MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_021200	CGG	2	6	661648	661653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074985
17503	NC_021200	CGA	2	6	661654	661659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074985
17504	NC_021200	CGG	2	6	661663	661668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074985
17505	NC_021200	GCGG	2	8	661672	661679	0 %	0 %	75 %	25 %	499074985
17506	NC_021200	ATC	2	6	661692	661697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074985
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17509	NC_021200	TGG	2	6	661758	661763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074986
17510	NC_021200	C	6	6	661824	661829	0 %	0 %	0 %	100 %	499074986
17511	NC_021200	CCA	2	6	661852	661857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074986
17512	NC_021200	CGC	2	6	661864	661869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074986
17513	NC_021200	GTC	2	6	661880	661885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074986
17514	NC_021200	TGC	2	6	661923	661928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074986
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17517	NC_021200	CCAGG	2	10	661987	661996	20 %	0 %	40 %	40 %	499074986
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17521	NC_021200	GCCA	2	8	662132	662139	25 %	0 %	25 %	50 %	499074986
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17976	NC_021200	CGC	2	6	677783	677788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075001
17977	NC_021200	CGGTG	2	10	677809	677818	0 %	20 %	60 %	20 %	499075001
17978	NC_021200	GCG	2	6	677830	677835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075001
17979	NC_021200	AGC	2	6	677880	677885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075001
17980	NC_021200	CAG	2	6	677891	677896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075001
17981	NC_021200	CCG	3	9	677923	677931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075001
17982	NC_021200	TGGT	2	8	677934	677941	0 %	50 %	50 %	0 %	499075001
17983	NC_021200	GCA	2	6	677984	677989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075001
17984	NC_021200	CCGG	2	8	678008	678015	0 %	0 %	50 %	50 %	499075001
17985	NC_021200	GGT	2	6	678071	678076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075001
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17988	NC_021200	GCGG	2	8	678236	678243	0 %	0 %	75 %	25 %	499075001
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17996	NC_021200	CGA	2	6	681019	681024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075002
17997	NC_021200	GATC	2	8	681064	681071	25 %	25 %	25 %	25 %	499075002
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17999	NC_021200	CGC	3	9	681112	681120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075002
18000	NC_021200	GCT	2	6	681217	681222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075002

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