MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 65792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_021192	GGT	2	6	1409448	1409453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691841
21002	NC_021192	CGA	2	6	1409487	1409492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21003	NC_021192	TCG	2	6	1409512	1409517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21004	NC_021192	CAC	3	9	1409580	1409588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691841
21005	NC_021192	ATC	2	6	1409647	1409652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691841
21006	NC_021192	GGC	2	6	1409706	1409711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691841
21007	NC_021192	TCG	2	6	1409749	1409754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21008	NC_021192	CAG	2	6	1409784	1409789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21009	NC_021192	CGGC	2	8	1409843	1409850	0 %	0 %	50 %	50 %	494691841
21010	NC_021192	ACG	2	6	1409875	1409880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21011	NC_021192	TGA	2	6	1409903	1409908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691841
21012	NC_021192	GC	3	6	1409911	1409916	0 %	0 %	50 %	50 %	494691841
21013	NC_021192	GTC	2	6	1409975	1409980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21014	NC_021192	CTG	2	6	1409987	1409992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21015	NC_021192	GGC	3	9	1410005	1410013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691841
21016	NC_021192	CGC	2	6	1410038	1410043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691841
21017	NC_021192	CGG	2	6	1410049	1410054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691841
21018	NC_021192	CGG	2	6	1410082	1410087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691841
21019	NC_021192	GTC	2	6	1410132	1410137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21020	NC_021192	TCG	2	6	1410139	1410144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21021	NC_021192	CGG	2	6	1410317	1410322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691841
21022	NC_021192	CGA	2	6	1410326	1410331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691841
21023	NC_021192	TCGG	2	8	1410332	1410339	0 %	25 %	50 %	25 %	494691841
21024	NC_021192	GC	3	6	1410389	1410394	0 %	0 %	50 %	50 %	494691841
21025	NC_021192	GGC	3	9	1410420	1410428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691841
21026	NC_021192	CTC	2	6	1410442	1410447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691841
21027	NC_021192	GCC	2	6	1410547	1410552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691842
21028	NC_021192	CGG	2	6	1410620	1410625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691842
21029	NC_021192	GTC	2	6	1410655	1410660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691842
21030	NC_021192	GCG	2	6	1410661	1410666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691842
21031	NC_021192	ATC	2	6	1410715	1410720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691842
21032	NC_021192	GTC	2	6	1410721	1410726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691842
21033	NC_021192	CGG	2	6	1410750	1410755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691842
21034	NC_021192	GCG	2	6	1410757	1410762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691842
21035	NC_021192	CAA	2	6	1410766	1410771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691842
21036	NC_021192	TGG	2	6	1410798	1410803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691842
21037	NC_021192	TGG	2	6	1410853	1410858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691842
21038	NC_021192	GATCTG	2	12	1410863	1410874	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494691842
21039	NC_021192	ATCC	2	8	1410889	1410896	25 %	25 %	0 %	50 %	494691842
21040	NC_021192	GGT	2	6	1410911	1410916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691842
21041	NC_021192	GTC	2	6	1410971	1410976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691842
21042	NC_021192	TGG	2	6	1411000	1411005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691842
21043	NC_021192	CTG	2	6	1411022	1411027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691842
21044	NC_021192	TTG	2	6	1411080	1411085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691842
21045	NC_021192	GAG	2	6	1411091	1411096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691842
21046	NC_021192	TTG	2	6	1411209	1411214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691842
21047	NC_021192	CGA	2	6	1411216	1411221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691842
21048	NC_021192	GT	3	6	1411255	1411260	0 %	50 %	50 %	0 %	494691842
21049	NC_021192	CCGAGT	2	12	1411588	1411599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691843
21050	NC_021192	CGG	2	6	1411666	1411671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691843
21051	NC_021192	TGG	2	6	1411736	1411741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691843
