MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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105115	NC_021200	CGG	3	9	4041552	4041560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078002
105116	NC_021200	GCG	2	6	4041608	4041613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078002
105117	NC_021200	GAT	2	6	4041621	4041626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078002
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105341	NC_021200	GAT	2	6	4050651	4050656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078013
105342	NC_021200	CGAT	2	8	4050673	4050680	25 %	25 %	25 %	25 %	499078013
105343	NC_021200	GCC	2	6	4050811	4050816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078013
105344	NC_021200	TCA	2	6	4050818	4050823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078013
105345	NC_021200	GTC	2	6	4050825	4050830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078013
105346	NC_021200	CCA	2	6	4050836	4050841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078013
105347	NC_021200	GC	3	6	4050866	4050871	0 %	0 %	50 %	50 %	499078013
105348	NC_021200	CGC	2	6	4050890	4050895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078013
105349	NC_021200	CCA	2	6	4050935	4050940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078013
105350	NC_021200	GCC	2	6	4050951	4050956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078013
105351	NC_021200	TGA	2	6	4050964	4050969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078013
105352	NC_021200	CCA	2	6	4050980	4050985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078013
105353	NC_021200	GCCAGC	2	12	4051033	4051044	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078013
105354	NC_021200	GCC	2	6	4051122	4051127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078013
105355	NC_021200	CAC	2	6	4051155	4051160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078013
105356	NC_021200	CGC	2	6	4051161	4051166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078013
105357	NC_021200	CGT	3	9	4051259	4051267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078013
105358	NC_021200	GCC	2	6	4051295	4051300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078013
105359	NC_021200	GATC	2	8	4051313	4051320	25 %	25 %	25 %	25 %	499078013
105360	NC_021200	GGCC	2	8	4051332	4051339	0 %	0 %	50 %	50 %	499078013
105361	NC_021200	TGG	2	6	4051352	4051357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078013
105362	NC_021200	GCA	3	9	4051547	4051555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078014
105363	NC_021200	GCC	2	6	4051596	4051601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078014
105364	NC_021200	CTG	2	6	4051614	4051619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078014
105365	NC_021200	CCA	2	6	4051622	4051627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078014
105366	NC_021200	GC	3	6	4051653	4051658	0 %	0 %	50 %	50 %	499078014
105367	NC_021200	GC	3	6	4051696	4051701	0 %	0 %	50 %	50 %	499078014
105368	NC_021200	CGT	3	9	4051724	4051732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078014
105369	NC_021200	GCT	2	6	4051761	4051766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078014
105370	NC_021200	ATC	2	6	4051858	4051863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078014
105371	NC_021200	CGT	2	6	4051919	4051924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078014
105372	NC_021200	GCG	2	6	4051927	4051932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078014
105373	NC_021200	CAG	2	6	4051938	4051943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078014
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105377	NC_021200	GCT	2	6	4052072	4052077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078014
105378	NC_021200	GCG	2	6	4052132	4052137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078014
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105382	NC_021200	CTG	2	6	4052322	4052327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078014
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105393	NC_021200	GCT	2	6	4052697	4052702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078014
105394	NC_021200	CGG	2	6	4052716	4052721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078014
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105399	NC_021200	ACGATG	2	12	4052809	4052820	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	499078014
105400	NC_021200	GACGT	2	10	4053630	4053639	20 %	20 %	40 %	20 %	499078015
105401	NC_021200	CGT	2	6	4053704	4053709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078015
105402	NC_021200	CGC	3	9	4053716	4053724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078015
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105404	NC_021200	AGG	2	6	4053766	4053771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078015
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105409	NC_021200	CAT	2	6	4053893	4053898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078015
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105412	NC_021200	TCG	2	6	4054014	4054019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078015
105413	NC_021200	ACG	2	6	4054069	4054074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078015
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105417	NC_021200	TCG	2	6	4054198	4054203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078015
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105452	NC_021200	GC	3	6	4056636	4056641	0 %	0 %	50 %	50 %	499078016
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