MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_021200	CGA	2	6	277947	277952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074648
7002	NC_021200	CGG	2	6	277979	277984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074648
7003	NC_021200	CGGC	2	8	277988	277995	0 %	0 %	50 %	50 %	499074648
7004	NC_021200	TGC	2	6	278006	278011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074648
7005	NC_021200	TCC	2	6	278109	278114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074649
7006	NC_021200	CAG	2	6	278162	278167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7007	NC_021200	TGC	2	6	278238	278243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7008	NC_021200	GTT	2	6	278279	278284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074649
7009	NC_021200	CGT	2	6	278305	278310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7010	NC_021200	CCG	2	6	278352	278357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074649
7011	NC_021200	CTC	2	6	278360	278365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074649
7012	NC_021200	AGC	2	6	278430	278435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7013	NC_021200	CTGG	2	8	278495	278502	0 %	25 %	50 %	25 %	499074649
7014	NC_021200	GCCG	2	8	278515	278522	0 %	0 %	50 %	50 %	499074649
7015	NC_021200	CCAG	2	8	278596	278603	25 %	0 %	25 %	50 %	499074649
7016	NC_021200	TCG	2	6	278625	278630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7017	NC_021200	GTA	2	6	278633	278638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074649
7018	NC_021200	CAG	3	9	278663	278671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7019	NC_021200	CAG	2	6	278708	278713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7020	NC_021200	CGG	3	9	278724	278732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074649
7021	NC_021200	TCG	2	6	278796	278801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7022	NC_021200	TCG	2	6	278823	278828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7023	NC_021200	GCG	2	6	278872	278877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074649
7024	NC_021200	TCG	2	6	278973	278978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074649
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7026	NC_021200	CGGC	2	8	279016	279023	0 %	0 %	50 %	50 %	499074649
7027	NC_021200	CCCGG	2	10	279049	279058	0 %	0 %	40 %	60 %	499074649
7028	NC_021200	TCG	3	9	279063	279071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074649
7029	NC_021200	GCGT	2	8	279099	279106	0 %	25 %	50 %	25 %	499074649
7030	NC_021200	TGG	2	6	279258	279263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074649
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7032	NC_021200	GGC	2	6	279289	279294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074649
7033	NC_021200	CTC	2	6	279320	279325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074649
7034	NC_021200	CGA	2	6	279331	279336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074649
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7044	NC_021200	CG	3	6	279707	279712	0 %	0 %	50 %	50 %	499074649
7045	NC_021200	GTCGG	2	10	279750	279759	0 %	20 %	60 %	20 %	499074649
7046	NC_021200	GCG	3	9	279768	279776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074649
7047	NC_021200	CCTCGG	2	12	279787	279798	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	499074649
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7051	NC_021200	CGC	2	6	280040	280045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074650
7052	NC_021200	GTG	2	6	280086	280091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074650
7053	NC_021200	TGA	2	6	280151	280156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074650
7054	NC_021200	CGCGGC	2	12	280176	280187	0 %	0 %	50 %	50 %	499074650
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7057	NC_021200	CCGTTG	2	12	280222	280233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074650
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7063	NC_021200	CGA	2	6	280538	280543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074650
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7080	NC_021200	GTC	2	6	281348	281353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074651
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7089	NC_021200	GC	3	6	281602	281607	0 %	0 %	50 %	50 %	499074651
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7120	NC_021200	GAG	2	6	282522	282527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074652
7121	NC_021200	TGGG	2	8	282559	282566	0 %	25 %	75 %	0 %	499074652
7122	NC_021200	CGA	2	6	282575	282580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074652
7123	NC_021200	TTC	2	6	282627	282632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074652
7124	NC_021200	GCA	3	9	282649	282657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074652
7125	NC_021200	GCT	2	6	282677	282682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074652
7126	NC_021200	GC	3	6	282751	282756	0 %	0 %	50 %	50 %	499074652
7127	NC_021200	CG	3	6	282757	282762	0 %	0 %	50 %	50 %	499074652
7128	NC_021200	GGT	2	6	282803	282808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074652
7129	NC_021200	GAC	2	6	282812	282817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074652
7130	NC_021200	CGACG	2	10	282878	282887	20 %	0 %	40 %	40 %	499074652
7131	NC_021200	CGT	2	6	282910	282915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074652
7132	NC_021200	ACG	2	6	282958	282963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074652
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7135	NC_021200	GCT	2	6	283139	283144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074652
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7141	NC_021200	CGGC	2	8	283400	283407	0 %	0 %	50 %	50 %	499074652
7142	NC_021200	CGG	2	6	283421	283426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074652
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7147	NC_021200	GGT	2	6	283595	283600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074652
7148	NC_021200	TCG	2	6	283647	283652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074652
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7150	NC_021200	GGC	2	6	283694	283699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074652
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7241	NC_021200	CAG	2	6	286810	286815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074654
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7359	NC_021200	ATC	2	6	291713	291718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074659
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7363	NC_021200	AGCC	2	8	291950	291957	25 %	0 %	25 %	50 %	499074660
7364	NC_021200	TGA	3	9	291986	291994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074660
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7366	NC_021200	CCCG	2	8	292039	292046	0 %	0 %	25 %	75 %	499074660
7367	NC_021200	GCCG	2	8	292063	292070	0 %	0 %	50 %	50 %	499074660
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7482	NC_021200	GC	3	6	296443	296448	0 %	0 %	50 %	50 %	499074663
7483	NC_021200	CAG	2	6	296503	296508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074663
7484	NC_021200	CGC	3	9	296509	296517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074663
7485	NC_021200	GC	3	6	296622	296627	0 %	0 %	50 %	50 %	499074663
7486	NC_021200	CCG	2	6	296663	296668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074663
7487	NC_021200	GCG	2	6	296686	296691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074663
7488	NC_021200	GC	4	8	296696	296703	0 %	0 %	50 %	50 %	499074663
7489	NC_021200	GCCAGC	2	12	296705	296716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074663
7490	NC_021200	AGC	3	9	296729	296737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074663
7491	NC_021200	AGT	2	6	296748	296753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074663
7492	NC_021200	CTC	2	6	296758	296763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074663
7493	NC_021200	TGC	2	6	296783	296788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074663
7494	NC_021200	GCG	2	6	296790	296795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074663
7495	NC_021200	CGG	2	6	296797	296802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074663
7496	NC_021200	AGT	2	6	296817	296822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074663
7497	NC_021200	CGA	2	6	296835	296840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074663
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7499	NC_021200	CGT	2	6	296877	296882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074663
7500	NC_021200	GAGC	2	8	296896	296903	25 %	0 %	50 %	25 %	499074663

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