MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110001	NC_021200	CAC	2	6	4251386	4251391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078193
110002	NC_021200	CGC	2	6	4251398	4251403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078193
110003	NC_021200	CAA	2	6	4251536	4251541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078193
110004	NC_021200	CGG	2	6	4251557	4251562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078193
110005	NC_021200	CGA	2	6	4251569	4251574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078193
110006	NC_021200	CAA	2	6	4251590	4251595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078193
110007	NC_021200	CGG	2	6	4251635	4251640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078193
110008	NC_021200	CGG	2	6	4251661	4251666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078193
110009	NC_021200	CGT	2	6	4251676	4251681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078193
110010	NC_021200	CGG	2	6	4251828	4251833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078194
110011	NC_021200	CTG	2	6	4251846	4251851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110012	NC_021200	TGA	2	6	4251881	4251886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078194
110013	NC_021200	CGGCC	2	10	4251912	4251921	0 %	0 %	40 %	60 %	499078194
110014	NC_021200	ACC	2	6	4251922	4251927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078194
110015	NC_021200	CGT	2	6	4251953	4251958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110016	NC_021200	GC	3	6	4252017	4252022	0 %	0 %	50 %	50 %	499078194
110017	NC_021200	CAG	2	6	4252026	4252031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110018	NC_021200	GGGC	2	8	4252043	4252050	0 %	0 %	75 %	25 %	499078194
110019	NC_021200	CAG	2	6	4252074	4252079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110020	NC_021200	CGG	2	6	4252211	4252216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078194
110021	NC_021200	GGC	2	6	4252233	4252238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078194
110022	NC_021200	CGC	2	6	4252344	4252349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078194
110023	NC_021200	CCAGCA	2	12	4252376	4252387	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	499078194
110024	NC_021200	CGG	2	6	4252407	4252412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078194
110025	NC_021200	CAG	2	6	4252452	4252457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110026	NC_021200	CGG	2	6	4252476	4252481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078194
110027	NC_021200	CTG	2	6	4252497	4252502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110028	NC_021200	CAC	2	6	4252506	4252511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078194
110029	NC_021200	CGGTG	2	10	4252520	4252529	0 %	20 %	60 %	20 %	499078194
110030	NC_021200	CAG	2	6	4252578	4252583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110031	NC_021200	GCA	3	9	4252589	4252597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110032	NC_021200	CACCGC	2	12	4252602	4252613	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	499078194
110033	NC_021200	CAG	2	6	4252654	4252659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110034	NC_021200	CGA	2	6	4252664	4252669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110035	NC_021200	AGC	3	9	4252687	4252695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110036	NC_021200	AGC	2	6	4252711	4252716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110037	NC_021200	GGC	2	6	4252766	4252771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078194
110038	NC_021200	GCG	2	6	4252774	4252779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078194
110039	NC_021200	CAG	2	6	4252785	4252790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110040	NC_021200	CAT	2	6	4252812	4252817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078194
110041	NC_021200	GGT	2	6	4252854	4252859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078194
110042	NC_021200	ACC	2	6	4252891	4252896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078194
110043	NC_021200	CGA	2	6	4252908	4252913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110044	NC_021200	CTGC	2	8	4252917	4252924	0 %	25 %	25 %	50 %	499078194
110045	NC_021200	ACG	3	9	4252930	4252938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110046	NC_021200	CGG	2	6	4252946	4252951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078194
110047	NC_021200	GC	3	6	4252975	4252980	0 %	0 %	50 %	50 %	499078194
110048	NC_021200	GTA	2	6	4253031	4253036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078194
110049	NC_021200	AGG	2	6	4253099	4253104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078194
110050	NC_021200	TCG	2	6	4253122	4253127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110051	NC_021200	CG	3	6	4253143	4253148	0 %	0 %	50 %	50 %	499078194
110052	NC_021200	CGG	2	6	4253168	4253173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078194
110053	NC_021200	CGA	2	6	4253183	4253188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078194
110054	NC_021200	CCG	2	6	4253213	4253218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078194
110055	NC_021200	AC	3	6	4253234	4253239	50 %	0 %	0 %	50 %	499078194
110056	NC_021200	GTG	2	6	4253371	4253376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078195
110057	NC_021200	CGCC	2	8	4253377	4253384	0 %	0 %	25 %	75 %	499078195
110058	NC_021200	GGT	2	6	4253475	4253480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078195
110059	NC_021200	GGC	2	6	4253486	4253491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078195
110060	NC_021200	TGG	2	6	4253524	4253529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078195
110061	NC_021200	GGC	2	6	4253711	4253716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078196
110062	NC_021200	CGCCC	2	10	4253770	4253779	0 %	0 %	20 %	80 %	499078196
110063	NC_021200	CGG	2	6	4253804	4253809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078196
110064	NC_021200	CCG	2	6	4253836	4253841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078196
110065	NC_021200	TCG	2	6	4253845	4253850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078196
110066	NC_021200	GCT	2	6	4253861	4253866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078196
110067	NC_021200	CCG	2	6	4253886	4253891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078196
110068	NC_021200	CGT	2	6	4253899	4253904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078196
110069	NC_021200	CTC	2	6	4253931	4253936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078196
110070	NC_021200	GCAGC	2	10	4253972	4253981	20 %	0 %	40 %	40 %	499078196
110071	NC_021200	GTG	2	6	4254033	4254038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078196
110072	NC_021200	TG	3	6	4254079	4254084	0 %	50 %	50 %	0 %	499078196
110073	NC_021200	CAG	2	6	4254110	4254115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078196
110074	NC_021200	CGC	3	9	4254140	4254148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078196
110075	NC_021200	TCG	2	6	4254154	4254159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078196
110076	NC_021200	CGA	2	6	4254221	4254226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078196
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110079	NC_021200	CTG	3	9	4254288	4254296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078196
110080	NC_021200	CG	3	6	4254327	4254332	0 %	0 %	50 %	50 %	499078196
110081	NC_021200	CGC	2	6	4254457	4254462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078197
110082	NC_021200	CGG	2	6	4254475	4254480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078197
110083	NC_021200	TGC	2	6	4254487	4254492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078197
110084	NC_021200	GCCGCG	2	12	4254497	4254508	0 %	0 %	50 %	50 %	499078197
110085	NC_021200	AGC	2	6	4254513	4254518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078197
110086	NC_021200	GGCT	2	8	4254534	4254541	0 %	25 %	50 %	25 %	499078197
110087	NC_021200	CGG	2	6	4254593	4254598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078197
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110096	NC_021200	GCA	2	6	4254832	4254837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078197
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110099	NC_021200	GGC	2	6	4254929	4254934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078197
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110101	NC_021200	CGA	2	6	4254947	4254952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078197
110102	NC_021200	TGGA	2	8	4254975	4254982	25 %	25 %	50 %	0 %	499078197
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110111	NC_021200	GCG	2	6	4255185	4255190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078198
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110113	NC_021200	CAA	2	6	4255208	4255213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078198
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110338	NC_021200	TGC	2	6	4267015	4267020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078209
110339	NC_021200	CGA	2	6	4267136	4267141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078209
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110341	NC_021200	CGG	2	6	4267205	4267210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078209
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110454	NC_021200	CCG	2	6	4271856	4271861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078213
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