MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114001	NC_021200	AGC	2	6	4400124	4400129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114002	NC_021200	CCT	2	6	4400140	4400145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078334
114003	NC_021200	CGC	2	6	4400158	4400163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078334
114004	NC_021200	CGGGCC	2	12	4400169	4400180	0 %	0 %	50 %	50 %	499078334
114005	NC_021200	GAT	2	6	4400414	4400419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078334
114006	NC_021200	CGC	2	6	4400458	4400463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078334
114007	NC_021200	CCG	2	6	4400464	4400469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078334
114008	NC_021200	ATC	2	6	4400484	4400489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078334
114009	NC_021200	CGA	3	9	4400527	4400535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114010	NC_021200	GCA	2	6	4400587	4400592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114011	NC_021200	GAAC	2	8	4400623	4400630	50 %	0 %	25 %	25 %	499078334
114012	NC_021200	GCA	2	6	4400632	4400637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114013	NC_021200	GCC	4	12	4400639	4400650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078334
114014	NC_021200	CCA	2	6	4400653	4400658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078334
114015	NC_021200	TCC	2	6	4400682	4400687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078334
114016	NC_021200	GCG	2	6	4400691	4400696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078334
114017	NC_021200	CGA	2	6	4400747	4400752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114018	NC_021200	CCT	2	6	4400782	4400787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078334
114019	NC_021200	TCC	2	6	4400814	4400819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078334
114020	NC_021200	GCG	2	6	4400872	4400877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078334
114021	NC_021200	GGC	2	6	4400891	4400896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078334
114022	NC_021200	TCA	2	6	4400977	4400982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078334
114023	NC_021200	CGT	2	6	4401028	4401033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114024	NC_021200	GGC	2	6	4401043	4401048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078334
114025	NC_021200	CGC	2	6	4401064	4401069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078334
114026	NC_021200	CAC	2	6	4401080	4401085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078334
114027	NC_021200	CGA	2	6	4401104	4401109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114028	NC_021200	CGT	2	6	4401142	4401147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114029	NC_021200	GCC	2	6	4401184	4401189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078334
114030	NC_021200	CCG	2	6	4401238	4401243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078334
114031	NC_021200	C	6	6	4401288	4401293	0 %	0 %	0 %	100 %	499078334
114032	NC_021200	CGA	2	6	4401301	4401306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114033	NC_021200	TGC	2	6	4401307	4401312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078334
114034	NC_021200	GAT	2	6	4401320	4401325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078334
114035	NC_021200	GATC	2	8	4401390	4401397	25 %	25 %	25 %	25 %	499078335
114036	NC_021200	ACG	2	6	4401443	4401448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078335
114037	NC_021200	GCCA	2	8	4401492	4401499	25 %	0 %	25 %	50 %	499078335
114038	NC_021200	CG	3	6	4401511	4401516	0 %	0 %	50 %	50 %	499078335
114039	NC_021200	GCC	2	6	4401586	4401591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078335
114040	NC_021200	GTGC	2	8	4401604	4401611	0 %	25 %	50 %	25 %	499078335
114041	NC_021200	GGC	2	6	4401621	4401626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078335
114042	NC_021200	TGC	2	6	4401647	4401652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078335
114043	NC_021200	CGC	2	6	4401656	4401661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078335
114044	NC_021200	ACC	2	6	4401677	4401682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078335
114045	NC_021200	CAA	2	6	4401720	4401725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078335
114046	NC_021200	GCT	2	6	4401796	4401801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078336
114047	NC_021200	CGA	2	6	4401835	4401840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078336
114048	NC_021200	CTG	2	6	4402085	4402090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078336
114049	NC_021200	CTA	2	6	4402096	4402101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078336
114050	NC_021200	CCG	2	6	4402146	4402151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078336
114051	NC_021200	CCG	2	6	4402187	4402192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078336
114052	NC_021200	GC	3	6	4402203	4402208	0 %	0 %	50 %	50 %	499078336
114053	NC_021200	CAT	2	6	4402219	4402224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078336
114054	NC_021200	CGA	2	6	4402225	4402230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078336
114055	NC_021200	CGT	2	6	4402304	4402309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078337
114056	NC_021200	TGGCGG	2	12	4402339	4402350	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499078337
114057	NC_021200	CGG	2	6	4402354	4402359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078337
114058	NC_021200	CGT	2	6	4402376	4402381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078337
114059	NC_021200	GCC	2	6	4402416	4402421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078337
114060	NC_021200	GGC	2	6	4402448	4402453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078337
114061	NC_021200	CAC	2	6	4402460	4402465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078337
114062	NC_021200	CGG	3	9	4402493	4402501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078337
114063	NC_021200	ACG	2	6	4402531	4402536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078337
114064	NC_021200	CCG	3	9	4402537	4402545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078337
114065	NC_021200	CCG	2	6	4402552	4402557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078337
114066	NC_021200	CCG	2	6	4402569	4402574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078337
114067	NC_021200	CCGCG	2	10	4402592	4402601	0 %	0 %	40 %	60 %	499078337
114068	NC_021200	CGA	2	6	4402616	4402621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078337
114069	NC_021200	GCGG	2	8	4402629	4402636	0 %	0 %	75 %	25 %	499078337
114070	NC_021200	CGA	2	6	4402670	4402675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078337
114071	NC_021200	GCT	2	6	4402691	4402696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078337
114072	NC_021200	CGG	2	6	4402813	4402818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078337
114073	NC_021200	GCT	2	6	4402838	4402843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078337
114074	NC_021200	GCC	3	9	4402851	4402859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078337
114075	NC_021200	GCT	2	6	4402901	4402906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078337
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114078	NC_021200	ACG	2	6	4402957	4402962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078337
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114081	NC_021200	GCT	2	6	4403054	4403059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078337
114082	NC_021200	GCG	2	6	4403067	4403072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078337
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114086	NC_021200	CGA	2	6	4403205	4403210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078338
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114114	NC_021200	GCA	2	6	4404204	4404209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078338
114115	NC_021200	ATC	2	6	4404248	4404253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078338
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114453	NC_021200	TGG	2	6	4415660	4415665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078349
114454	NC_021200	TCGA	2	8	4415672	4415679	25 %	25 %	25 %	25 %	499078349
114455	NC_021200	CGT	2	6	4415725	4415730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078349
114456	NC_021200	CGG	2	6	4415731	4415736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078349
114457	NC_021200	AGGCC	2	10	4415757	4415766	20 %	0 %	40 %	40 %	499078349
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114459	NC_021200	CGC	2	6	4415809	4415814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078349
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114464	NC_021200	CGT	2	6	4415881	4415886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078349
114465	NC_021200	CGT	3	9	4416002	4416010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078350
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114482	NC_021200	AAG	2	6	4416654	4416659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078350
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