MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 125321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021200	CGG	2	6	183904	183909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074548
4502	NC_021200	GAC	2	6	183910	183915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4503	NC_021200	TG	3	6	183921	183926	0 %	50 %	50 %	0 %	499074548
4504	NC_021200	TCG	2	6	184029	184034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4505	NC_021200	CGC	3	9	184074	184082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
4506	NC_021200	TCG	2	6	184122	184127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
4507	NC_021200	GCCG	2	8	184239	184246	0 %	0 %	50 %	50 %	499074549
4508	NC_021200	CG	3	6	184248	184253	0 %	0 %	50 %	50 %	499074549
4509	NC_021200	CAA	2	6	184296	184301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074549
4510	NC_021200	CCA	2	6	184310	184315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074549
4511	NC_021200	CGG	2	6	184334	184339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074549
4512	NC_021200	ACG	2	6	184345	184350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074549
4513	NC_021200	CGT	2	6	184431	184436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074549
4514	NC_021200	CGC	3	9	184458	184466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074549
4515	NC_021200	CGA	2	6	184517	184522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074549
4516	NC_021200	GCC	2	6	184534	184539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074549
4517	NC_021200	GGCC	2	8	184547	184554	0 %	0 %	50 %	50 %	499074549
4518	NC_021200	AGC	2	6	184555	184560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074549
4519	NC_021200	CAA	2	6	184626	184631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074549
4520	NC_021200	GTG	2	6	184638	184643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074549
4521	NC_021200	TGA	2	6	184650	184655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074549
4522	NC_021200	GCG	2	6	184897	184902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074550
4523	NC_021200	GGC	2	6	184922	184927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074550
4524	NC_021200	CGC	2	6	184934	184939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
4525	NC_021200	CAC	2	6	184967	184972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074550
4526	NC_021200	CGGC	2	8	184976	184983	0 %	0 %	50 %	50 %	499074550
4527	NC_021200	GC	3	6	185024	185029	0 %	0 %	50 %	50 %	499074550
4528	NC_021200	TGC	2	6	185047	185052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074550
4529	NC_021200	CGC	2	6	185064	185069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
4530	NC_021200	CGT	3	9	185102	185110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074550
4531	NC_021200	TCG	2	6	185137	185142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074550
4532	NC_021200	TTCGTG	2	12	185166	185177	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	499074550
4533	NC_021200	CGC	2	6	185204	185209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
4534	NC_021200	CGG	2	6	185255	185260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074550
4535	NC_021200	TGG	2	6	185266	185271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074550
4536	NC_021200	CGG	2	6	185278	185283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074550
4537	NC_021200	CGC	2	6	185309	185314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
4538	NC_021200	CGG	2	6	185318	185323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074550
4539	NC_021200	CCG	3	9	185356	185364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
4540	NC_021200	GCCGC	2	10	185368	185377	0 %	0 %	40 %	60 %	499074550
4541	NC_021200	CTG	2	6	185421	185426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074550
4542	NC_021200	CAG	2	6	185457	185462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074550
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4544	NC_021200	AACC	2	8	185492	185499	50 %	0 %	0 %	50 %	499074550
4545	NC_021200	GTG	2	6	185532	185537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074550
4546	NC_021200	CGC	2	6	185543	185548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
4547	NC_021200	GGT	2	6	185557	185562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074550
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4549	NC_021200	CGC	2	6	185594	185599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
4550	NC_021200	GCG	2	6	185607	185612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074550
4551	NC_021200	GCC	2	6	185614	185619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
4552	NC_021200	TGC	2	6	185656	185661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074550
4553	NC_021200	CGC	2	6	185671	185676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
4554	NC_021200	GCT	2	6	185726	185731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074550
4555	NC_021200	CG	3	6	185789	185794	0 %	0 %	50 %	50 %	499074550
4556	NC_021200	CAC	2	6	185835	185840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074551
4557	NC_021200	CCGC	2	8	185939	185946	0 %	0 %	25 %	75 %	499074551
4558	NC_021200	CGGG	2	8	186018	186025	0 %	0 %	75 %	25 %	499074551
4559	NC_021200	GCG	2	6	186127	186132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074551
4560	NC_021200	CGA	2	6	186134	186139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074551
4561	NC_021200	GGCC	2	8	186161	186168	0 %	0 %	50 %	50 %	499074551
4562	NC_021200	CAC	2	6	186222	186227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074551
4563	NC_021200	GCCA	2	8	186253	186260	25 %	0 %	25 %	50 %	499074551
4564	NC_021200	CAG	2	6	186324	186329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074551
4565	NC_021200	CTG	2	6	186345	186350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074551
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4568	NC_021200	GCT	2	6	186384	186389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074551
4569	NC_021200	CGC	2	6	186419	186424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074551
4570	NC_021200	ACC	2	6	186427	186432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074551
4571	NC_021200	CTG	2	6	186648	186653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074552
4572	NC_021200	GAG	2	6	186723	186728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074552
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4575	NC_021200	TGC	2	6	186914	186919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074553
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4578	NC_021200	CAG	2	6	187005	187010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074553
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4580	NC_021200	CGC	2	6	187115	187120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074553
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4582	NC_021200	GCG	2	6	187295	187300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074553
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4584	NC_021200	CCGG	2	8	187353	187360	0 %	0 %	50 %	50 %	499074553
4585	NC_021200	GCA	2	6	187466	187471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074553
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4594	NC_021200	ACG	2	6	187783	187788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074553
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4602	NC_021200	CAG	2	6	188100	188105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074553
4603	NC_021200	CGT	2	6	188222	188227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074553
4604	NC_021200	AC	3	6	188234	188239	50 %	0 %	0 %	50 %	499074553
4605	NC_021200	CGC	2	6	188244	188249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074553
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4621	NC_021200	CAG	2	6	188847	188852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074553
4622	NC_021200	TCG	3	9	188863	188871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074553
4623	NC_021200	GAC	2	6	188939	188944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074554
4624	NC_021200	GCA	2	6	188947	188952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074554
4625	NC_021200	TCG	2	6	188998	189003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074554
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4863	NC_021200	CCG	2	6	197559	197564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074562
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4981	NC_021200	GCG	2	6	201035	201040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074566
4982	NC_021200	GCA	2	6	201057	201062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074566
4983	NC_021200	CGG	2	6	201073	201078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074566
4984	NC_021200	GC	3	6	201088	201093	0 %	0 %	50 %	50 %	499074566
4985	NC_021200	GCG	2	6	201127	201132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074566
4986	NC_021200	CGCCC	2	10	201144	201153	0 %	0 %	20 %	80 %	499074567
4987	NC_021200	TCG	2	6	201184	201189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074567
4988	NC_021200	GCG	2	6	201262	201267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074567
4989	NC_021200	CGG	2	6	201271	201276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074567
4990	NC_021200	TCGA	2	8	201322	201329	25 %	25 %	25 %	25 %	499074567
4991	NC_021200	CAC	2	6	201375	201380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074567
4992	NC_021200	CTG	2	6	201384	201389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074567
4993	NC_021200	GTC	2	6	201444	201449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074567
4994	NC_021200	GC	3	6	201515	201520	0 %	0 %	50 %	50 %	499074567
4995	NC_021200	CGG	2	6	201530	201535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074567
4996	NC_021200	CCG	3	9	201590	201598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074567
4997	NC_021200	CCGCGG	2	12	201608	201619	0 %	0 %	50 %	50 %	499074567
4998	NC_021200	GCG	2	6	201635	201640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074567
4999	NC_021200	GCG	3	9	201699	201707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074567
5000	NC_021200	GCA	3	9	201773	201781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074567

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