MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021192	GGC	2	6	228332	228337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690854
3502	NC_021192	GCT	2	6	228353	228358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690854
3503	NC_021192	CGT	2	6	228373	228378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690854
3504	NC_021192	CGG	2	6	228382	228387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690854
3505	NC_021192	G	6	6	228395	228400	0 %	0 %	100 %	0 %	494690854
3506	NC_021192	GTG	2	6	228408	228413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690854
3507	NC_021192	CCGG	2	8	228491	228498	0 %	0 %	50 %	50 %	494690854
3508	NC_021192	GGT	2	6	228505	228510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690854
3509	NC_021192	TCG	2	6	228513	228518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690854
3510	NC_021192	TGG	2	6	228555	228560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690854
3511	NC_021192	TCG	2	6	230992	230997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690855
3512	NC_021192	CGA	2	6	231005	231010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690855
3513	NC_021192	CAA	2	6	231071	231076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690855
3514	NC_021192	CG	3	6	231385	231390	0 %	0 %	50 %	50 %	494690856
3515	NC_021192	TCG	2	6	231421	231426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690856
3516	NC_021192	GAA	2	6	231428	231433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690856
3517	NC_021192	GAT	2	6	231506	231511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690856
3518	NC_021192	GATC	2	8	231515	231522	25 %	25 %	25 %	25 %	494690856
3519	NC_021192	CGT	2	6	231524	231529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690856
3520	NC_021192	GGC	2	6	231596	231601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690856
3521	NC_021192	GC	3	6	231680	231685	0 %	0 %	50 %	50 %	494690856
3522	NC_021192	GAG	2	6	231738	231743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690856
3523	NC_021192	TTG	2	6	231744	231749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690856
3524	NC_021192	CCG	2	6	231775	231780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690856
3525	NC_021192	CAG	2	6	231813	231818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690856
3526	NC_021192	GCT	2	6	231854	231859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690856
3527	NC_021192	TCG	2	6	231909	231914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690856
3528	NC_021192	TAT	2	6	231968	231973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494690856
3529	NC_021192	GTG	2	6	231996	232001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690856
3530	NC_021192	GAG	2	6	232005	232010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690856
3531	NC_021192	ACC	2	6	232753	232758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690857
3532	NC_021192	CG	3	6	232794	232799	0 %	0 %	50 %	50 %	494690857
3533	NC_021192	CGG	2	6	232930	232935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690857
3534	NC_021192	CGC	2	6	232985	232990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690857
3535	NC_021192	CGA	2	6	233024	233029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3536	NC_021192	CGT	2	6	233039	233044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3537	NC_021192	ACTT	2	8	233066	233073	25 %	50 %	0 %	25 %	494690857
3538	NC_021192	CGA	2	6	233074	233079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3539	NC_021192	CGC	2	6	233126	233131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690857
3540	NC_021192	CCG	2	6	233135	233140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690857
3541	NC_021192	CTGCG	2	10	233227	233236	0 %	20 %	40 %	40 %	494690857
3542	NC_021192	CGG	2	6	233325	233330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690857
3543	NC_021192	CGG	2	6	233353	233358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690857
3544	NC_021192	GAA	2	6	233406	233411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690857
3545	NC_021192	CAG	2	6	233481	233486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3546	NC_021192	GCCC	2	8	233498	233505	0 %	0 %	25 %	75 %	494690857
3547	NC_021192	CGA	2	6	233567	233572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3548	NC_021192	CG	3	6	233576	233581	0 %	0 %	50 %	50 %	494690857
3549	NC_021192	GCGG	2	8	233619	233626	0 %	0 %	75 %	25 %	494690857
3550	NC_021192	TCG	3	9	233641	233649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3551	NC_021192	CCA	2	6	233652	233657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690857
3552	NC_021192	GCCGTC	2	12	233670	233681	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	494690857
3553	NC_021192	TCG	2	6	233698	233703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3554	NC_021192	CCG	2	6	233741	233746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690857
3555	NC_021192	GGC	2	6	233752	233757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690857
