MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121501	NC_021200	TGC	2	6	4688162	4688167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078610
121502	NC_021200	CG	3	6	4688173	4688178	0 %	0 %	50 %	50 %	499078610
121503	NC_021200	GGC	2	6	4688187	4688192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078610
121504	NC_021200	GAGG	2	8	4688203	4688210	25 %	0 %	75 %	0 %	499078610
121505	NC_021200	CG	3	6	4688222	4688227	0 %	0 %	50 %	50 %	499078611
121506	NC_021200	GCG	2	6	4688234	4688239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078611
121507	NC_021200	CGA	2	6	4688246	4688251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078611
121508	NC_021200	GCC	2	6	4688263	4688268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078611
121509	NC_021200	CGA	2	6	4688288	4688293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078611
121510	NC_021200	GGC	2	6	4688300	4688305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078611
121511	NC_021200	GCGG	2	8	4688330	4688337	0 %	0 %	75 %	25 %	499078611
121512	NC_021200	CCGG	2	8	4688339	4688346	0 %	0 %	50 %	50 %	499078611
121513	NC_021200	CGCGC	2	10	4688363	4688372	0 %	0 %	40 %	60 %	499078611
121514	NC_021200	CGG	2	6	4688397	4688402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078611
121515	NC_021200	GC	3	6	4688422	4688427	0 %	0 %	50 %	50 %	499078611
121516	NC_021200	CGACC	2	10	4688428	4688437	20 %	0 %	20 %	60 %	499078611
121517	NC_021200	GCA	2	6	4688452	4688457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078611
121518	NC_021200	CGC	2	6	4688460	4688465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078611
121519	NC_021200	TCG	2	6	4688473	4688478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078611
121520	NC_021200	CGG	2	6	4688485	4688490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078611
121521	NC_021200	CCG	2	6	4688497	4688502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078611
121522	NC_021200	CGC	2	6	4688507	4688512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078611
121523	NC_021200	GC	3	6	4688651	4688656	0 %	0 %	50 %	50 %	499078611
121524	NC_021200	CCG	2	6	4688687	4688692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078611
121525	NC_021200	CGA	2	6	4688765	4688770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078611
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121529	NC_021200	CAT	2	6	4688888	4688893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078611
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121531	NC_021200	CGC	2	6	4689029	4689034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078612
121532	NC_021200	GCG	2	6	4689037	4689042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078612
121533	NC_021200	CGC	2	6	4689073	4689078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078612
121534	NC_021200	CGG	3	9	4689079	4689087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078612
121535	NC_021200	GTC	2	6	4689102	4689107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078612
121536	NC_021200	TTCGCG	2	12	4689117	4689128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078612
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121538	NC_021200	CGA	2	6	4689179	4689184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078612
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121540	NC_021200	GAT	2	6	4689308	4689313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078612
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121543	NC_021200	GCG	2	6	4689392	4689397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078613
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121545	NC_021200	GGC	2	6	4689448	4689453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078613
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121547	NC_021200	GCCCA	2	10	4689470	4689479	20 %	0 %	20 %	60 %	499078613
121548	NC_021200	CAA	2	6	4689577	4689582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078613
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121550	NC_021200	GAT	2	6	4689667	4689672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078613
121551	NC_021200	GC	3	6	4689675	4689680	0 %	0 %	50 %	50 %	499078613
121552	NC_021200	CGA	2	6	4689727	4689732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078613
121553	NC_021200	CAT	2	6	4689922	4689927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078613
121554	NC_021200	GTT	2	6	4689946	4689951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078613
121555	NC_021200	CGA	2	6	4689982	4689987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078613
121556	NC_021200	CGC	2	6	4689988	4689993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078613
121557	NC_021200	CAC	3	9	4690099	4690107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078613
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121561	NC_021200	TGG	2	6	4690621	4690626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078614
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121568	NC_021200	GCA	2	6	4690852	4690857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078614
121569	NC_021200	GAT	2	6	4690871	4690876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078614
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121583	NC_021200	GGA	2	6	4691321	4691326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078614
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121585	NC_021200	C	6	6	4691346	4691351	0 %	0 %	0 %	100 %	499078614
121586	NC_021200	GTA	2	6	4691405	4691410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078614
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121598	NC_021200	CGAGG	2	10	4691951	4691960	20 %	0 %	60 %	20 %	499078615
121599	NC_021200	CAG	2	6	4692005	4692010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078615
121600	NC_021200	CTG	2	6	4692011	4692016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078615
121601	NC_021200	GCA	2	6	4692061	4692066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078615
121602	NC_021200	CGCT	2	8	4692072	4692079	0 %	25 %	25 %	50 %	499078615
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121606	NC_021200	GCGG	2	8	4692200	4692207	0 %	0 %	75 %	25 %	499078615
121607	NC_021200	ATG	2	6	4692252	4692257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078615
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