MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_021200	CAG	2	6	535478	535483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074879
14003	NC_021200	CCT	2	6	535531	535536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074879
14004	NC_021200	CAG	4	12	535619	535630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074879
14005	NC_021200	CGG	2	6	535654	535659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074879
14006	NC_021200	ACC	2	6	535698	535703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074879
14007	NC_021200	GC	3	6	535711	535716	0 %	0 %	50 %	50 %	499074879
14008	NC_021200	GGTC	2	8	535735	535742	0 %	25 %	50 %	25 %	499074879
14009	NC_021200	CCA	2	6	535801	535806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074879
14010	NC_021200	GCA	2	6	535834	535839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074879
14011	NC_021200	TGC	2	6	535851	535856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074879
14012	NC_021200	TGCCCG	2	12	535863	535874	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	499074879
14013	NC_021200	CGGG	2	8	535909	535916	0 %	0 %	75 %	25 %	499074879
14014	NC_021200	GTC	2	6	536015	536020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074880
14015	NC_021200	TCG	3	9	536124	536132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074880
14016	NC_021200	TCG	2	6	536178	536183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074880
14017	NC_021200	CCT	2	6	536221	536226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074880
14018	NC_021200	GTT	2	6	536230	536235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074880
14019	NC_021200	GGCG	2	8	536357	536364	0 %	0 %	75 %	25 %	499074881
14020	NC_021200	CGG	2	6	536405	536410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074881
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14022	NC_021200	TCG	2	6	536437	536442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074881
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14024	NC_021200	TGC	3	9	536488	536496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074881
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14026	NC_021200	AGCGC	2	10	536527	536536	20 %	0 %	40 %	40 %	499074881
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14028	NC_021200	GCT	2	6	536549	536554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074881
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14031	NC_021200	TACGCG	2	12	536613	536624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499074881
14032	NC_021200	GCGCC	2	10	536630	536639	0 %	0 %	40 %	60 %	499074881
14033	NC_021200	GC	3	6	536645	536650	0 %	0 %	50 %	50 %	499074881
14034	NC_021200	GCC	2	6	536660	536665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074881
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14039	NC_021200	GC	3	6	536820	536825	0 %	0 %	50 %	50 %	499074881
14040	NC_021200	CGGC	2	8	536867	536874	0 %	0 %	50 %	50 %	499074881
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14043	NC_021200	TGC	2	6	536938	536943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074881
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14052	NC_021200	CAG	2	6	537096	537101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074881
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14054	NC_021200	GCT	2	6	537218	537223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074881
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14056	NC_021200	CGG	2	6	537238	537243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074881
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14058	NC_021200	GCG	2	6	537295	537300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074881
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14241	NC_021200	CGC	2	6	543322	543327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883
14242	NC_021200	CGA	2	6	543337	543342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
14243	NC_021200	ACC	2	6	543344	543349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074883
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14253	NC_021200	TCG	2	6	543564	543569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
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14478	NC_021200	CAT	2	6	551472	551477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074889
14479	NC_021200	GCA	2	6	551480	551485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074889
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14481	NC_021200	GGC	2	6	551523	551528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074889
14482	NC_021200	CGGC	2	8	551603	551610	0 %	0 %	50 %	50 %	499074889
14483	NC_021200	CCG	2	6	551636	551641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074889
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