21052	NC_021192	CGA	3	9	1411769	1411777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691843
21053	NC_021192	CTGC	2	8	1411784	1411791	0 %	25 %	25 %	50 %	494691843
21054	NC_021192	GGTT	2	8	1411802	1411809	0 %	50 %	50 %	0 %	494691843
21055	NC_021192	CCT	2	6	1411820	1411825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691843
21056	NC_021192	CGC	2	6	1411847	1411852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691843
21057	NC_021192	CTT	2	6	1411860	1411865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691843
21058	NC_021192	GAG	2	6	1411903	1411908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691843
21059	NC_021192	CGG	2	6	1411967	1411972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691843
21060	NC_021192	CGG	2	6	1411976	1411981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691843
21061	NC_021192	GGC	3	9	1412000	1412008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691843
21062	NC_021192	GTG	2	6	1412019	1412024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691843
21063	NC_021192	CG	3	6	1412027	1412032	0 %	0 %	50 %	50 %	494691843
21064	NC_021192	G	6	6	1412108	1412113	0 %	0 %	100 %	0 %	494691843
21065	NC_021192	CAA	2	6	1412129	1412134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691843
21066	NC_021192	CTT	2	6	1412135	1412140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691843
21067	NC_021192	CGA	2	6	1412231	1412236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691843
21068	NC_021192	ACC	2	6	1412251	1412256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691843
21069	NC_021192	TCG	2	6	1412279	1412284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691843
21070	NC_021192	TCGC	2	8	1412336	1412343	0 %	25 %	25 %	50 %	494691843
21071	NC_021192	AGC	2	6	1412350	1412355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691843
21072	NC_021192	GCGG	2	8	1412405	1412412	0 %	0 %	75 %	25 %	494691843
21073	NC_021192	TGC	2	6	1412462	1412467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691843
21074	NC_021192	CGC	2	6	1412474	1412479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691843
21075	NC_021192	CGT	2	6	1412608	1412613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691844
21076	NC_021192	CGA	2	6	1412773	1412778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691844
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21078	NC_021192	C	7	7	1413087	1413093	0 %	0 %	0 %	100 %	494691845
21079	NC_021192	AG	3	6	1413147	1413152	50 %	0 %	50 %	0 %	494691845
21080	NC_021192	CGT	2	6	1413182	1413187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691845
21081	NC_021192	TGG	2	6	1413223	1413228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691845
21082	NC_021192	CCG	2	6	1413327	1413332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691846
21083	NC_021192	CG	3	6	1413339	1413344	0 %	0 %	50 %	50 %	494691846
21084	NC_021192	CAG	2	6	1413351	1413356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691846
21085	NC_021192	CAG	2	6	1413372	1413377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691846
21086	NC_021192	CAG	2	6	1413390	1413395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691846
21087	NC_021192	CAT	2	6	1413411	1413416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691846
21088	NC_021192	CCA	2	6	1413428	1413433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691846
21089	NC_021192	GCTG	2	8	1413455	1413462	0 %	25 %	50 %	25 %	494691846
21090	NC_021192	CGA	2	6	1413477	1413482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691846
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21096	NC_021192	CAG	3	9	1415309	1415317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691847
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21098	NC_021192	ATG	2	6	1415349	1415354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691847
21099	NC_021192	CCG	2	6	1415358	1415363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691847
21100	NC_021192	CGGTG	2	10	1415375	1415384	0 %	20 %	60 %	20 %	494691847
21101	NC_021192	TGG	2	6	1415635	1415640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691848
21102	NC_021192	CGT	2	6	1415662	1415667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691848
21103	NC_021192	CGA	2	6	1415668	1415673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691848
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21105	NC_021192	GCA	2	6	1415725	1415730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691848
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21107	NC_021192	CGG	2	6	1415751	1415756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691848
21108	NC_021192	GCA	2	6	1415776	1415781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691848
21109	NC_021192	TGC	2	6	1415819	1415824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691848
21110	NC_021192	GCG	2	6	1415943	1415948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691848
21111	NC_021192	TGG	2	6	1415984	1415989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691848
