075002
18016	NC_021200	ACC	2	6	681594	681599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075002
18017	NC_021200	GGGC	2	8	681600	681607	0 %	0 %	75 %	25 %	499075002
18018	NC_021200	GCT	2	6	681610	681615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075002
18019	NC_021200	GCT	2	6	681767	681772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075003
18020	NC_021200	GAC	2	6	681798	681803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075003
18021	NC_021200	GAC	2	6	681849	681854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075003
18022	NC_021200	CGA	2	6	681862	681867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075003
18023	NC_021200	CGGG	2	8	681897	681904	0 %	0 %	75 %	25 %	499075003
18024	NC_021200	GC	3	6	681919	681924	0 %	0 %	50 %	50 %	499075003
18025	NC_021200	CGA	2	6	682010	682015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075003
18026	NC_021200	CGG	2	6	682030	682035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075003
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18028	NC_021200	CCG	2	6	682082	682087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075003
18029	NC_021200	CGA	2	6	682166	682171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075003
18030	NC_021200	TCGG	2	8	682181	682188	0 %	25 %	50 %	25 %	499075004
18031	NC_021200	GC	4	8	682239	682246	0 %	0 %	50 %	50 %	499075004
18032	NC_021200	TGTCGG	2	12	682260	682271	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499075004
18033	NC_021200	CAG	2	6	682276	682281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075004
18034	NC_021200	CGA	2	6	682317	682322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075004
18035	NC_021200	GTC	2	6	682330	682335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075004
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18043	NC_021200	GCCG	2	8	682692	682699	0 %	0 %	50 %	50 %	499075005
18044	NC_021200	GGT	2	6	682734	682739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075005
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18047	NC_021200	GTC	2	6	682791	682796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075005
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18050	NC_021200	CCACC	2	10	682914	682923	20 %	0 %	0 %	80 %	499075005
18051	NC_021200	GCC	2	6	682953	682958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075005
18052	NC_021200	TCT	2	6	682979	682984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499075005
18053	NC_021200	CGC	2	6	683012	683017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075005
18054	NC_021200	CCGA	2	8	683023	683030	25 %	0 %	25 %	50 %	499075005
18055	NC_021200	CAC	2	6	683034	683039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075005
18056	NC_021200	CCCG	2	8	683087	683094	0 %	0 %	25 %	75 %	499075005
18057	NC_021200	TCG	2	6	683098	683103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075005
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18060	NC_021200	GCA	2	6	683234	683239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075005
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18062	NC_021200	TCG	2	6	683284	683289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075005
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18066	NC_021200	CAC	3	9	683403	683411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075005
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18089	NC_021200	GGA	2	6	684420	684425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075006
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18237	NC_021200	TGGCGG	2	12	689519	689530	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499075012
18238	NC_021200	GCT	2	6	689586	689591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075012
18239	NC_021200	CGC	2	6	689625	689630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075012
18240	NC_021200	GGT	2	6	689634	689639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075012
18241	NC_021200	TGG	2	6	689648	689653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075012
18242	NC_021200	TGC	2	6	689654	689659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075012
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18343	NC_021200	CCAG	2	8	694305	694312	25 %	0 %	25 %	50 %	499075017
18344	NC_021200	CG	3	6	694318	694323	0 %	0 %	50 %	50 %	499075017
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18346	NC_021200	CCGTC	2	10	694382	694391	0 %	20 %	20 %	60 %	499075017
18347	NC_021200	CGAA	2	8	694427	694434	50 %	0 %	25 %	25 %	499075017
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18351	NC_021200	GCCGTC	2	12	694498	694509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	499075017
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18354	NC_021200	GCG	2	6	694538	694543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075017
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18360	NC_021200	CGT	2	6	694766	694771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075018
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18471	NC_021200	TGT	2	6	700634	700639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499075022
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18473	NC_021200	GAT	2	6	700668	700673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075022
18474	NC_021200	CCAGCC	2	12	700793	700804	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	499075023
18475	NC_021200	CCG	2	6	700830	700835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075023
18476	NC_021200	GCT	2	6	700851	700856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075023
18477	NC_021200	GGC	2	6	700896	700901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075023
18478	NC_021200	CGA	2	6	700974	700979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075023
18479	NC_021200	GAA	2	6	701020	701025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499075023
18480	NC_021200	GCC	2	6	701035	701040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075023
18481	NC_021200	GC	3	6	701064	701069	0 %	0 %	50 %	50 %	499075023
18482	NC_021200	CGG	2	6	701090	701095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075023
18483	NC_021200	CCGCG	2	10	701119	701128	0 %	0 %	40 %	60 %	499075023
18484	NC_021200	GCGCC	2	10	701178	701187	0 %	0 %	40 %	60 %	499075023
18485	NC_021200	GCC	2	6	701257	701262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075023
18486	NC_021200	CAG	2	6	701308	701313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075023
18487	NC_021200	TGGC	2	8	701314	701321	0 %	25 %	50 %	25 %	499075023
18488	NC_021200	CGT	2	6	701349	701354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075023
18489	NC_021200	TGC	2	6	701375	701380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075023
18490	NC_021200	GCG	2	6	701432	701437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075024
18491	NC_021200	TGC	2	6	701440	701445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075024
18492	NC_021200	GC	3	6	701464	701469	0 %	0 %	50 %	50 %	499075024
18493	NC_021200	TGGC	2	8	701487	701494	0 %	25 %	50 %	25 %	499075024
18494	NC_021200	GGCC	2	8	701581	701588	0 %	0 %	50 %	50 %	499075024
18495	NC_021200	CCT	2	6	701751	701756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499075025
18496	NC_021200	TCCT	2	8	701788	701795	0 %	50 %	0 %	50 %	499075025
18497	NC_021200	GC	3	6	701808	701813	0 %	0 %	50 %	50 %	499075025
18498	NC_021200	CAA	2	6	701814	701819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075025
18499	NC_021200	GAG	2	6	701836	701841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075025
18500	NC_021200	CG	3	6	701853	701858	0 %	0 %	50 %	50 %	499075025

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