MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CAS/NITR204

Total Repeats: 73511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021193	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694381
2	NC_021193	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694381
3	NC_021193	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694381
4	NC_021193	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694381
5	NC_021193	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694381
6	NC_021193	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694381
7	NC_021193	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694381
8	NC_021193	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694381
9	NC_021193	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	494694381
10	NC_021193	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694381
11	NC_021193	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694381
12	NC_021193	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694381
13	NC_021193	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494694381
14	NC_021193	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	494694381
15	NC_021193	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694381
16	NC_021193	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	494694381
17	NC_021193	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	494694381
18	NC_021193	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	494694381
19	NC_021193	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694381
20	NC_021193	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694381
21	NC_021193	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494694381
22	NC_021193	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494694381
23	NC_021193	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	494694381
24	NC_021193	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	494694381
25	NC_021193	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694381
26	NC_021193	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694381
27	NC_021193	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694381
28	NC_021193	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694381
29	NC_021193	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	494694381
30	NC_021193	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694381
31	NC_021193	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694381
32	NC_021193	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	494694381
33	NC_021193	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694381
34	NC_021193	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	494694382
35	NC_021193	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	494694382
36	NC_021193	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	494694382
37	NC_021193	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494694382
38	NC_021193	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694382
39	NC_021193	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694382
40	NC_021193	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694382
41	NC_021193	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694382
42	NC_021193	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694382
43	NC_021193	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494694382
44	NC_021193	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	494694382
45	NC_021193	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694382
46	NC_021193	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694382
47	NC_021193	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694382
48	NC_021193	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694382
49	NC_021193	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694382
50	NC_021193	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694382
51	NC_021193	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	494694382
52	NC_021193	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694382
53	NC_021193	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494694382
54	NC_021193	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	494694382
55	NC_021193	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694382
56	NC_021193	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	494694382
57	NC_021193	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494694382
58	NC_021193	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694382
59	NC_021193	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	494694382
60	NC_021193	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	494694382
61	NC_021193	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694382
62	NC_021193	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	494694382
63	NC_021193	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	494694383
64	NC_021193	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694383
65	NC_021193	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694383
66	NC_021193	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	494694383
67	NC_021193	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694383
68	NC_021193	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694383
69	NC_021193	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494694383
70	NC_021193	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494694383
71	NC_021193	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694383
72	NC_021193	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	494694383
73	NC_021193	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694383
74	NC_021193	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494694383
75	NC_021193	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	494694383
76	NC_021193	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694383
77	NC_021193	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	494694383
78	NC_021193	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494694383
79	NC_021193	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694383
80	NC_021193	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694383
81	NC_021193	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694383
82	NC_021193	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694383
83	NC_021193	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694383
84	NC_021193	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694383
85	NC_021193	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694383
86	NC_021193	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694383
87	NC_021193	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694383
88	NC_021193	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694383
89	NC_021193	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694383
90	NC_021193	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694383
91	NC_021193	GGT	2	6	4738	4743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694384
92	NC_021193	CCA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694384
93	NC_021193	ACG	2	6	4785	4790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694384
94	NC_021193	CGC	2	6	4870	4875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694384
95	NC_021193	CGG	2	6	4920	4925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694384
96	NC_021193	CG	3	6	4971	4976	0 %	0 %	50 %	50 %	494694384
97	NC_021193	AAG	2	6	5248	5253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494694385
98	NC_021193	GGT	2	6	5376	5381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694385
99	NC_021193	CGA	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694385