21112	NC_021192	CGG	2	6	1415999	1416004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691848
21113	NC_021192	ACA	2	6	1416029	1416034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691848
21114	NC_021192	CGA	2	6	1416044	1416049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691848
21115	NC_021192	CTT	2	6	1416089	1416094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691848
21116	NC_021192	G	11	11	1416192	1416202	0 %	0 %	100 %	0 %	494691848
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21119	NC_021192	G	7	7	1416583	1416589	0 %	0 %	100 %	0 %	494691849
21120	NC_021192	CAA	2	6	1416603	1416608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691849
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21125	NC_021192	CG	3	6	1416850	1416855	0 %	0 %	50 %	50 %	494691849
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21128	NC_021192	TGG	2	6	1416940	1416945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691849
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21130	NC_021192	GC	4	8	1417055	1417062	0 %	0 %	50 %	50 %	494691849
21131	NC_021192	CG	3	6	1417100	1417105	0 %	0 %	50 %	50 %	494691850
21132	NC_021192	GCG	2	6	1417294	1417299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691850
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21139	NC_021192	GC	3	6	1417540	1417545	0 %	0 %	50 %	50 %	494691850
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21143	NC_021192	GTC	3	9	1417719	1417727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691850
21144	NC_021192	CGC	2	6	1417736	1417741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691850
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21146	NC_021192	GGC	2	6	1417871	1417876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691850
21147	NC_021192	CCG	2	6	1417884	1417889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691850
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21151	NC_021192	GTC	2	6	1418171	1418176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691850
21152	NC_021192	CTG	2	6	1418221	1418226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691850
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21162	NC_021192	GCA	2	6	1418591	1418596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691850
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21164	NC_021192	CGA	2	6	1418640	1418645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691850
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21224	NC_021192	ACG	2	6	1421148	1421153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691852
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21227	NC_021192	CGC	2	6	1421254	1421259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691852
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21229	NC_021192	CG	3	6	1421269	1421274	0 %	0 %	50 %	50 %	494691852
21230	NC_021192	CCGGGC	2	12	1421284	1421295	0 %	0 %	50 %	50 %	494691852
21231	NC_021192	GCT	2	6	1421302	1421307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691852
21232	NC_021192	ACC	2	6	1421336	1421341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691852
21233	NC_021192	TCGGC	2	10	1421380	1421389	0 %	20 %	40 %	40 %	494691852
21234	NC_021192	TCGAGG	2	12	1421412	1421423	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	494691852
21235	NC_021192	GAC	2	6	1421459	1421464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691852
21236	NC_021192	CGGG	2	8	1421490	1421497	0 %	0 %	75 %	25 %	494691852
21237	NC_021192	CGT	2	6	1421779	1421784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691853
21238	NC_021192	ACG	2	6	1421843	1421848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691853
21239	NC_021192	GTG	2	6	1421849	1421854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691853
21240	NC_021192	GCG	2	6	1421901	1421906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691853
21241	NC_021192	AACCG	2	10	1421948	1421957	40 %	0 %	20 %	40 %	494691853
21242	NC_021192	TCG	2	6	1422015	1422020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691853
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21245	NC_021192	GAC	2	6	1422164	1422169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691854
21246	NC_021192	TGGC	2	8	1422233	1422240	0 %	25 %	50 %	25 %	494691854
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21248	NC_021192	GGT	2	6	1422417	1422422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691854
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21253	NC_021192	ATC	2	6	1422628	1422633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691854
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21260	NC_021192	CG	3	6	1423062	1423067	0 %	0 %	50 %	50 %	494691855
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21277	NC_021192	GC	3	6	1424142	1424147	0 %	0 %	50 %	50 %	494691856
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21291	NC_021192	CGT	2	6	1424710	1424715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691856