3556	NC_021192	TCG	2	6	233759	233764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3557	NC_021192	TGG	2	6	233782	233787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690857
3558	NC_021192	GTA	2	6	233832	233837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690857
3559	NC_021192	TCG	2	6	233869	233874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3560	NC_021192	GTC	2	6	233952	233957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3561	NC_021192	AGT	2	6	233978	233983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690857
3562	NC_021192	GC	3	6	234038	234043	0 %	0 %	50 %	50 %	494690857
3563	NC_021192	GCG	2	6	234056	234061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690857
3564	NC_021192	ATCCA	2	10	234064	234073	40 %	20 %	0 %	40 %	494690857
3565	NC_021192	GCTGAT	2	12	234078	234089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494690857
3566	NC_021192	CCT	2	6	234098	234103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494690857
3567	NC_021192	CCA	2	6	234113	234118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690857
3568	NC_021192	CGG	2	6	234144	234149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690857
3569	NC_021192	CCA	2	6	234200	234205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690857
3570	NC_021192	GCT	2	6	234236	234241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3571	NC_021192	CAC	2	6	234545	234550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690857
3572	NC_021192	CGA	2	6	234586	234591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3573	NC_021192	CGG	2	6	234682	234687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690857
3574	NC_021192	GTA	2	6	234703	234708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690857
3575	NC_021192	TCG	2	6	234713	234718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690857
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3577	NC_021192	GCG	2	6	234836	234841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690857
3578	NC_021192	GCC	2	6	234860	234865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690857
3579	NC_021192	TCG	2	6	234883	234888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690857
3580	NC_021192	GC	3	6	234907	234912	0 %	0 %	50 %	50 %	494690857
3581	NC_021192	TGCGC	2	10	234955	234964	0 %	20 %	40 %	40 %	494690857
3582	NC_021192	CCTC	2	8	237062	237069	0 %	25 %	0 %	75 %	494690858
3583	NC_021192	CGC	2	6	237101	237106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690858
3584	NC_021192	ACCA	2	8	237187	237194	50 %	0 %	0 %	50 %	494690858
3585	NC_021192	CCAT	2	8	237204	237211	25 %	25 %	0 %	50 %	494690858
3586	NC_021192	GCC	2	6	237213	237218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690858
3587	NC_021192	AGT	2	6	237234	237239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690858
3588	NC_021192	CAGC	2	8	237250	237257	25 %	0 %	25 %	50 %	494690858
3589	NC_021192	CGG	3	9	237262	237270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690858
3590	NC_021192	GCT	2	6	237320	237325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690858
3591	NC_021192	GTC	2	6	237417	237422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690858
3592	NC_021192	GCC	2	6	237436	237441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690858
3593	NC_021192	GCCC	2	8	237452	237459	0 %	0 %	25 %	75 %	494690858
3594	NC_021192	C	7	7	237472	237478	0 %	0 %	0 %	100 %	494690858
3595	NC_021192	GGT	2	6	237488	237493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690858
3596	NC_021192	CGAC	2	8	237816	237823	25 %	0 %	25 %	50 %	494690859
3597	NC_021192	GCCA	2	8	237836	237843	25 %	0 %	25 %	50 %	494690859
3598	NC_021192	ACC	2	6	237852	237857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690859
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3601	NC_021192	CACGC	2	10	237939	237948	20 %	0 %	20 %	60 %	494690859
3602	NC_021192	GCG	2	6	237970	237975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690859
3603	NC_021192	GC	4	8	238029	238036	0 %	0 %	50 %	50 %	494690859
3604	NC_021192	TCGA	2	8	238174	238181	25 %	25 %	25 %	25 %	494690859
3605	NC_021192	GGC	3	9	238247	238255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690859
3606	NC_021192	CAG	2	6	238262	238267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690859
3607	NC_021192	TCA	2	6	238270	238275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690859
3608	NC_021192	CAA	2	6	238316	238321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690859
3609	NC_021192	ACCAGC	2	12	238348	238359	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	494690859
3610	NC_021192	GTC	2	6	238380	238385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690859
3611	NC_021192	CCG	2	6	238411	238416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690859
3612	NC_021192	GTC	2	6	238536	238541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690860
3613	NC_021192	ACG	2	6	238569	238574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690860
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3615	NC_021192	CCG	2	6	238641	238646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690860