100	NC_021193	TGC	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694385
101	NC_021193	CGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694385
102	NC_021193	CCAC	2	8	5492	5499	25 %	0 %	0 %	75 %	494694385
103	NC_021193	ACCG	2	8	5511	5518	25 %	0 %	25 %	50 %	494694385
104	NC_021193	GTG	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694385
105	NC_021193	CGG	2	6	5547	5552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694385
106	NC_021193	TGG	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694385
107	NC_021193	CGGCGT	2	12	5595	5606	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494694385
108	NC_021193	GGT	2	6	5610	5615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694385
109	NC_021193	CAAG	2	8	5706	5713	50 %	0 %	25 %	25 %	494694385
110	NC_021193	AAG	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494694385
111	NC_021193	CGCC	2	8	5802	5809	0 %	0 %	25 %	75 %	494694385
112	NC_021193	CAA	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494694385
113	NC_021193	CGA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694385
114	NC_021193	GTC	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694385
115	NC_021193	TGG	2	6	6002	6007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694385
116	NC_021193	AGC	2	6	6049	6054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694385
117	NC_021193	GGC	2	6	6169	6174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694385
118	NC_021193	GC	3	6	6197	6202	0 %	0 %	50 %	50 %	494694385
119	NC_021193	GGT	2	6	6210	6215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694385
120	NC_021193	AAGGAC	2	12	6247	6258	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	494694385
121	NC_021193	AGACCA	2	12	6341	6352	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	494694385
122	NC_021193	GCG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694385
123	NC_021193	CGGC	2	8	6617	6624	0 %	0 %	50 %	50 %	494694385
124	NC_021193	ATC	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494694385
125	NC_021193	GC	3	6	6703	6708	0 %	0 %	50 %	50 %	494694385
126	NC_021193	ATC	2	6	6745	6750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494694385
127	NC_021193	ACG	2	6	6773	6778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694385
128	NC_021193	TGT	2	6	6860	6865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694385
129	NC_021193	GTT	3	9	6870	6878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694385
130	NC_021193	CCG	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694385
131	NC_021193	CTG	2	6	7000	7005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694385
132	NC_021193	GAA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494694385
133	NC_021193	CAA	2	6	7035	7040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494694385
134	NC_021193	ACC	2	6	7102	7107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694385
135	NC_021193	GT	3	6	7124	7129	0 %	50 %	50 %	0 %	494694385
136	NC_021193	GAC	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694385
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138	NC_021193	GTT	2	6	7170	7175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694385
139	NC_021193	CG	3	6	7203	7208	0 %	0 %	50 %	50 %	494694385
140	NC_021193	GACA	2	8	7297	7304	50 %	0 %	25 %	25 %	494694386
141	NC_021193	GCC	2	6	7312	7317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694386
142	NC_021193	GAC	2	6	7319	7324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694386
143	NC_021193	CAG	2	6	7355	7360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694386
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147	NC_021193	CGGT	2	8	7517	7524	0 %	25 %	50 %	25 %	494694386
148	NC_021193	ACC	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694386
149	NC_021193	TGG	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694386
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156	NC_021193	ACG	2	6	7917	7922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694386
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169	NC_021193	GCT	2	6	8563	8568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694386
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244	NC_021193	ACG	2	6	12648	12653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694394
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246	NC_021193	CGA	2	6	12745	12750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694394
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248	NC_021193	GGT	2	6	12970	12975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694394
249	NC_021193	CAG	2	6	13207	13212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694395
250	NC_021193	C	6	6	13213	13218	0 %	0 %	0 %	100 %	494694395
251	NC_021193	GGC	2	6	13251	13256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694395
252	NC_021193	TCG	2	6	13271	13276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694395
253	NC_021193	GAT	2	6	13282	13287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494694395
254	NC_021193	AACC	2	8	13322	13329	50 %	0 %	0 %	50 %	494694395
255	NC_021193	GC	3	6	13373	13378	0 %	0 %	50 %	50 %	494694395
256	NC_021193	CCCG	2	8	13431	13438	0 %	0 %	25 %	75 %	494694395
257	NC_021193	TGC	2	6	13535	13540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694395
258	NC_021193	CAA	2	6	13719	13724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494694396
259	NC_021193	AAC	2	6	13870	13875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494694396
260	NC_021193	ACCTTC	2	12	13903	13914	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	494694396
261	NC_021193	TTC	2	6	13951	13956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494694396
262	NC_021193	GAC	2	6	14016	14021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694397
263	NC_021193	ACCC	2	8	14082	14089	25 %	0 %	0 %	75 %	494694398
264	NC_021193	GA	3	6	14110	14115	50 %	0 %	50 %	0 %	494694398
265	NC_021193	TGAT	2	8	14119	14126	25 %	50 %	25 %	0 %	494694398
266	NC_021193	GGCGT	2	10	14138	14147	0 %	20 %	60 %	20 %	494694398
267	NC_021193	TGCT	2	8	14166	14173	0 %	50 %	25 %	25 %	494694398
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270	NC_021193	GGC	2	6	14211	14216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694398
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272	NC_021193	ACC	2	6	14313	14318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694398
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274	NC_021193	GCG	2	6	14372	14377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694398
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282	NC_021193	CGC	2	6	14669	14674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694398
283	NC_021193	CGC	3	9	14684	14692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694398
284	NC_021193	GCT	2	6	14700	14705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694398
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288	NC_021193	ACC	2	6	14998	15003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694399
289	NC_021193	GCC	2	6	15018	15023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694399
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292	NC_021193	CA	3	6	15121	15126	50 %	0 %	0 %	50 %	494694399
293	NC_021193	GCGTT	2	10	15166	15175	0 %	40 %	40 %	20 %	494694399
294	NC_021193	CAG	2	6	15221	15226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694399
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498	NC_021193	GGCAA	2	10	29257	29266	40 %	0 %	40 %	20 %	494694409
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500	NC_021193	GC	3	6	29316	29321	0 %	0 %	50 %	50 %	494694409

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