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21329	NC_021192	GCC	2	6	1425998	1426003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691857
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21335	NC_021192	CG	3	6	1426341	1426346	0 %	0 %	50 %	50 %	494691857
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21339	NC_021192	CCGAA	2	10	1426737	1426746	40 %	0 %	20 %	40 %	494691857
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21343	NC_021192	CCA	2	6	1426821	1426826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691857
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21345	NC_021192	CTG	2	6	1426959	1426964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691857
21346	NC_021192	CGG	2	6	1427114	1427119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691857
21347	NC_021192	GGC	3	9	1427165	1427173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691857
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21458	NC_021192	CGT	2	6	1438852	1438857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691864
21459	NC_021192	AT	3	6	1438882	1438887	50 %	50 %	0 %	0 %	494691864
21460	NC_021192	CTA	2	6	1438903	1438908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691864
21461	NC_021192	GGCCGC	2	12	1438990	1439001	0 %	0 %	50 %	50 %	494691864
21462	NC_021192	GAC	2	6	1439012	1439017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691864
21463	NC_021192	CGA	2	6	1439116	1439121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691864
21464	NC_021192	CGC	2	6	1439146	1439151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691864
21465	NC_021192	CTC	2	6	1439170	1439175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691864
21466	NC_021192	ATCGAC	2	12	1439189	1439200	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	494691864
21467	NC_021192	CGAA	2	8	1439223	1439230	50 %	0 %	25 %	25 %	494691864
21468	NC_021192	CGC	2	6	1439287	1439292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691864
21469	NC_021192	ACC	2	6	1439319	1439324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691864
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21471	NC_021192	GCT	2	6	1439356	1439361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691865
21472	NC_021192	CGA	2	6	1439497	1439502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691865
21473	NC_021192	CG	3	6	1439524	1439529	0 %	0 %	50 %	50 %	494691865
21474	NC_021192	ATC	2	6	1439579	1439584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691865
21475	NC_021192	CACCG	2	10	1439590	1439599	20 %	0 %	20 %	60 %	494691865
21476	NC_021192	GCT	2	6	1439616	1439621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691865
21477	NC_021192	TG	3	6	1439637	1439642	0 %	50 %	50 %	0 %	494691865
21478	NC_021192	TAC	2	6	1439652	1439657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691865
21479	NC_021192	CGA	2	6	1439742	1439747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691865
21480	NC_021192	GAC	2	6	1439749	1439754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691865
21481	NC_021192	TCGC	2	8	1439757	1439764	0 %	25 %	25 %	50 %	494691865
21482	NC_021192	CCG	2	6	1439777	1439782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691865
21483	NC_021192	GCC	2	6	1439815	1439820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691865
21484	NC_021192	GAA	2	6	1439860	1439865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691865
21485	NC_021192	CAA	3	9	1439952	1439960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691865
21486	NC_021192	GTC	2	6	1440010	1440015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691865
21487	NC_021192	GCG	2	6	1440173	1440178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691865
21488	NC_021192	GCG	2	6	1440195	1440200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691865
21489	NC_021192	CGC	2	6	1440284	1440289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691865
21490	NC_021192	CGT	2	6	1440317	1440322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691866
21491	NC_021192	GGC	2	6	1440375	1440380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691866
21492	NC_021192	CGA	2	6	1440404	1440409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691866
21493	NC_021192	CCG	2	6	1440414	1440419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691866
21494	NC_021192	CGG	2	6	1440614	1440619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691867
21495	NC_021192	ACA	2	6	1440628	1440633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691867
21496	NC_021192	GC	3	6	1440652	1440657	0 %	0 %	50 %	50 %	494691867
21497	NC_021192	GC	3	6	1440688	1440693	0 %	0 %	50 %	50 %	494691867
21498	NC_021192	CCG	2	6	1440695	1440700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691867
21499	NC_021192	ATC	2	6	1440743	1440748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691867
21500	NC_021192	CGA	2	6	1440769	1440774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691867

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