3616	NC_021192	GC	3	6	238681	238686	0 %	0 %	50 %	50 %	494690860
3617	NC_021192	GGCCGC	2	12	238703	238714	0 %	0 %	50 %	50 %	494690860
3618	NC_021192	GCA	2	6	238753	238758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690860
3619	NC_021192	GCC	2	6	238792	238797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690860
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3621	NC_021192	GCC	2	6	238819	238824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690860
3622	NC_021192	CACC	2	8	238852	238859	25 %	0 %	0 %	75 %	494690860
3623	NC_021192	GCT	2	6	242121	242126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690861
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3732	NC_021192	GC	3	6	248885	248890	0 %	0 %	50 %	50 %	494690865
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3740	NC_021192	GAC	2	6	249204	249209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690865
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3742	NC_021192	CGG	2	6	249672	249677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690866
3743	NC_021192	ACG	2	6	249712	249717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690866
3744	NC_021192	TGG	2	6	249790	249795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690866
3745	NC_021192	TGG	2	6	249829	249834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690866
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3747	NC_021192	CG	3	6	249882	249887	0 %	0 %	50 %	50 %	494690866
3748	NC_021192	GTG	2	6	249903	249908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690866
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3761	NC_021192	CGA	2	6	250429	250434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690866
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3766	NC_021192	CG	3	6	250628	250633	0 %	0 %	50 %	50 %	494690867
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3856	NC_021192	TAC	2	6	254963	254968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690872
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3860	NC_021192	CTG	2	6	255211	255216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690873
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3862	NC_021192	CCGA	2	8	255240	255247	25 %	0 %	25 %	50 %	494690873
3863	NC_021192	GAT	2	6	255297	255302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690873
3864	NC_021192	TGGA	2	8	255322	255329	25 %	25 %	50 %	0 %	494690873
3865	NC_021192	CAC	2	6	255414	255419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690873
3866	NC_021192	CGT	2	6	255420	255425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690873
3867	NC_021192	GTCCA	2	10	255596	255605	20 %	20 %	20 %	40 %	494690873
3868	NC_021192	GAT	2	6	255618	255623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690873
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3871	NC_021192	TAC	2	6	255652	255657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690873
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3979	NC_021192	G	8	8	261903	261910	0 %	0 %	100 %	0 %	494690878
3980	NC_021192	ATCG	2	8	261916	261923	25 %	25 %	25 %	25 %	494690878
3981	NC_021192	CGG	2	6	262015	262020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690878
3982	NC_021192	GTT	2	6	262047	262052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690878
3983	NC_021192	CGGC	2	8	262053	262060	0 %	0 %	50 %	50 %	494690878
3984	NC_021192	GTCG	2	8	262138	262145	0 %	25 %	50 %	25 %	494690878
3985	NC_021192	GGT	2	6	262150	262155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690878
3986	NC_021192	GGA	2	6	262180	262185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690878
3987	NC_021192	TCG	2	6	262212	262217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690878
3988	NC_021192	TGCACA	2	12	262650	262661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494690878
3989	NC_021192	GACA	2	8	262694	262701	50 %	0 %	25 %	25 %	494690878
3990	NC_021192	CGCCAC	2	12	263308	263319	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	494690879
3991	NC_021192	CGA	2	6	263364	263369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690880
3992	NC_021192	GCT	2	6	263441	263446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690880
3993	NC_021192	TGG	2	6	263515	263520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690881
3994	NC_021192	CTGC	2	8	263523	263530	0 %	25 %	25 %	50 %	494690881
3995	NC_021192	CGA	2	6	263537	263542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690881
3996	NC_021192	CCA	2	6	263597	263602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690881
3997	NC_021192	GGC	2	6	263633	263638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690881
3998	NC_021192	GGT	2	6	263673	263678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690881
3999	NC_021192	CG	3	6	263739	263744	0 %	0 %	50 %	50 %	494690881
4000	NC_021192	CCG	2	6	263802	263807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690881

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