MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
115001	NC_021200	CG	3	6	4437489	4437494	0 %	0 %	50 %	50 %	499078372
115002	NC_021200	GTC	2	6	4437501	4437506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078372
115003	NC_021200	TGC	2	6	4437529	4437534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115004	NC_021200	GGC	2	6	4437676	4437681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078373
115005	NC_021200	TGC	2	6	4437695	4437700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115006	NC_021200	CGC	2	6	4437721	4437726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078373
115007	NC_021200	CCG	2	6	4437772	4437777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078373
115008	NC_021200	GTG	2	6	4437814	4437819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078373
115009	NC_021200	CCCA	2	8	4437856	4437863	25 %	0 %	0 %	75 %	499078373
115010	NC_021200	TGC	2	6	4437887	4437892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115011	NC_021200	GC	3	6	4437891	4437896	0 %	0 %	50 %	50 %	499078373
115012	NC_021200	TAC	2	6	4437919	4437924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078373
115013	NC_021200	ACT	2	6	4437941	4437946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078373
115014	NC_021200	GGCT	2	8	4437964	4437971	0 %	25 %	50 %	25 %	499078373
115015	NC_021200	GC	3	6	4437973	4437978	0 %	0 %	50 %	50 %	499078373
115016	NC_021200	GCC	2	6	4438065	4438070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078373
115017	NC_021200	AGC	2	6	4438088	4438093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115018	NC_021200	GGT	2	6	4438095	4438100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078373
115019	NC_021200	CGA	2	6	4438101	4438106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115020	NC_021200	CGA	3	9	4438131	4438139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115021	NC_021200	CCA	2	6	4438161	4438166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078373
115022	NC_021200	CGT	2	6	4438188	4438193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115023	NC_021200	CGC	2	6	4438239	4438244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078373
115024	NC_021200	TCG	2	6	4438289	4438294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115025	NC_021200	GCC	2	6	4438336	4438341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078373
115026	NC_021200	GTG	2	6	4438366	4438371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078373
115027	NC_021200	CGG	2	6	4438374	4438379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078373
115028	NC_021200	GGCCT	2	10	4438393	4438402	0 %	20 %	40 %	40 %	499078373
115029	NC_021200	CGGA	2	8	4438406	4438413	25 %	0 %	50 %	25 %	499078373
115030	NC_021200	CGA	2	6	4438428	4438433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115031	NC_021200	CG	3	6	4438446	4438451	0 %	0 %	50 %	50 %	499078373
115032	NC_021200	CCCG	2	8	4438475	4438482	0 %	0 %	25 %	75 %	499078373
115033	NC_021200	GGC	2	6	4438503	4438508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078373
115034	NC_021200	TTG	2	6	4438514	4438519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078373
115035	NC_021200	TGG	2	6	4438550	4438555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078373
115036	NC_021200	GGCCGC	2	12	4438587	4438598	0 %	0 %	50 %	50 %	499078373
115037	NC_021200	CGG	2	6	4438602	4438607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078373
115038	NC_021200	TGG	2	6	4438646	4438651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078373
115039	NC_021200	ACG	2	6	4438658	4438663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115040	NC_021200	GCT	2	6	4438692	4438697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115041	NC_021200	GC	4	8	4438698	4438705	0 %	0 %	50 %	50 %	499078373
115042	NC_021200	CGG	2	6	4438712	4438717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078373
115043	NC_021200	CG	3	6	4438732	4438737	0 %	0 %	50 %	50 %	499078373
115044	NC_021200	CGC	2	6	4438749	4438754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078373
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115046	NC_021200	GCT	2	6	4438785	4438790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078373
115047	NC_021200	GC	3	6	4438803	4438808	0 %	0 %	50 %	50 %	499078373
115048	NC_021200	G	6	6	4438835	4438840	0 %	0 %	100 %	0 %	499078373
115049	NC_021200	TGG	3	9	4438945	4438953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078374
115050	NC_021200	CCG	2	6	4439090	4439095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078374
115051	NC_021200	TGG	2	6	4439143	4439148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078374
115052	NC_021200	GCG	2	6	4439173	4439178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078374
115053	NC_021200	TCG	2	6	4439259	4439264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078374
115054	NC_021200	CG	3	6	4439293	4439298	0 %	0 %	50 %	50 %	499078374
115055	NC_021200	GAA	2	6	4439309	4439314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078374
115056	NC_021200	CGA	4	12	4439339	4439350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078374
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115058	NC_021200	GCG	2	6	4439533	4439538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078375
115059	NC_021200	GCT	2	6	4439540	4439545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078375
115060	NC_021200	CTG	2	6	4439559	4439564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078375
115061	NC_021200	GCT	2	6	4439585	4439590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078375
115062	NC_021200	CG	3	6	4439595	4439600	0 %	0 %	50 %	50 %	499078375
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115341	NC_021200	CGA	2	6	4451007	4451012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078387
115342	NC_021200	CGCGGC	2	12	4451020	4451031	0 %	0 %	50 %	50 %	499078387
115343	NC_021200	GTGGG	2	10	4451124	4451133	0 %	20 %	80 %	0 %	499078387
115344	NC_021200	AGGT	2	8	4451137	4451144	25 %	25 %	50 %	0 %	499078387
115345	NC_021200	GCG	2	6	4451205	4451210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078388
115346	NC_021200	GCT	2	6	4451258	4451263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078388
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115348	NC_021200	CGC	2	6	4451300	4451305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078388
115349	NC_021200	GGT	2	6	4451306	4451311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078388
115350	NC_021200	GAT	2	6	4451322	4451327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078388
115351	NC_021200	CCG	2	6	4451330	4451335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078388
115352	NC_021200	CG	3	6	4451334	4451339	0 %	0 %	50 %	50 %	499078388
115353	NC_021200	CGT	2	6	4451347	4451352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078388
115354	NC_021200	CGC	2	6	4451390	4451395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078388
115355	NC_021200	CGA	2	6	4451441	4451446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078388
115356	NC_021200	CTG	2	6	4451490	4451495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078388
115357	NC_021200	TCT	2	6	4451500	4451505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499078388
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115359	NC_021200	TGG	3	9	4451569	4451577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078388
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115362	NC_021200	GCC	2	6	4451670	4451675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078388
115363	NC_021200	GGT	2	6	4451696	4451701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078388
115364	NC_021200	GGC	2	6	4451708	4451713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078388
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115369	NC_021200	CGG	2	6	4451858	4451863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078388
115370	NC_021200	CCG	2	6	4451872	4451877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078388
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115372	NC_021200	ATC	2	6	4451913	4451918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078388
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115445	NC_021200	GGC	2	6	4454593	4454598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078391
115446	NC_021200	TGA	2	6	4454970	4454975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078392
115447	NC_021200	GCGCA	2	10	4455010	4455019	20 %	0 %	40 %	40 %	499078392
115448	NC_021200	TGC	2	6	4455058	4455063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078392
115449	NC_021200	CGT	2	6	4455069	4455074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078392
115450	NC_021200	CCCG	2	8	4455126	4455133	0 %	0 %	25 %	75 %	499078392
115451	NC_021200	CTT	2	6	4455234	4455239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499078392
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115453	NC_021200	GTA	2	6	4455331	4455336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078392
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