MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021200	GCC	3	9	258396	258404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074625
6502	NC_021200	CAG	2	6	258417	258422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074625
6503	NC_021200	CA	3	6	258505	258510	50 %	0 %	0 %	50 %	499074625
6504	NC_021200	TCG	2	6	258518	258523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074625
6505	NC_021200	AGCG	2	8	258526	258533	25 %	0 %	50 %	25 %	499074625
6506	NC_021200	GAA	2	6	258564	258569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074625
6507	NC_021200	GCA	2	6	258593	258598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074625
6508	NC_021200	ATG	2	6	258601	258606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074625
6509	NC_021200	CCA	2	6	258635	258640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074625
6510	NC_021200	CGAC	2	8	258644	258651	25 %	0 %	25 %	50 %	499074625
6511	NC_021200	GTC	2	6	258684	258689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074625
6512	NC_021200	CGG	2	6	258776	258781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074625
6513	NC_021200	CG	3	6	258798	258803	0 %	0 %	50 %	50 %	499074625
6514	NC_021200	CCA	2	6	258810	258815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074625
6515	NC_021200	CCG	2	6	258845	258850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074625
6516	NC_021200	CGT	2	6	258890	258895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074625
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6518	NC_021200	GCCG	2	8	259075	259082	0 %	0 %	50 %	50 %	499074626
6519	NC_021200	CGG	2	6	259083	259088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074626
6520	NC_021200	CG	5	10	259115	259124	0 %	0 %	50 %	50 %	499074626
6521	NC_021200	TCG	2	6	259125	259130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074626
6522	NC_021200	TCG	2	6	259179	259184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074626
6523	NC_021200	GTC	2	6	259193	259198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074626
6524	NC_021200	TCGA	2	8	259209	259216	25 %	25 %	25 %	25 %	499074626
6525	NC_021200	GCACCG	2	12	259303	259314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074626
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6527	NC_021200	ATC	2	6	259353	259358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074626
6528	NC_021200	CACCGG	2	12	259367	259378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074626
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6532	NC_021200	GCCG	2	8	259471	259478	0 %	0 %	50 %	50 %	499074626
6533	NC_021200	GCG	2	6	259528	259533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074626
6534	NC_021200	GTA	2	6	259550	259555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074626
6535	NC_021200	GC	3	6	259557	259562	0 %	0 %	50 %	50 %	499074626
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6538	NC_021200	CGT	2	6	259606	259611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074626
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6541	NC_021200	TGG	2	6	259805	259810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074626
6542	NC_021200	CAG	2	6	259817	259822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074626
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6544	NC_021200	CAC	2	6	259865	259870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074626
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6553	NC_021200	GCT	2	6	260306	260311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074627
6554	NC_021200	GCT	2	6	260333	260338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074627
6555	NC_021200	CCG	2	6	260387	260392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074627
6556	NC_021200	CGA	2	6	260477	260482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074627
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6558	NC_021200	GCC	2	6	260529	260534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074627
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6561	NC_021200	GCT	2	6	260594	260599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074627
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6563	NC_021200	CGC	4	12	260645	260656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074627
6564	NC_021200	GC	3	6	260658	260663	0 %	0 %	50 %	50 %	499074627
6565	NC_021200	TGG	2	6	260725	260730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074627
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6588	NC_021200	TGA	2	6	261460	261465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074628
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6741	NC_021200	ATC	2	6	267918	267923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074635
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6980	NC_021200	GC	3	6	276927	276932	0 %	0 %	50 %	50 %	499074648
6981	NC_021200	CCA	2	6	276939	276944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074648
6982	NC_021200	GGC	2	6	276955	276960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074648
6983	NC_021200	GCA	2	6	276975	276980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074648
6984	NC_021200	GC	3	6	277011	277016	0 %	0 %	50 %	50 %	499074648
6985	NC_021200	AGC	2	6	277061	277066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074648
6986	NC_021200	GCA	2	6	277083	277088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074648
6987	NC_021200	CTC	2	6	277159	277164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074648
6988	NC_021200	TGG	2	6	277167	277172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074648
6989	NC_021200	CGC	2	6	277335	277340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074648
6990	NC_021200	GGC	2	6	277423	277428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074648
6991	NC_021200	CAG	2	6	277501	277506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074648
6992	NC_021200	GCT	2	6	277573	277578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074648
6993	NC_021200	CGG	2	6	277583	277588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074648
6994	NC_021200	CCG	2	6	277731	277736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074648
6995	NC_021200	GCG	2	6	277764	277769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074648
6996	NC_021200	TCG	3	9	277772	277780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074648
6997	NC_021200	CCGGT	2	10	277796	277805	0 %	20 %	40 %	40 %	499074648
6998	NC_021200	CGG	2	6	277809	277814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074648
6999	NC_021200	TGG	2	6	277821	277826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074648
7000	NC_021200	TCG	2	6	277934	277939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074648

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