MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021200	CA	3	6	49089	49094	50 %	0 %	0 %	50 %	499074441
1002	NC_021200	CGG	2	6	49174	49179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074442
1003	NC_021200	GCG	2	6	49362	49367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074442
1004	NC_021200	GC	3	6	49370	49375	0 %	0 %	50 %	50 %	499074442
1005	NC_021200	TGATT	2	10	49406	49415	20 %	60 %	20 %	0 %	499074442
1006	NC_021200	GAA	2	6	49446	49451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074442
1007	NC_021200	GTG	2	6	49479	49484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074442
1008	NC_021200	CAAG	2	8	49511	49518	50 %	0 %	25 %	25 %	499074442
1009	NC_021200	C	6	6	49558	49563	0 %	0 %	0 %	100 %	499074442
1010	NC_021200	TCG	2	6	49576	49581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074442
1011	NC_021200	CCG	2	6	49681	49686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074442
1012	NC_021200	CCG	2	6	49756	49761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074442
1013	NC_021200	AC	3	6	49763	49768	50 %	0 %	0 %	50 %	499074442
1014	NC_021200	AGC	2	6	49831	49836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074442
1015	NC_021200	ATC	2	6	49845	49850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074442
1016	NC_021200	TGC	2	6	49855	49860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074442
1017	NC_021200	TCGG	2	8	49972	49979	0 %	25 %	50 %	25 %	499074443
1018	NC_021200	TCG	2	6	49984	49989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074443
1019	NC_021200	GTCGC	2	10	50014	50023	0 %	20 %	40 %	40 %	499074443
1020	NC_021200	GCA	2	6	50039	50044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074443
1021	NC_021200	CCG	2	6	50176	50181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074443
1022	NC_021200	GC	3	6	50198	50203	0 %	0 %	50 %	50 %	499074443
1023	NC_021200	CGG	2	6	50251	50256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074443
1024	NC_021200	CACCGC	2	12	50375	50386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	499074443
1025	NC_021200	GCCGGC	2	12	50431	50442	0 %	0 %	50 %	50 %	499074443
1026	NC_021200	TCG	2	6	50465	50470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074443
1027	NC_021200	CCAGC	2	10	50603	50612	20 %	0 %	20 %	60 %	499074443
1028	NC_021200	GGCC	2	8	50633	50640	0 %	0 %	50 %	50 %	499074443
1029	NC_021200	CAA	2	6	50670	50675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074443
1030	NC_021200	GAA	2	6	50688	50693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074443
1031	NC_021200	GC	3	6	50735	50740	0 %	0 %	50 %	50 %	499074443
1032	NC_021200	GCC	2	6	50773	50778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074443
1033	NC_021200	CCG	2	6	50780	50785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074443
1034	NC_021200	A	6	6	50872	50877	100 %	0 %	0 %	0 %	499074443
1035	NC_021200	CCG	3	9	50881	50889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074443
1036	NC_021200	CCG	2	6	50909	50914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074443
1037	NC_021200	GCGCT	2	10	50942	50951	0 %	20 %	40 %	40 %	499074443
1038	NC_021200	GCC	3	9	50962	50970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074443
1039	NC_021200	TGG	2	6	50978	50983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074443
1040	NC_021200	GTG	2	6	51007	51012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074443
1041	NC_021200	GAA	2	6	51078	51083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074443
1042	NC_021200	GTTG	2	8	51084	51091	0 %	50 %	50 %	0 %	499074443
1043	NC_021200	CCA	2	6	51092	51097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074443
1044	NC_021200	TCG	2	6	51119	51124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074443
1045	NC_021200	TGG	2	6	51146	51151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074443
1046	NC_021200	ACTGG	2	10	51216	51225	20 %	20 %	40 %	20 %	499074443
1047	NC_021200	GGT	2	6	51270	51275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074443
1048	NC_021200	CCG	2	6	51302	51307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074443
1049	NC_021200	CGA	2	6	51357	51362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074443
1050	NC_021200	GCG	2	6	51367	51372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074443
1051	NC_021200	CAG	2	6	51381	51386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074443
1052	NC_021200	GCT	2	6	51405	51410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074443
1053	NC_021200	GGC	2	6	51433	51438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074443
1054	NC_021200	ACGG	2	8	51658	51665	25 %	0 %	50 %	25 %	499074444
1055	NC_021200	GC	3	6	51746	51751	0 %	0 %	50 %	50 %	499074444
1056	NC_021200	GC	3	6	51772	51777	0 %	0 %	50 %	50 %	499074444
1057	NC_021200	TGCCC	2	10	51794	51803	0 %	20 %	20 %	60 %	499074444
1058	NC_021200	GC	5	10	51886	51895	0 %	0 %	50 %	50 %	499074444
1059	NC_021200	GC	3	6	51925	51930	0 %	0 %	50 %	50 %	499074444
1060	NC_021200	CT	3	6	51943	51948	0 %	50 %	0 %	50 %	499074444
1061	NC_021200	CGC	2	6	51983	51988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074444
1062	NC_021200	ATCC	2	8	52039	52046	25 %	25 %	0 %	50 %	499074444
1063	NC_021200	GC	3	6	52202	52207	0 %	0 %	50 %	50 %	499074444
1064	NC_021200	GGT	2	6	52254	52259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074444
1065	NC_021200	CTA	2	6	52276	52281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074444
1066	NC_021200	CTG	2	6	52292	52297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074444
1067	NC_021200	GCG	2	6	52315	52320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074444
1068	NC_021200	AGC	2	6	52340	52345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074444
1069	NC_021200	CGA	2	6	52408	52413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074444
1070	NC_021200	ACCG	2	8	52456	52463	25 %	0 %	25 %	50 %	499074444
1071	NC_021200	AAG	2	6	52480	52485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074444
1072	NC_021200	GAC	2	6	52495	52500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074444
1073	NC_021200	ACCT	2	8	52580	52587	25 %	25 %	0 %	50 %	499074444
1074	NC_021200	GC	3	6	52657	52662	0 %	0 %	50 %	50 %	499074445
1075	NC_021200	TGGC	2	8	52703	52710	0 %	25 %	50 %	25 %	499074445
1076	NC_021200	CGT	2	6	52753	52758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074445
1077	NC_021200	GCC	2	6	52788	52793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074445
1078	NC_021200	T	6	6	52826	52831	0 %	100 %	0 %	0 %	499074445
1079	NC_021200	CCA	2	6	52848	52853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074445
1080	NC_021200	CGC	2	6	52887	52892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074445
1081	NC_021200	GTC	2	6	52907	52912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074445
1082	NC_021200	CGG	2	6	52921	52926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074445
1083	NC_021200	CCG	2	6	52998	53003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074445
1084	NC_021200	TGA	2	6	53007	53012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074445
1085	NC_021200	TGA	2	6	53016	53021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074445
1086	NC_021200	CTG	2	6	53075	53080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074445
1087	NC_021200	CGGT	2	8	53112	53119	0 %	25 %	50 %	25 %	499074445
1088	NC_021200	ATCC	2	8	53124	53131	25 %	25 %	0 %	50 %	499074445
1089	NC_021200	GCGCC	2	10	53133	53142	0 %	0 %	40 %	60 %	499074445
1090	NC_021200	GGT	2	6	53143	53148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074445
1091	NC_021200	GTG	2	6	53162	53167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074445
1092	NC_021200	CGA	2	6	53293	53298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074445
1093	NC_021200	CCG	2	6	53352	53357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074445
1094	NC_021200	ACA	2	6	53421	53426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074445
1095	NC_021200	GCCG	2	8	53436	53443	0 %	0 %	50 %	50 %	499074445
1096	NC_021200	CGA	2	6	53449	53454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074445
1097	NC_021200	CGC	2	6	53470	53475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074445
1098	NC_021200	CG	3	6	53514	53519	0 %	0 %	50 %	50 %	499074445
1099	NC_021200	CGA	2	6	53623	53628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074445
1100	NC_021200	TCG	2	6	53754	53759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074445
1101	NC_021200	CGA	2	6	53764	53769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074445
1102	NC_021200	CGT	2	6	53849	53854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074445
1103	NC_021200	GCG	2	6	53862	53867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074445
1104	NC_021200	GAT	2	6	53901	53906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074446
1105	NC_021200	CTTGC	2	10	53962	53971	0 %	40 %	20 %	40 %	499074446
1106	NC_021200	TCG	2	6	54011	54016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074446
1107	NC_021200	ACGC	2	8	54055	54062	25 %	0 %	25 %	50 %	499074446
1108	NC_021200	GTC	2	6	54097	54102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074446
1109	NC_021200	CAC	2	6	54106	54111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074446
1110	NC_021200	CTG	2	6	54298	54303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074446
1111	NC_021200	CCA	2	6	54335	54340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074446
1112	NC_021200	ATC	2	6	54343	54348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074446
1113	NC_021200	CCG	2	6	54389	54394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074446
1114	NC_021200	GC	3	6	54395	54400	0 %	0 %	50 %	50 %	499074446
1115	NC_021200	ACT	2	6	54423	54428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074446
1116	NC_021200	GTC	2	6	54433	54438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074446
1117	NC_021200	ACG	2	6	54449	54454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074446
1118	NC_021200	TCG	2	6	54494	54499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074446
1119	NC_021200	CAG	2	6	54511	54516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074446
1120	NC_021200	TTC	2	6	54640	54645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074446
1121	NC_021200	TGG	2	6	54659	54664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074446
1122	NC_021200	CAT	2	6	54672	54677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074446
1123	NC_021200	CGA	2	6	54722	54727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074446
1124	NC_021200	ATC	2	6	54742	54747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074446
1125	NC_021200	CCG	2	6	54822	54827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074446
1126	NC_021200	ACCC	2	8	54864	54871	25 %	0 %	0 %	75 %	499074446
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1240	NC_021200	ATC	2	6	60267	60272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074451
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1244	NC_021200	CCGC	2	8	60341	60348	0 %	0 %	25 %	75 %	499074451
1245	NC_021200	TGC	2	6	60407	60412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074451
1246	NC_021200	CGG	2	6	60446	60451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074451
1247	NC_021200	GAC	2	6	60453	60458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074451
1248	NC_021200	GCT	2	6	60521	60526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074451
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1500	NC_021200	GCC	2	6	69821	69826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074459

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